《Biologia》：Complete nucleotide sequence of qnrS1-haboring plasmid from E. coli clinical isolate in China
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本研究针对质粒介导的喹诺酮耐药性（PMQR）基因qnrS1在中国大肠杆菌临床株中的传播机制展开。研究人员通过全基因组测序和生物信息学分析，首次报道了携带qnrS1的IncFIB接合质粒pFZ11的完整序列，发现其通过IS2-qnrS1-ISkra4模块介导耐药基因水平转移。该质粒同时携带blaCTX-M-15、tetA等多药耐药基因，且表现出高接合效率（3.5×10-5）和稳定性（30天内保留率>94%），揭示了qnrS1在临床环境中的潜在传播风险，为耐药性防控提供了关键分子依据。
喹诺酮类药物曾是治疗革兰阴性菌感染的重要武器，但随着质粒介导的喹诺酮耐药性（PMQR）基因在全球肠杆菌目细菌中扩散，治疗失败率显著上升。其中，qnrS1基因可通过保护DNA旋转酶免受药物抑制，导致氟喹诺酮类药物低水平耐药，且常与超广谱β-内酰胺酶基因（如blaCTX-M-15）共存于多耐药质粒，加剧临床抗感染治疗困境。然而，中国地区qnrS1阳性质粒的遗传结构及传播机制研究尚不充分。发表于《Biologia》的这项研究，首次揭示了来自大肠杆菌临床株的IncFIB型质粒pFZ11的完整序列特征，为理解qnrS1的传播生态提供了关键证据。
研究采用Illumina NovaSeq平台对质粒DNA进行测序，结合PCR验证和生物信息学工具（如RAST、IslandViewer 4）注释基因功能。通过接合实验评估质粒转移效率，并利用稳定性试验分析无抗生素压力下质粒的持续能力。
菌株特征与耐药表型
大肠杆菌EC84分离自福州一名患者，属于ST1312型。药敏试验显示其对头孢噻肼耐药（MIC=512 μg/mL），但对环丙沙星、亚胺培南等敏感。该菌株携带qnrS1基因，且成功接合至受体菌J53Ar，转移频率为3.5×10-5。
质粒pFZ11的遗传结构
pFZ11为79,147 bp的IncFIB型质粒，GC含量53.4%。除qnrS1外，还携带blaTEM-1、blaCTX-M-15、tetA、strA-strB、sul2及dfrA14等耐药基因。其遗传环境分析发现三个主要耐药区域：
- 1.
含dfrA14的I类整合子，两侧为Tn3样元件和IS6；
- 2.
19 kb区域聚集blaCTX-M-15（两侧为IS1380和Tn3片段）、strA-strB及tetA；
- 3.
关键IS2-qnrS1-ISkra4模块，与尼日利亚质粒pPGRT46高度相似，提示该模块可能为qnrS1跨质粒传播的核心动力。
质粒稳定性与传播风险
无抗生素压力下，pFZ15在受体菌中可稳定存在15天（100%保留），30天后仍维持94%以上。结合其高接合效率，表明该质粒具备在临床环境中持续传播的潜力。
本研究首次报道了中国地区qnrS1阳性IncFIB质粒的完整序列，揭示IS2-qnrS1-ISkra4模块在耐药基因播散中的关键作用。pFZ11的多药耐药背景及高稳定性警示其可能成为blaCTX-M-15与qnrS1共传播的载体，凸显了监测此类质粒在临床菌株中动态的必要性。未来需扩大样本量并结合功能实验，进一步验证IS元件在qnrS1 mobilization中的机制。
