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为探究早发性(15 - 39 岁)散发性结直肠癌(CRC)的基因组改变,泰国诗里拉杰医院研究人员开展研究,发现部分基因在早发性 CRC 中突变更频繁,为后续研究提供方向。
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结直肠癌新发现:早发性散发性病例的基因 “密码”
在全球范围内,癌症一直是威胁人类健康的重大疾病,而结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)更是其中的 “佼佼者”。它不仅是全球第三大常见癌症,还是癌症死亡的第二大主因,2020 年有近 100 万人因它失去生命。以往,大多数 CRC 患者被诊断出患病时年龄在 65 岁及以上,但近年来,一个令人担忧的趋势出现了 —— 早发性 CRC 患者数量不断增加,在亚洲的台湾、韩国、日本和泰国等地,每 10 万人中就有 5.4 - 12.9 人患病,且男女和不同器官部位都受到影响。
虽然目前还不完全清楚 CRC 发病率上升的确切原因,但生活方式和环境因素的改变难辞其咎。现代人的饮食越来越倾向于加工食品,肉类摄入增多而膳食纤维减少;肥胖问题日益普遍;儿童时期抗生素的大量使用破坏了肠道微生物群;再加上癌症检测年龄的提前,这些都可能与早发性 CRC 的增加有关。
此前已有研究关注早发性 CRC 患者的基因情况,但大多在西方国家开展,且主要研究对象是白种人。对于年轻的亚洲 CRC 患者,他们与 50 岁以上患者的基因差异尚不明确。因此,泰国诗里拉杰医院(Siriraj Hospital)的研究人员决定深入探究青少年和年轻成人(15 - 39 岁)患早发性 CRC 时的基因组改变,希望找到与成年患者的突变差异,为后续的治疗和研究提供新方向。这项研究成果发表在BMC Cancer期刊上。
研究人员在此次研究中主要运用了以下关键技术方法:从 90 例经组织学确诊为结直肠腺癌且错配修复功能正常的早发性 CRC 患者的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本中提取 DNA;使用 Oncomine Comprehensive Assay Plus 试剂盒,通过下一代测序(NGS)技术对 517 个基因进行突变分析;将之前研究中 108 例 II - III 期成年发病结肠癌患者的队列以及癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的结直肠癌病例作为对照;运用统计分析方法,如 Pearson 卡方检验评估早发性和成年发病病例之间基因突变的差异。
下面来看看具体的研究结果:
- 患者特征:研究最初纳入 98 例早发性 CRC 患者,但 8 例患者肿瘤组织不足,最终 90 例患者用于基因组分析。这些患者大多被诊断为 III - IV 期疾病(78%),原发性肿瘤多位于直肠乙状结肠区域(66%)。
- 基因改变情况:通过 517 个基因的全面分析,发现 APC(66%)、TP53(51%)、KRAS(47%)、ARID1A(31%)和 KMT2B(31%)是突变频率最高的前五个基因。对 22 个重点基因分析后发现,早发性 CRC 中,NOTCH1(11.1% vs. 1.9%)、FBXW7(23.3% vs. 14.8%)、PIK3CA(20% vs. 12.1%)和 FGFR3(8.9% vs. 3.7%)突变比成年发病组更普遍,其中 NOTCH1 突变差异有统计学意义。与 TCGA 数据集相比,早发性 CRC 中 FBXW7、FGFR3 和 NOTCH1 突变频率增加,NRAS、BRAF 和 ERBB4 突变较少。在 KRAS 突变方面,早发性队列中密码子 12 突变的患病率显著高于 TCGA 队列中的转移性 CRC 患者(38.9% vs. 28.1%),且 KRAS G12D 是早发性队列中最常见的变异。
在研究结论与讨论部分,研究人员发现,总体而言,早发性和成年发病 CRC 的基因组景观看似相似,但早发性 CRC 在 NOTCH1、FBXW7、PIK3CA 和 FGFR3 等基因以及 KRAS G12 突变上更为富集。这一发现意义重大,NOTCH1 突变可能与癌症的侵袭性和早期发病有关,其激活的信号通路与远处转移、治疗抵抗和不良生存相关;FBXW7 作为肿瘤抑制基因,其突变可能导致治疗抵抗;这些基因有望成为潜在的治疗靶点和预后标志物。
不过,该研究也存在一些局限性。样本量有限,可能无法充分检测出关联和差异的统计学意义;与成年发病队列的数据比较仅针对 22 个基因,可能遗漏其他重要的基因组改变;研究未考虑测序面板外的基因突变、融合和拷贝数变异。但这仍是为数不多专门聚焦早发性散发性 CRC 的研究,排除了遗传亚型基因组数据的潜在偏差。
此次研究为早发性散发性 CRC 的研究开辟了新道路,尽管前路仍有许多未知,但它为后续更大规模的研究奠定了基础,有助于进一步了解早发性 CRC 的发病机制,为开发更精准有效的治疗方法提供了可能。相信在未来,随着研究的不断深入,人类将逐渐揭开早发性 CRC 的神秘面纱,找到更多对抗这一疾病的有力武器。