Nirmala指数桥接分子连接性与遗传稳定性:嘌呤与嘧啶的图论视角

《BioSystems》:Nirmala indices bridge molecular connectivity and genetic stability: A graph-theoretic lens on purines and pyrimidines

【字体: 时间:2026年01月09日 来源:BioSystems 1.9

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  本文创新性地运用图论中的Nirmala指数(N(G))及其逆变体(IN1(G)和IN2(G)),系统量化了嘌呤与嘧啶类核苷碱基的分子拓扑结构。研究通过建立极值度理论边界,揭示了嘌呤因双环结构呈现更高度异质性(IN1(G)趋近下界),而嘧啶单环结构则表现出显著度规律性(IN2(G)逼近上界)。该指数体系为连接分子拓扑(QSAR/QSPR)与遗传稳定性提供了新型数学桥梁,在化学信息学和核酸系统分析中具应用潜力。

  
亮点
嘌呤与嘧啶的对比分析
嘌呤(腺嘌呤和鸟嘌呤)与嘧啶(胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶)之间呈现出显著的结构差异。嘌呤因其融合双环拓扑展现出更大的度异质性,导致其逆Nirmala指数IN1(G)值更接近理论下界;而嘧啶类则因单环结构呈现更高规律性,使得IN2(G)值逼近理论上界。这种度敏感的量化有效捕捉了嘌呤与嘧啶框架的结构不对称性、键合规律性及内在稳定性。
结论
本研究通过Nirmala指数N(G)及其逆变体IN1(G)、IN2(G),建立了分析五种经典核苷碱基分子图的严谨图论框架。通过以最小度δ(G)和最大度Δ(G)为参数的极值定理,我们构建了量化生物分子图结构规律性与异质性的分析基础。显式计算表明:嘌呤的度异质性使其N(G)值更大,而嘧啶的规律性使逆指数更接近理论上界。这些指数通过度分布有效映射了核苷碱基的结构特征,为化学信息学、定量构效关系(QSAR/QSPR)建模及核酸系统分析提供了新的描述符工具。
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