《Clinical Immunology》：Integrated single cell RNA sequencing and flow cytometry analysis identifies elevated S100A6+ and S100A8+ myeloid subsets in pancreatic ductal adenocarcinoma
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胰腺导管腺癌（PDAC）患者外周血单核细胞和树突状细胞中S100A6、S100A8及S100A12表达上调，提示其作为液体活检的潜在生物标志物，需进一步验证特异性及临床应用。
阿夫辛·德拉赫沙尼（Afshin Derakhshani）|罗伯塔·迪·丰特（Roberta Di Fonte）|莱蒂齐亚·波尔切利（Letizia Porcelli）|法特梅赫·内贾迪·奥朗（Fatemeh Nejadi Orang）|马赫迪·阿卜杜利·沙德巴德（Mahdi Abdoli Shadbad）|阿迪布·米拉基·费里兹（Adib Miraki Feriz）|侯赛因·萨法尔普尔（Hossein Safarpour）|安托万·杜福尔（Antoine Dufour）|贝赫扎德·巴拉达兰（Behzad Baradaran）|安杰拉·卡拉布雷塞（Angela Calabrese）|马里奥·泰斯蒂尼（Mario Testini）|里卡多·梅梅奥（Riccardo Memeo）|乔瓦娜·迪·梅奥（Giovanna Di Meo）|莱昂纳多·文森蒂（Leonardo Vincenti）|索纳利·巴尔德瓦杰（Sonali Bhardwaj）|维托·拉卡内利（Vito Raccanelli）|尼古拉·西尔韦斯特里斯（Nicola Silvestris）|奥龙佐·布鲁内蒂（Oronzo Brunetti）|阿玛利亚·阿扎里蒂（Amalia Azzariti）
卡尔加里大学（University of Calgary）库明医学院（Cumming School of Medicine）微生物学、免疫学和传染病系（Department of Microbiology, Immunology, and Infectious Diseases）卡尔文、菲比和琼·斯奈德慢性疾病研究所（Calvin, Phoebe and Joan Snyder Institute for Chronic Diseases）
摘要
胰腺导管腺癌（Pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC）是最致命的恶性肿瘤之一，这凸显了开发微创生物标志物以支持患者分层和疾病监测的必要性。在这项研究中，我们通过重新分析单细胞RNA测序数据集来识别与PDAC相关的免疫特征，并使用流式细胞术（flow cytometry）在一个主要由晚期PDAC患者组成的独立队列中验证关键发现。对PDAC患者和健康捐赠者的外周血单核细胞（peripheral blood mononuclear cells）的分析显示，S100A6、S100A8和S100A12的表达增加，尤其是在单核细胞和树突状细胞（dendritic cells）中。这些转录变化在蛋白质水平上也得到了证实，表明PDAC患者中S100A6+单核细胞、S100A6+/S100A8+树突状细胞、活化单核细胞和浆细胞样树突状细胞（plasmacytoid DCs）富集。单变量ROC分析确定S100A6+浆细胞样树突状细胞、S100A8+浆细胞样树突状细胞以及CD14+CD86+S100A8+单核细胞是潜在的PDAC相关免疫特征。然而，在得出关于诊断特异性和临床应用性的结论之前，还需要进一步结合良性胰腺疾病的情况进行验证，并采用多变量建模。
部分内容摘录
背景
胰腺导管腺癌（PDAC）是一种常见且具有侵袭性的胰腺癌类型，被认为是男性和女性癌症相关死亡的第三大原因[1]。其发病率和死亡率在全球范围内持续上升，预计到2050年将达到每10万人18.6例，凸显了其对公共卫生的日益重要影响[2]。尽管我们对PDAC生物学的理解取得了显著进展，但由于诊断往往较晚，患者的预后仍然较差。
研究人群
本研究的伦理批准由巴里“乔瓦尼·保罗二世肿瘤研究所”（IRCCS Istituto Tumori “Giovanni Paolo II”根据伦理代码574/2016授予。所有参与者在实施任何程序前均提供了知情书面同意。胰腺导管腺癌患者的纳入标准包括能够提供知情同意、年龄超过18岁，并且具有确诊该疾病的组织学依据。相反，曾经接受过手术或其他治疗的患者不符合纳入标准。
PBMCs的UMAP可视化及样本中的细胞分布
图1a展示了GSE155698数据集的处理流程。PDAC患者和健康捐赠者的PBMCs的UMAP可视化结果显示两组之间的细胞分布存在差异（见图1b和c）。根据细胞类型分析方法（cell typist approach）表达的基因标记物，细胞被分为49个簇（见图1d）。值得注意的是，健康对照组和PDAC患者之间的免疫细胞簇分布有所不同，尤其是髓系细胞（myeloid cells）的比例有所增加。
讨论与结论
PDAC被认为是一种高度侵袭性的恶性肿瘤，其复杂的分子特征和免疫抑制性肿瘤微环境（immunosuppressive tumor microenvironment）是其致病原因[27]。因此，识别能够区分PDAC患者与健康个体及良性胰腺疾病的生物标志物，有望显著改善临床结局。为此，我们通过液体活检（liquid biopsy）来识别系统性免疫细胞群体，作为辅助诊断工具。
作者信息
本文作者隶属于巴里“乔瓦尼·保罗二世肿瘤研究所”（IRCCS Istituto Tumori “Giovanni Paolo II”），他们负责本文表达的观点，这些观点不一定代表该研究所的官方立场。
CRediT作者贡献声明
阿夫辛·德拉赫沙尼（Afshin Derakhshani）：方法学设计、数据管理、概念构思。罗伯塔·迪·丰特（Roberta Di Fonte）：写作、审稿与编辑、验证、方法学设计。莱蒂齐亚·波尔切利（Letizia Porcelli）：写作、审稿与编辑、方法学设计、数据分析。法特梅赫·内贾迪·奥朗（Fatemeh Nejadi Orang）：初稿撰写。马赫迪·阿卜杜利·沙德巴德（Mahdi Abdoli Shadbad）：初稿撰写、方法学设计。阿迪布·米拉基·费里兹（Adib Miraki Feriz）：方法学设计。侯赛因·萨法尔普尔（Hossein Safarpour）：方法学设计。安托万·杜福尔（Antoine Dufour）：写作、审稿与编辑。贝赫扎德·巴拉达兰（Behzad Baradaran）：写作、审稿与编辑。
伦理批准与参与同意
本研究的伦理批准由巴里“乔瓦尼·保罗二世肿瘤研究所”（IRCCS Istituto Tumori “Giovanni Paolo II”根据伦理代码574/2016授予。所有参与者在实施任何程序前均提供了知情书面同意。
资金支持
本研究得到了巴里“乔瓦尼·保罗二世肿瘤研究所”（IRCCS Istituto Tumori “Giovanni Paolo II”以及意大利卫生部的支持，后者提供了资助（项目编号：Ricerca Corrente 2025 - Deliberation n.197/2025，项目名称：识别用于胰腺及肝内外胆道腺癌患者诊断、预后和/或预测的循环因素）。
利益冲突声明
所有作者均审阅了手稿，并声明没有利益冲突。
