快速长读长基因组测序助力危重症患儿病因诊断:新突破
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时间:2025年02月28日
来源:European Journal of Human Genetics 3.7
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为诊断病因不明的 ICU 危重症患儿,泰国研究人员开展 rLR-GS 研究,诊断率 61%,助力诊疗。
在重症监护病房(ICU)中,对于病因不明的儿科患者而言,及时进行基因检测至关重要。研究旨在探索单样本快速长读长基因组测序(rLR-GS)对入住 ICU 且疑似存在遗传病因的危重症患儿的诊断价值。研究纳入了 2023 年 8 月至 2024 年 5 月泰国两家三级医院收治的、年龄小于 18 岁且疑似遗传病因的 ICU 患儿,并对其进行了 rLR-GS 检测,评估分子诊断对改变患者治疗结果的价值。研究共招募了 18 名患者,单样本 rLR-GS 检测识别出 17 个可能致病(LP)或致病(P)的变异,确诊了 11 种不同的遗传性疾病,其遗传模式包括常染色体隐性遗传、常染色体显性遗传和线粒体遗传。这使得诊断率达到 61%(11/18) ,中位周转时间为 9 天。具体来说,rLR-GS 检测识别出 3 个致病性结构变异(SVs),包括 19kb、2.4kb 和 10.1kb 的大片段缺失。此外,对于 6 名患有常染色体隐性疾病的患者,rLR-GS 检测还为他们各自的两个变异提供了相位信息。而且,两个 SVs 的识别和相位信息使得三名患者各自的一个单核苷酸变异(SNV)从不明意义变异(VUS)重新分类为可能致病(LP)变异。rLR-GS 的应用显著改变了所有 11 名确诊患者的治疗方案。这项概念验证研究表明,单样本 rLR-GS 作为病因不明的危重症患者的一线诊断方法具有重要价值。
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