ZCWPW2通过乳酸化修饰调控减数分裂重组的新机制及其在人类与小鼠生育中的作用

《Nucleic Acids Research》:A novel dual histone mark reader ZCWPW2 regulates meiotic recombination through lactylation and transcriptional regulation in humans and mice

【字体: 时间:2026年01月25日 来源:Nucleic Acids Research 13.1

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  本研究针对减数分裂重组调控机制不明确的难题,揭示了组蛋白双修饰阅读器ZCWPW2通过形成ZCWPW1-ZCWPW2复合物,增强LDHA/EP300介导的乳酸化修饰,从而稳定重组相关蛋白稳定性,最终保障染色体正确联会和DNA双链断裂修复。该研究不仅完善了PRDM9/ZCWPW1/ZCWPW2调控体系,还首次阐明了乳酸化修饰在减数分裂中的关键作用,为人类非梗阻性无精症提供了新的病因解释和治疗靶点。

  
在生命延续的奇妙旅程中,减数分裂是确保遗传多样性不可或缺的关键环节。这一精密过程中,同源染色体间发生DNA重组交换,既增加了遗传多样性,又保证了染色体的正确分离。然而,当减数分裂重组出现故障时,常常导致配子发生障碍和不育症。在大多数哺乳动物中,重组并非随机发生,而是集中在被称为"重组热点"的特定基因组区域。
多年来,科学家们已经发现PRDM9是决定重组热点位置的关键"书写器",它通过在核小体上沉积H3K4me3和H3K36me3这两种组蛋白修饰标记来定义热点区域。随后,ZCWPW1作为"阅读器"识别这些标记,招募重组机器进行DNA双链断裂修复。然而,这一精密调控系统的具体分子机制仍不清楚,特别是是否存在其他参与者共同调控这一过程。
近期发表在《Nucleic Acids Research》的研究中,研究人员将目光投向了ZCWPW2——ZCWPW1的旁系同源物。尽管生物信息学分析提示ZCWPW2可能与PRDM9存在协同进化关系,且体外实验表明它也能结合H3K4me3和H3K36me3修饰,但ZCWPW2在体内的具体功能及其在减数分裂中的作用机制仍是未解之谜。
为了解开这一谜团,研究团队首先探究了ZCWPW2在哺乳动物生殖细胞发育中的时空表达模式。有趣的是,ZCWPW2在成年小鼠睾丸中高表达,其表达模式与PRDM9相似但与ZCWPW1的广泛表达不同。在胚胎卵巢中,ZCWPW2在E15.5天达到峰值,而在胎儿睾丸中表达量极低,但从出生后10天开始显著上升,在P20天达到峰值并稳定。染色体铺片实验进一步显示,ZCWPW2在细线期和偶线期精母细胞中均有表达,但与ZCWPW1不同,它不定位於性体并持续存在至终变期。
研究人员利用CRISPR-Cas9技术构建了Zcwpw2基因敲除小鼠,发现敲除小鼠雌雄均不育。雄性小鼠睾丸和附睾明显缩小,组织学分析显示精母细胞停滞并伴有凋亡。雌性小鼠卵巢中则缺乏生长卵泡,胚胎期和新生期卵巢中的原始卵泡数量显著减少。更重要的是,通过对279名非梗阻性无精症患者进行全外显子测序,发现一名近亲结婚家庭的患者携带ZCWPW2纯合移码突变,其睾丸活检显示生精小管内仅有精原细胞和精母细胞,完全缺乏精子细胞。
在机制探索方面,研究团队发现Zcwpw2缺陷精母细胞表现出严重的联会缺陷,主要表现为同源染色体不联会,同时伴有少量非同源染色体错误配对。虽然DNA双链断裂形成正常,但修复过程严重受损,导致DMC1、RAD51和RPA2等DNA修复蛋白在偶线期和粗线期样阶段异常积累。同时,MLH1和MLH3等标志交叉形成的焦点完全缺失。
通过CUT&Tag技术,研究人员揭示了ZCWPW2结合特性的独特性:在PRDM9存在的情况下,ZCWPW2在H3K4me3和H3K36me3双标记位点的富集显著增强。更重要的是,无论PRDM9存在与否,ZCWPW2都能独立结合启动子区域,调控包括ZCWPW1、EP300在内的减数分裂相关基因的转录。
免疫共沉淀-质谱分析进一步显示,ZCWPW2与ZCWPW1形成复合物,并与SYCP1、HSPA2、TEX11、MSH2、MLH1等重组相关蛋白相互作用。这种相互作用依赖于ZCWPW1,且不依赖于DNA结合。特别值得注意的是,ZCWPW1-ZCWPW2复合物与乳酸脱氢酶LDHA相互作用,并维持其酶活性。同时,ZCWPW2还通过调控组蛋白乙酰转移酶EP300的转录,共同促进重组相关蛋白的乳酸化修饰。
乳酸化组学分析显示,Zcwpw2缺陷睾丸中全局乳酸化水平显著降低,特别是在HSPA2-127K、HSPA2-129K、HSPA2-576K、SYCP1-734K、MDC1-53K等重组相关蛋白的特定位点。这些位点的乳酸化水平下降导致蛋白质稳定性降低,泛素化介导的降解增加,最终影响减数分裂重组的正常进行。
关键技术方法
研究主要应用了基因编辑技术构建Zcwpw2敲除小鼠模型,通过全外显子测序筛选人类患者突变,利用CUT&Tag分析全基因组结合位点,结合免疫共沉淀-质谱技术鉴定互作蛋白,并采用乳酸化组学全面评估蛋白质翻译后修饰变化。人类睾丸样本来自279名非梗阻性无精症患者队列。
ZCWPW2在人和小鼠减数分裂进程中不可或缺
研究人员发现ZCWPW2缺陷导致人和小鼠生殖细胞减数分裂停滞。在小鼠中,Zcwpw2敲除导致两性不育,睾丸组织显示精母细胞凋亡和发育停滞,卵巢中卵泡发育异常。在人类中,发现一名携带ZCWPW2纯合移码突变的无精症患者,其睾丸活检显示生精小管内仅有精原细胞和精母细胞,完全缺乏精子细胞。
Zcwpw2敲除小鼠表现出比Zcwpw1敲除更严重的减数分裂重组损伤
Zcwpw2缺陷精母细胞表现出严重的染色体联会异常,主要是同源染色体不联会。与Zcwpw1敲除相比,Zcwpw2敲除中每个精母细胞中不联会的染色体对数更多,表明ZCWPW2缺陷导致的联会缺陷更为严重。虽然DNA双链断裂形成正常,但修复过程受损,重组中间体MSH4和TEX11信号减少,交叉形成标志MLH1和MLH3焦点完全缺失。
ZCWPW2在PRDM9存在下富集于H3K4me3和H3K36me3位点并与ZCWPW1形成复合物
CUT&Tag分析显示,PRDM9能显著增强ZCWPW2在H3K4me3和H3K36me3双标记位点的富集。ZCWPW2与ZCWPW1形成复合物,通过各自的PWWP结构域相互作用。在PRDM9存在的情况下,大多数ZCWPW2峰与ZCWPW1峰在相同位点重叠。
ZCWPW2独立结合与减数分裂相关基因转录相关的启动子区域
无论PRDM9存在与否,ZCWPW2都能结合H3K4me3标记的启动子区域,调控减数分裂相关基因(如RAD51AP1、ZCWPW1、BARD1等)的转录。双荧光素酶报告基因实验证实ZCWPW2过表达可增强这些基因启动子活性。Zcwpw2敲除小鼠和患者睾丸中这些基因的表达均显著下调。
ZCWPW1-ZCWPW2复合物与重组相关蛋白相互作用
IP-MS分析鉴定出ZCWPW2与SYCP1、HSPA2、TEX11、MSH2、MLH1等重组相关蛋白相互作用。这些相互作用依赖于ZCWPW1,且在DNA酶处理后仍然存在,表明是直接蛋白互作。
ZCWPW1-ZCWPW2复合物相互作用并稳定乳酸脱氢酶LDHA的活性
ZCWPW2与LDHA相互作用,这种相互作用依赖于ZCWPW1。虽然ZCWPW2缺陷不影响LDHA蛋白 abundance,但显著降低其酶活性。过表达ZCWPW2可增强LDHA活性,而敲低ZCWPW1则降低其活性。
ZCWPW2缺陷睾丸中乳酸化和重组相关蛋白丰度下调
Zcwpw2敲除睾丸中全局乳酸化水平显著降低,特别是重组相关蛋白的特定位点。乳酸化水平下降导致这些蛋白稳定性降低,泛素化降解增加。乳酸化效率分析表明这种下调不是由蛋白丰度减少引起的,而是乳酸化修饰本身的选择性降低。
ZCWPW1-ZCWPW2复合物通过LDHA/EP300介导的乳酸化稳定重组相关蛋白
细胞实验证实,ZCWPW1-ZCWPW2复合物通过促进重组相关蛋白的乳酸化修饰而稳定其丰度。抑制EP300或LDHA活性会降低这些蛋白的乳酸化和丰度,而激活EP300或添加乳酸则产生相反效果。ZCWPW2缺陷细胞中这些蛋白的泛素化水平增加。
研究结论与意义
本研究系统阐明了ZCWPW2在减数分裂重组中的核心作用及其分子机制。ZCWPW2不仅作为组蛋白双修饰阅读器与ZCWPW1协同作用,还通过调控基因转录和蛋白质乳酸化修饰双重机制,确保减数分裂重组正常进行。研究发现ZCWPW1-ZCWPW2复合物与LDHA相互作用维持其酶活性,同时ZCWPW2促进EP300转录,共同介导重组相关蛋白的乳酸化修饰,从而稳定这些蛋白的丰度。
该研究的创新性在于首次将乳酸化修饰与减数分裂重组联系起来,揭示了代谢修饰在生殖细胞发育中的新功能。不仅完善了PRDM9/ZCWPW1/ZCWPW2调控网络,还为人类不育症的病因诊断提供了新的分子标记和治疗靶点。研究发现的ZCWPW2突变是人类无精症的新病因,为相关患者的遗传咨询和精准治疗提供了重要依据。
从更广泛的生物学意义来看,这项工作揭示了表观遗传调控、代谢重编程和减数分裂进程之间的精密联系,为理解生殖细胞发育的复杂调控网络提供了新视角。蛋白质乳酸化修饰在减数分裂中的重要作用提示,代谢状态可能直接影响生殖细胞基因组稳定性,这一发现对理解环境因素影响生殖健康提供了新思路。
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