批量测序结合单细胞测序技术发现VCAN在成纤维细胞中高表达，该现象促进了高干性胃癌细胞的进展

《The FASEB Journal》：Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells

胃腺癌（STAD）中versican高表达并与预后不良相关。单细胞分析显示versican主要由CAFs分泌，通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进癌细胞增殖、迁移和侵袭，并增强免疫逃逸。该研究首次揭示versican在STAD中的促癌机制，为开发靶向versican的治疗策略提供依据。

　　

摘要

胃癌是全球第五大常见恶性肿瘤，也是导致癌症相关死亡的原因之一，其中胃腺癌（STAD）是最主要的病理类型。尽管近年来胃腺癌的发病率有所下降，但人口老龄化等因素可能导致未来病例的增加。目前对胃腺癌的临床治疗主要采用手术切除、放疗、化疗以及新兴的免疫检查点阻断（ICB）疗法。然而，ICB单药治疗在大多数胃腺癌患者中的疗效有限，这凸显了寻找新的治疗靶点的必要性。本研究探讨了versican（VCAN）在胃腺癌中的作用。通过对多个数据库的全面分析，发现胃腺癌组织中的VCAN表达显著高于正常组织，并且这与患者的不良预后相关。单细胞分析进一步表明，VCAN主要由癌相关纤维母细胞（CAFs）分泌，尤其是pan-pCAF亚型。具有高VCAN水平的CAFs通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进高干性腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭，同时增强免疫逃逸和自我更新能力。这些结果表明VCAN可能是胃腺癌的一个潜在新治疗靶点。

图形摘要

图形工作流程总结了整个研究设计，包括生物信息学分析、单细胞转录组分析以及体外功能验证。首先，分析了TCGA和GEO的大规模转录组数据集，以评估VCAN的表达、临床意义及其参与的信号通路。随后，单细胞RNA-seq分析确定了CAFs（尤其是pan-pCAF亚型）是胃腺癌中VCAN升高的主要来源，并进一步分析了细胞间通讯和转录因子调控网络。最后，通过共培养模型、CCK-8活力测定以及Western blotting结合共免疫沉淀（Co-IP）等体外实验，验证了CAFs来源的VCAN及其与CD44相互作用在促进胃腺癌细胞EMT和G1-S期转化中的作用。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

本研究中使用和/或分析的数据集可向相应作者提出合理请求后获取。