硼基B8Ca3团簇的双重芳香性与动态结构流变性:一种新型纳米罗盘的化学键合机制

《Respiratory Physiology & Neurobiology》:Chemical bonding and structural fluxionality of a boron-based B 8Ca 3 cluster

【字体: 时间:2026年01月12日 来源:Respiratory Physiology & Neurobiology 1.6

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  本研究针对硼团簇动态结构调控难题,通过理论计算设计了中性B8Ca3三元团簇,发现其具有独特的"纳米罗盘"功能:Ca-Ca二聚体可在B8分子轮上实现近零能垒旋转。化学键分析揭示体系存在6π/6σ双重芳香性,为开发硼基分子转子提供了新思路。

  
在纳米科技飞速发展的今天,分子级功能器件的设计已成为前沿研究热点。其中,具有定向运动能力的分子转子(molecular rotor)因其在纳米机器(nanomachines)和分子马达(molecular motor)领域的应用前景而备受关注。硼团簇(boron clusters)由于其独特的电子缺陷特性和多样的键合方式,展现出丰富的结构多样性和动态行为,成为构建分子转子的理想平台。然而,如何实现团簇结构在动态过程中的精确调控,同时保持其稳定性,仍是该领域面临的重大挑战。
过去三十年的研究表明,硼团簇可在较大尺寸范围内保持平面或准平面结构,其π/σ键合框架具有电子离域特性,不仅产生多种芳香性(包括反芳香性、多重芳香性和冲突芳香性),还赋予团簇动态结构流变性(dynamic structural fluxionality)。这种独特的动态行为源于硼的电子缺陷特性,已在B19-、B13+、B182-等纯硼团簇中得到证实。通过金属掺杂调控硼团簇的电子计数和动态特性已成为有效策略,如Mg2B8团簇被设计为"纳米罗盘",其中Mg2针可在B8基底上自由旋转。
在这项发表于《Respiratory Physiology》的研究中,吕梁大学化学与材料工程系的研究团队通过量子化学计算,揭示了B8Ca3团簇的独特性质。该团簇采用稳定的三层三明治结构:中间为准平面B8分子轮,上方为Ca-Ca二聚体,下方为单个Ca原子。令人惊讶的是,该团簇表现出显著的动态流变性,功能类似"纳米罗盘",其中B8轮作为定子,Ca-Ca二聚体作为可旋转的指针。
为开展此项研究,作者主要采用了以下关键技术方法:使用Coalescence Kick(CK)算法进行全局最小结构搜索;采用PBE0/def2-TZVP和B3LYP/def2-TZVP等多层次理论方法进行几何优化和频率计算;通过自然键轨道(NBO)、正则分子轨道(CMO)和自适应自然密度划分(AdNDP)分析化学键合;利用核无关化学位移(NICS)和等化学屏蔽表面(ICSS)评估芳香性;运用玻恩-奥本海默分子动力学(BOMD)模拟室温下的动态行为。

2.1. 全局最小结构

研究人员通过系统性势能面搜索发现,B8Ca3团簇的全局最小(GM)结构为Cs1A)构型,具有明确的能量优势。PBE0计算显示其稳定性比最近竞争异构体高0.51 kcal·mol-1,CCSD(T)//PBE0水平计算的能量差为2.05 kcal·mol-1。空间构型上,GM结构呈现清晰的三层分布:中间层为B8分子轮,上方为Ca-Ca二聚体,下方为孤立Ca单元。B8分子轮并非完美平面结构,表面B2468原子存在2.39°的偏离角。
与体系动态流变性相关的过渡态(TS)Cs1A)结构显示,Ca-Ca二聚体相对于B8分子发生约25.7°的切向旋转。PBE0水平下GM和TS结构的最低振动频率分别为31.39 cm-1和32.78i cm-1,B3LYP方法计算的结果分别为20.48 cm-1和21.52i cm-1,证实了GM和TS的特征。

2.2. 键长、维伯格键级和自然原子电荷

GM结构的键长分析显示,B8轮外围B-B键长均匀(1.54-1.59 ?),表现出部分双键特征;径向B-B键则不均匀(1.77-1.96 ?)。下方Ca原子与最近B原子的距离为2.64 ?,键级为0.18,表明共价成分较小。值得注意的是,硼环上方的两个Ca原子间距为3.37 ?,键级接近1(0.89),实为共价单键。
自然原子电荷分析表明,硼环上方的两个Ca原子各带+0.90 |e|电荷,下方Ca原子带+1.51 |e|电荷,而B位点电荷在-0.31至-0.59 |e|之间。这种一致的电荷分布模式表明团簇内电荷转移是局域现象。TS结构的键长、维伯格键级和自然原子电荷与GM结构高度相似,两者均可描述为电荷转移复合物[Ca-Ca]2+[B8]4-[Ca]2+

3.1. 动态结构流变性

B8Ca3团簇的动态结构流变性演化过程显示,在初始GM结构(GM1)中,B环上方的Ca2单元与径向B3-B4键重叠。当Ca2单元相对于分子轮顺时针旋转25.7°时,团簇进入过渡态(TS1),此时Ca9原子与B4原子重叠。继续旋转25.7°后,体系返回另一个GM结构(GM2)。整个旋转过程路径清晰,能垒极低。
GM团簇的振动频率分析发现,PBE0能级存在31.39 cm-1的软模式,这是体系中关键的低温旋转模式,表现为Ca2二聚体的切向运动与B8分子轮的协同反旋转。TS结构也存在类似的32.78i cm-1软模式,这些软振动模式与分子转子系统的动态结构运动完全一致。
300 K下的BOMD模拟显示,该二元团簇在亚纳米尺度上表现得非常像一个功能罗盘。罗盘的Ca2指针几乎在圆盘B8的基底上自由切向旋转。值得注意的是,B8分子环下方的钙原子通过电荷转移稳定了分子环,在BOMD模拟中,Ca2+基本保持静止。

3.2. 化学键合

对GM B8Ca3团簇的全面化学键合分析对于理解其稳定性、结构和动态流变性至关重要。该体系具有30个价电子,CMO分析显示轨道可分为5个子集:子集(a)为Lewis型Ca11-Ca9 σ单键;子集(b)为垂直于硼环平面的离域σ键;子集(c)包含7个CMO,沿B8轮外围形成7个Lewis型双中心双电子(2c-2e)σ键,利用14个电子形成团簇的结构骨架;子集(d)显示π骨架具有3个CMO,整体模式与苯的六聚体非常相似;子集(e)显示σ芳香性,具有匹配的6σ电子数。
AdNDP分析结果与上述键合图像完全一致,恢复了沿B环的Lewis骨架2c-2e B-B σ单键、二聚体中的Ca-Ca σ键、垂直于B8分子轮平面的离域σ键以及B8分子轮的6π/6σ离域骨架。TS结构的CMO和AdNDP方案几乎不变,这解释了动态流变性过程为何没有能垒。
对σ和π芳香性的初步评估通过ICSS计算进行。GM B8Ca3团簇的ICSSzz(0)和ICSSzz(1)值显示,轮内明显的绿色/黄色屏蔽区为双重σ/π芳香性提供了直接证据。计算的NICS和NICSzz数据也支持基团的双重芳香性,B3三角形中心的强负值是σ芳香性的特征,而平面下方1 ?处的值表明π芳香性,证实了体系的6σ/6π芳香特征。
本研究在核心设计、动态机制、化学键合和应用潜力方面相较于先前报道的MgAlB8+和B8Al3+团簇具有显著创新性。B8Ca3采用中性二元体系,具有不对称三层结构,通过双向协同电荷转移(向B8轮注入四个电子),电荷转移量是前两个团簇(各-2 |e|)的两倍,显著增强了B8轮的π/σ共轭。在动态结构流变性方面,B8Ca3创新性地实现了"锚定-旋转-响应"三维协同运动,解决了MgAlB8+和B8Al3+中B8轮旋转时漂移的问题。化学上,B8Ca3通过在下部Ca原子和B8轮之间引入垂直的6c-2e σ离域键,突破了前两个团簇的平面芳香性限制,形成了具有更强电子离域的三维芳香性体系(ELF值高达0.90)。
本研究通过量子化学探索考察了硼基B8Ca3团簇的全局最小结构、化学键合和动态流变性。该团簇的三层结构可视为纳米罗盘,其中准平面B8轮作为基底。团簇的键合可通过近似离子模型来理解,描述为电荷转移复合物[Ca-Ca]2+[B8]4-[Ca]2+。BOMD模拟揭示了团簇作为纳米罗盘的功能,Ca-Ca二聚体指针定向在准平面B8分子轮基底上方。化学键分析表明该体系具有双重6π/6σ芳香性,这决定了其热力学稳定性和动态结构流变性。通过阐明B8Ca3团簇的动态行为,本研究为开发新型硼基分子转子和纳米机器铺平了道路。
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