《Aggregate》:Structure and Dynamics of Lipid-Stabilized Amyloid Beta Aβ1–42 Oligomers
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本研究通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)、透射电镜(TEM)、固态核磁共振(ssNMR)与分子动力学模拟(MD)相结合,首次揭示了Aβ1–42在含胆固醇脂质膜中形成的八聚体“寿司卷”结构(sushi-roll fold)。该结构具有平行交叉β折叠(cross-β)构象,内部空腔包裹脂质分子,阐明了Aβ通过脂质共组装破坏膜完整性的分子机制,为阿尔茨海默病(AD)神经毒性机制提供了新靶点。
引言
阿尔茨海默病(AD)的发生与发展与β淀粉样蛋白(Aβ)和Tau蛋白的异常聚集密切相关。其中,Aβ寡聚体(oligomers)被认为是神经毒性的主要效应物,其通过破坏细胞膜离子稳态导致突触功能障碍和神经元死亡。尽管水溶液中Aβ1–42的纤维结构已被解析,但膜环境中寡聚体的结构仍不明确。胆固醇作为细胞膜关键组分,可促进Aβ1–42的成核与聚集,而载脂蛋白E4(ApoE4)和高胆固醇血症均是AD的重要风险因素。
结果与分析
FTIR光谱揭示结构动态转变
通过FTIR监测Aβ1–42在脂质体中的构象变化,发现其随时间从初始的α螺旋结构逐渐转变为稳定的β折叠与转角/环状结构。β折叠的形成呈现双相动力学过程,快速相(τ=1.34小时)与慢速相(τ=125.6小时)共同驱动寡聚体成熟。
TEM显示膜穿孔现象
与完整脂质体对比,Aβ1–42重构的囊泡出现两种破坏模式:部分囊泡完全破裂,脂质壁如花瓣状展开;另一类囊泡膜上出现规则孔洞,其尺寸与Aβ寡聚体(约10纳米)相符。孔洞周围可见嵌于膜中的Aβ聚集颗粒,表明膜损伤可能通过脂质提取机制发生。
ssNMR解析寡聚体原子结构
通过二维13C–13C及三维NCACX/NCOCX谱,成功指认了Aβ1–42中38个残基的化学位移。Talos-N预测显示其N端含短β链,C端形成长β链。关键的是,通过3D NCACX谱检测到Ala2–Gly38、Phe4–Val39和Lys16–Ala42三对空间邻近接触,提示N端与C端空间靠近。
MD模拟构建脂质-肽共组装模型
结合化学位移约束的MD模拟表明,Aβ1–42八聚体形成平行交叉β折叠结构,内部空腔可容纳4–6个POPC分子或胆固醇。脂质填充显著稳定了寡聚体结构,其中胆固醇的稳定效果最优(β折叠占比56.5%)。八聚体可进一步通过15–23片段(QKLVFFAED)的疏水相互作用形成二聚体或三聚体,嵌入膜后仍保持稳定。
异核相关实验验证膜嵌入深度
通过抑制刚性质子信号的HETCOR实验,检测到水(1H 4.7 ppm)与脂质末端甲基(1H 1.3 ppm)向Aβ1–42的极化转移。距离拟合显示Ile/Val侧链碳与脂质链末端质子距离仅2.4–3.6 ?,而与水质子距离超过12 ?,证实寡聚体深埋于脂双层内部。
讨论与结论
本研究首次提出Aβ1–42在膜环境中通过脂质共组装形成“寿司卷”状八聚体,而非传统的水填充孔道。该结构通过盐桥(如C端与Lys16)和疏水相互作用稳定,其尺寸与膜厚度匹配,解释了脂质限制下寡聚体而非纤维形成的机制。胆固醇的高亲和性揭示了其在AD发病中的促进作用。此模型为针对Aβ-膜相互作用的治疗策略提供了结构基础,并拓展了淀粉样蛋白寡聚体研究的方法学框架。
实验方法
Aβ1–42在POPC/POPG/胆固醇(60:30:10)脂质体中重构,通过ssNMR、FTIR、TEM与MD模拟联合分析。ssNMR实验在600/800 MHz谱仪完成,MD模拟采用CHARMM36力场与REMD采样,确保模型与实验数据的一致性(化学位移偏差RMSD=1.67 ppm)。