《Respiratory Physiology & Neurobiology》:Microwave-assisted green synthesis and structural characterization of N-aryl pyrrole derivatives via Mn-catalyzed Clauson-Kaas reaction: DFT, NMR correlation, and bioactivity evaluation
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本研究针对非小细胞肺癌治疗中EGFR和CDK-2靶点抑制剂的需求,采用微波辅助锰催化Clauson-Kaas反应绿色合成了19种新型N-芳基吡咯衍生物。通过DFT计算验证了化合物3c的稳定构象(二面角300°),其与EGFR(-9.3 kcal/mol)和CDK-2(-9.3 kcal/mol)表现出优于标准药物Erlotinib的对接亲和力。MTT实验证实3c对NCI-H460细胞具有选择性抑制活性(IC50=67.31 μg/mL),ADMET预测显示良好的口服生物利用度和低毒性(LD50=1830 mg/kg)。该研究为开发双靶点抗癌先导化合物提供了新策略。
肺癌是全球死亡率最高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌(NSCLC)因高发病率和治疗耐药性成为临床难点。表皮生长因子受体(EGFR)过表达和细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK-2)异常活化是NSCLC关键致病机制,但现有抑制剂长期使用易产生耐药突变。吡咯支架广泛存在于奥希替尼等抗癌药物中,其氮原子修饰可精准调控电子性质、脂溶性和氢键能力,成为药物设计优势骨架。
为开发新型双靶点抑制剂,Maharaja's College的Meera Gopinadh团队通过微波辅助锰催化Clauson-Kaas反应,在无溶剂条件下高效合成了19种N-芳基吡咯衍生物。其中双(4-(1H-吡咯-1-基)苯基)甲烷(3c)表现出最优特性:DFT计算(B3LYP-D3/6-311++G(d,p))显示其苯环二面角300°构象最稳定,NMR化学位移预测与实验值高度吻合(1H RMSD 0.2-1.0 ppm)。分子对接揭示3c与EGFR活性位点(Lys721, Leu764等)和CDK-2(Glu162, Thr14等)形成关键相互作用,结合能均达-9.3 kcal/mol。药代动力学预测符合Lipinski五规则,口服生物利用度高且无肝毒性警示。
关键技术方法包括:①微波合成反应(120℃/20分钟);②DFT几何优化与势能面扫描;③分子对接(Schr?dinger Jaguar模块);④ADMET性质预测(SwissADME/ProTox 3.0);⑤体外MTT活性验证(NCI-H460细胞系)。
3.1 锰催化微波辅助Clauson-Kaas反应
所有化合物均通过Mn(NO3)2·4H2O催化合成,3c收率45%。PES扫描显示其构象能垒2.897 kcal/mol(180°)至0 kcal/mol(300°)。
3.2 密度泛函理论计算
3c的HOMO-LUMO能隙5.21 eV,电负性3.57 eV,化学硬度2.60 eV,表明适度反应活性。NMR计算采用PCM氯仿模型,13C RMSD 0.5-1.6 ppm验证结构准确性。
3.3 分子对接分析
3c与EGFR结合模式类似厄洛替尼,但增加与Met742疏水作用;与CDK-2形成双氢键(Glu162/Thr14),LibDock评分114.851优于AZD5438(117.633)。
3.4 药代动力学筛选
3c的拓扑极性表面积9.86 ?2,脂水分配系数4.86,血脑屏障渗透性良好。毒性预测为4级(ProTox 3.0),生态风险低。
3.5 体外细胞毒性评估
MTT法显示3c对NCI-H460细胞抑制率62.14%(100 μg/mL),正常CHO-K1细胞存活率76.63%,选择性指数1.84。其活性虽低于吉非替尼(IC504.5-8.0 μg/mL),但双靶点作用机制具特色。
该研究通过多学科交叉策略证实3c作为EGFR/CDK-2双抑制剂潜力。绿色合成方法减少副产物,DFT-NMR关联模型为类似物设计提供模板,分子对接揭示的Glu162氢键作用为优化指明方向。未来需开展动物实验验证体内疗效,并探索对T790M突变株的抑制活性。