解密上皮性卵巢癌脑转移：多组学分析揭示关键生物标志物与治疗新靶点

《npj Precision Oncology》：Deciphering brain metastasis in epithelial ovarian cancer: multimodal analysis and potential biomarkers

为解决上皮性卵巢癌（EOC）脑转移（BM）机制不明、缺乏早期预测标志物的临床难题，研究团队通过基因组与转录组多模态分析，对比匹配的原发肿瘤（PT）与脑转移灶（BM）样本。结果揭示BM中MYC通路、细胞外基质重塑和炎症信号异常激活，并筛选出AFP、GFAP、MET、GDF15、S100A9等关键分子作为潜在生物标志物与治疗靶点，为EOC脑转移的早期干预和精准治疗提供新策略。

　　

上皮性卵巢癌（EOC）是发达国家妇科恶性肿瘤中死亡率最高的癌种，尽管治疗手段不断进步，约80%的患者仍会面临复发和耐药问题。传统上，EOC的复发多局限于腹腔，但近年来，脑转移（BM）这一罕见却致命的并发症发生率呈现上升趋势，可能与靶向药物（如PARP抑制剂）延长患者生存期相关。一旦发生脑转移，患者中位生存期仅8-12个月，且临床缺乏有效的预测标志物和针对性治疗策略。在这一背景下，深入研究EOC脑转移的分子机制，挖掘早期预警指标和潜在治疗靶点，成为精准肿瘤学的迫切需求。

为此，研究团队在《npj Precision Oncology》上发表了最新成果，通过对10例匹配的EOC原发灶和脑转移灶样本进行多组学分析，结合健康组织及非脑转移对照组，系统揭示了EOC脑转移的分子特征。研究中应用的主要技术包括：基于Illumina TruSight Oncology 500的高通量基因组测序（检测SNV、Indel、CNV、融合基因、TMB和MSI），以及适用于FFPE降解RNA的3′端数字基因表达（3′DGE）测序技术；通过PyClone分析克隆演化，并利用GSEA进行通路富集分析；样本来源于Fondazione Policlinico Gemelli IRCCS回顾性队列（2000–2021年），包括10组匹配PT-BM样本、健康脑组织、卵巢组织及非脑转移复发样本。

患者队列与基因组特征

研究纳入4978例EOC患者中111例发生脑转移（2.2%），其中10例具备匹配PT-BM样本。基因组分析显示PT与BM具有高度一致性，70%患者携带TP53突变，CNV在BM中更频繁，提示晚期基因组改变可能促进中枢神经系统定植。

脑转移特异性转录组特征

对比BM与健康脑组织发现2845个基因上调，涉及E2F靶点、G2M检查点等通路；与非脑转移灶比较，AFP、GFAP等神经胶质相关基因显著上调，提示肿瘤细胞可能通过模拟神经表型适应中枢环境。

原发肿瘤的“脑转移倾向”签名

对比长期存活无脑转移患者，发现13个基因（如AFP、GDF15、S100P）在PT中特异性高表达，构成“脑转移前特征”，其中神经活性配体-受体通路富集提示早期微环境适应潜能。

关键信号网络筛选

通过膜蛋白与分泌蛋白筛选，发现MET、GDF15、S100A9在PT和BM中持续高表达，网络分析显示它们与ECM重塑、应激反应等通路关联，可能介导肿瘤-脑微环境交互。

研究结论与意义

本研究首次通过多组学整合分析揭示EOC脑转移的克隆保守性及转录重塑特征，提出AFP、GFAP、MET等作为潜在生物标志物，不仅为脑转移风险预警提供依据，也为针对MET、S100A9等靶点的干预策略奠定理论基础。尽管样本量有限且缺乏独立验证，该研究为理解EOC中枢神经系统转移的生物学机制提供了宝贵资源，推动精准医疗在卵巢癌脑转移领域的应用。