突破传统:无需动物存活的测序筛选法揭秘 EGF 信号缺失致死抑制突变

【字体: 时间:2025年02月26日 来源:Science Signaling 6.7

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  为解决传统抑制子筛选需突变体存活可育的局限问题,研究人员开展基于基因组测序筛选抑制突变的研究。结果鉴定出 11 个可减轻 LET-23 缺失致死性的基因。该方法突破局限,或适用于其他生物,值得一读。

  

编辑总结


对突变表型抑制子进行遗传筛选是识别信号通路组成部分的重要工具。施瓦茨(Schwartz)和斯特恩伯格(Sternberg)开发了一种基于基因组测序的筛选方法,该方法无需获得存活的动物。通过这种方法,他们鉴定出了部分抑制秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans )中表皮生长因子受体同源物 LET-23 缺失所导致致死性的突变。这些抑制性突变包括影响编码小 GTP 酶 Rho 调节因子的基因,以及编码抵御 DNA 损伤的核蛋白的基因。这种方法可用于筛选仅在部分组织中抑制表型,但无法完全恢复功能以获得可育成虫的修饰因子。—— 安娜丽莎?M?范胡克(Annalisa M. VanHook)

摘要


抑制子筛选能够识别生化途径的遗传修饰因子,但通常要求被抑制的突变体具有活力和生育能力。施瓦茨(Schwartz)和斯特恩伯格(Sternberg)开发了一种筛选方法,该方法无需满足这一要求,并且能够鉴定出部分抑制秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans )中表皮生长因子(EGF)受体直系同源物 LET-23 缺失所导致的早期发育停滞和致死性的突变。他们用化学方法诱变携带功能缺失等位基因let-23( sy15) 的线虫,分离出逃脱早期发育停滞但仍然无法存活的let-23( sy15) 纯合子,并对其基因组进行测序。对候选致病突变的测试确定了 11 个基因,这些基因发生突变时,能够减轻因 EGF 信号缺失导致的早期致死性。其中包括编码小 GTP 酶(GTPase)Ras(let-60)的同源物的基因,Ras 是 LET-23 的下游效应因子;还包括编码小 GTP 酶 Rho 调节因子的基因,如磷酸酪氨酸结合蛋白张力蛋白(TENSIN)的同源物(tns-1)。他们还发现了编码抵御 DNA 损伤的核蛋白的基因中的抑制性突变,如 MutS 同源物 4(MutS homolog 4)的同源物(him-14)。遗传学实验表明,抑制 Rho 活性或激活 DNA 损伤反应可以补偿 EGF 信号的缺失。这种基于测序的全动物筛选方法可能适用于其他生物,有助于鉴定那些因表型而无法获得存活动物的突变。

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