神经肽INS-14调节秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中的细胞凋亡清除过程

《Biochemical and Biophysical Research Communications》:Neuropeptide INS-14 Modulates Apoptotic Cell Clearance in Caenorhabditis elegans

【字体: 时间:2026年01月23日 来源:Biochemical and Biophysical Research Communications 2.2

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  凋亡细胞清除机制研究中发现,利用C. elegans模型通过RNAi筛选鉴定出9个调控凋亡的神经肽基因,其中ins-14和flp-23特异性参与细胞清除,且ins-14通过转录调控laat-1影响吞噬体酸化。

  
谢云敏|陈璐|刘福桥|郑倩|袁雷|肖辉|王辉
中国陕西师范大学生命科学学院

摘要

凋亡是程序性细胞死亡的主要形式,对动物发育至关重要。神经肽是神经系统中的关键信号分子,在各种生理和行为过程中发挥作用。迄今为止,尚无证据表明神经肽参与了凋亡细胞的清除。因此,我们利用秀丽隐杆线虫(一种研究凋亡及其调控机制的典型模式生物)通过RNA干扰(RNAi)技术对神经肽基因进行了全面的功能筛选,以识别参与凋亡和凋亡细胞清除的关键神经肽基因。秀丽隐杆线虫拥有113个神经肽基因。我们的筛选确定了9个初步参与凋亡调控的神经肽基因,其中2个基因特异性地参与了凋亡细胞的清除。在这些基因中,ins-14基因表现出最显著的调控作用。进一步的机制研究表明,在凋亡细胞清除的后期阶段,ins-14功能的紊乱会显著影响关键蛋白LAAT-1向吞噬体的募集效率,并破坏吞噬体内的正常酸化过程。此外,我们还发现ins-14在转录水平上调节laat-1的表达。本研究首次阐明了神经肽在秀丽隐杆线虫中调节凋亡细胞清除的作用,为更深入理解神经肽介导的凋亡调控网络提供了新的实验证据。

引言

凋亡是动物发育中的基本过程,是程序性细胞死亡的关键机制[1]。每天,数十亿老化或受损的细胞会作为正常生理过程的一部分发生凋亡[2]。有效清除这些凋亡细胞对于维持组织稳态至关重要[3]。清除凋亡细胞的过程很复杂,涉及多个阶段[4, 5]。最初,凋亡细胞会释放“寻找我”信号以吸引吞噬细胞。随后,凋亡细胞表面的“吃我”配体与吞噬细胞膜上的受体相互作用,触发细胞内信号传导,导致凋亡细胞被吞噬。最后,在溶酶体内,凋亡细胞的细胞碎片和内容物被分解[6, 7]。未能有效清除凋亡细胞可能导致发育异常和自身免疫性疾病,包括系统性红斑狼疮[8]、动脉粥样硬化[9]和类风湿性关节炎[10]等[7]。在秀丽隐杆线虫这种模式生物中,吞噬细胞通过两条已建立的途径介导吞噬过程:ced-1/6/7途径和ced-2/5/12途径[11, 12, 14][15]。凋亡开始时,CED-1受体(吞噬过程中的关键成分)被激活,启动下游信号通路[16]。在吞噬体闭合阶段,Rab5通过激活VPS-34促进PtdIns3P的产生,这对早期内体的形成至关重要[15]。在吞噬体成熟后期,Rab7负责溶酶体与吞噬体的对接和融合,帮助其成熟并随后降解被吞噬的物质[15, 17]。最终,在吞噬细胞内,溶酶体膜蛋白如LAAT-1和LMP-1被募集,同时释放多种水解酶(包括CPL-1[18]和NUC-1[19]),促进凋亡细胞的持续降解。
神经肽是神经系统中的关键信号分子,主要由5到12个氨基酸组成的短链构成,尽管有些可能更长(长达40个氨基酸),某些肽前体可能保持未处理状态。神经肽在多种功能中起关键作用,如调节炎症反应、昼夜节律、代谢活动、繁殖行为和交配、应激反应以及寿命。神经肽主要通过与G蛋白偶联受体(GPCRs)结合来发挥生物学效应,这些受体在神经系统和其他组织中广泛表达[20]。这种配体-受体相互作用激活下游信号通路,实现对细胞间通讯和多种生理过程的精细调节[21]。通过这些信号机制,神经肽调节能量稳态、心血管调节、痛觉、学习和记忆等关键功能[22, 23]。此外,新证据表明某些神经肽可以通过调节胶质细胞活性来影响神经炎症反应,从而影响疼痛敏感性和神经免疫相互作用[24]。神经肽的合成涉及从大分子前体经过一系列处理步骤。它们最初在内质网中形成,然后通过囊泡运输到高尔基体,在那里通过跨高尔基网络(TGN)或分泌囊泡进行进一步处理。在此过程中,RAB-5和RAB-10共同调节神经肽的释放[25]。
秀丽隐杆线虫因其神经系统特征明确和遗传学易于操作而被广泛用作研究神经肽信号的模型生物。秀丽隐杆线虫基因组编码约113个神经肽前体基因,这些前体通过蛋白水解和翻译后修饰(如C端酰胺化)产生超过250种不同的成熟肽[26]。这些肽大致分为三类:胰岛素样肽(INS)、FMRF酰胺相关肽(FLPs)和神经肽样蛋白(NLPs)[27]。INS家族包含40个胰岛素样基因,其中许多作为保守的胰岛素/IGF-1信号通路的配体,调节生物体的发育、代谢和寿命。FLP家族包含31个基因,其前体生成多种生物活性肽,通常具有C端RF酰胺(RF)基序。FLPs是已知最大的神经肽家族,主要参与运动、进食和感觉反应的调节。尽管FLPs在脊椎动物中几乎没有直接同源物,但其G蛋白偶联受体(GPCRs)在进化上是保守的。NLP家族包含42个基因,编码具有行为和应激反应功能的多种肽。值得注意的是,单个前体基因可以产生多种活性肽,且其表达通常是细胞特异性的。秀丽隐杆线虫雌雄同体含有恰好302个神经元,每个神经元表达特定的神经肽和受体组合,从而能够精确调节神经回路。神经肽通过与GPCRs结合来发挥效应,触发细胞内信号级联[28]。比较基因组学研究表明不同物种之间存在显著差异。黑腹果蝇拥有23个神经肽基因和7种胰岛素样肽,而人类编码超过100种神经肽,包括10种胰岛素样分子(如胰岛素、IGFs和INSLs)以及关键调节因子(如胰高血糖素样肽-1(GLP-1),这突显了代谢和神经内分泌信号通路的深刻进化保守性[21]。
研究表明,在哺乳动物中,神经肽Y通过自分泌机制在多囊卵巢综合征(PCOS)中减少雄激素诱导的凋亡[29]。当寄生虫内化神经肽时,它们会破坏细胞内区室,导致类似自噬的细胞死亡[30]。在组织损伤的情况下,痛觉感觉神经元的末端会延伸到皮肤和肌肉的肉芽组织中,释放降钙素基因相关肽(CGRP)。CGRP促进巨噬细胞向M2样表型的极化,这与抗炎和修复功能相关,并通过TSP-1的自分泌或旁分泌作用增强巨噬细胞的吞噬作用[31]。感觉神经肽物质P(SP)及其受体神经激肽-1(NK1R)参与小鼠巨噬细胞的机械调节。此外,手术诱导的骨关节炎(OA)改变了BMM细胞对机械负荷的凋亡反应,表明OA相关的生物力学变化影响了骨驻留巨噬细胞的种群[32]。十八烷基神经肽(ODN)被发现有助于星形胶质细胞抵抗6-OHDA诱导的氧化应激和凋亡[33]。还有证据表明,物质P可能通过促进多柔比星诱导的心力衰竭大鼠模型中的自噬来减少心肌细胞凋亡[34]。这些观察结果表明,神经肽可能在清除凋亡细胞中起关键作用,尽管其作用机制需要在不同物种中进行进一步研究。
这些发现共同强调了神经肽在调节程序性细胞死亡中的多样性和受体特异性作用。
尽管秀丽隐杆线虫神经肽的分类和分泌机制已部分阐明,且关于神经肽在哺乳动物中调节凋亡的证据也在不断增加。降钙素基因相关肽(CGRP)的抗凋亡作用具有途径特异性,研究表明它可以通过独立于PKA和PKC信号传导的机制抑制去甲肾上腺素诱导的心肌细胞凋亡[35]。神经肽Y(NPY)主要通过激活Y2受体发挥保护作用,Y1亚型也有贡献[36]。内源性阿片肽也表现出神经保护特性;例如,apelin已被证明可以减轻血清剥夺引起的皮质神经元凋亡[37]。此外,神经紧张素(NT)通过增强存活能力和抑制胰腺β细胞的凋亡途径表现出抗凋亡活性[38]。然而,关于神经肽在秀丽隐杆线虫中参与凋亡调节(特别是凋亡细胞清除)的研究仍不充分。这一知识空白为研究神经肽在凋亡中的进化保守作用以及识别调控这一过程的新分子途径提供了宝贵的途径。
在这项研究中,我们探讨了特定神经肽基因是否影响发育过程中凋亡细胞的清除效率。我们采用靶向RNAi筛选方法结合遗传分析,研究了保守神经肽候选基因在吞噬中的作用。我们的研究表明,胰岛素样神经肽INS-14通过转录调控laat-1基因在凋亡细胞的清除中发挥先前未被认识的作用,laat-1基因参与溶酶体动态。这些发现揭示了一条新的神经细胞轴,将神经肽信号传导与溶酶体介导的细胞碎片降解联系起来。

部分内容

秀丽隐杆线虫品系和遗传学

本研究中使用的秀丽隐杆线虫野生型品系以及用于遗传学研究的品系均来自Bristol N2品系,该品系在含有OP50的Nematode Growth Medium(NGM)培养基上于20°C培养。遗传操作基于Brenner于1974年发表在《遗传学》杂志上的论文“秀丽隐杆线虫的遗传学”。本研究中使用的集成阵列如下:

十种神经肽基因参与秀丽隐杆线虫中的凋亡调节

神经肽基因在整个神经系统中广泛表达,包括感觉神经元、运动神经元和中间神经元。目前关于神经肽在清除凋亡细胞中的作用的研究仍然有限。为了进一步阐明神经肽在秀丽隐杆线虫中促进凋亡细胞清除的机制,我们使用RNA干扰(RNAi)技术筛选了113个神经肽基因(补充表S1),并量化了凋亡细胞的数量

讨论

在这项研究中,我们使用RNA干扰(RNAi)技术筛选了秀丽隐杆线虫中的113个神经肽基因。我们的发现表明,9个基因(ins-3、ins-12、flp-23、ins-13、ins-27、nlp-5、nlp-22、ins-19、flp-19和ins-14)参与了凋亡过程,而2个基因(ins-14和flp-23)参与了凋亡细胞的清除。值得注意的是,ins-14具有双重调控功能,它不仅调节凋亡,还参与凋亡细胞的清除

CRediT作者贡献声明

王辉:撰写——原始草稿、可视化、验证、监督、资源获取、方法学、研究、资金获取、正式分析、数据管理、概念化。肖辉:软件、方法学、资金获取、数据管理。袁雷:软件、方法学、资金获取、数据管理。郑倩:软件、方法学、数据管理。刘福桥:软件、方法学、数据管理。陈璐:软件、方法学、正式分析、数据管理。谢云敏:

写作过程中使用生成式AI和AI辅助技术的声明

在准备这项工作时,作者使用了DeepSeek来提高可读性和语言表达。使用这些工具后,作者根据需要审查和编辑了内容。

利益冲突声明

作者声明没有已知的竞争性财务利益或个人关系可能影响本文报告的工作。

致谢

这项工作部分得到了国家自然科学基金(资助编号:31871387,授予肖辉)、国家自然科学基金(资助编号:32370799,授予肖辉)、国家自然科学基金青年项目(资助编号:32300622,授予袁雷)、陕西省三秦博创人才支持计划(资助编号:2024SQBC004,授予袁雷)、陕西省自然科学基金(资助编号:2024JC-YBMS-638,授予王辉)等项目的支持
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