将转录组、代谢组和肠道微生物群整合起来，有助于深入了解pH值对小龙虾营养价值的影响

《Aquaculture International》：Integration of transcriptome, metabolome, and intestinal microbiota provided insights into the effects of pH on the nutritional quality of crayfish

环境pH显著影响crayfish营养代谢，通过多组学分析发现高pH组粗蛋白（18.03%）、总氨基酸（13.25%）和PUFA（55.38%）含量更高，关键基因glna上调，代谢物2-磷酸-d-甘油酸和苏氨酸促进风味物质合成，低pH组脂代谢相关基因fasn和acsl及代谢物 glycerone phosphate下调。肠道微生物组中高pH组Firmicutes/Bacteroidota比值升高，Bacilloplasma属及Rhodobacteraceae家族微生物富集，通过氨基酸代谢等途径促进宿主营养积累。

　　

摘要

环境pH值是影响小龙虾营养价值的关键因素，但其背后的机制尚不清楚。本研究通过多组学分析初步揭示了pH值对小龙虾营养代谢影响的潜在调控途径。结果显示，在高pH环境下，小龙虾中的粗蛋白（18.03% vs 16.82%）、总氨基酸（TAA）（13.25% vs 12.67%）和多不饱和脂肪酸（PUFA）（55.38% vs 45.02%）含量显著高于低pH环境组。转录组分析发现了1622个差异表达基因，其中关键基因glna的表达显著上调。代谢组学进一步发现了181种差异代谢物，如2-磷酸-d-甘油酸和苏氨酸，这些代谢物显著富集，并共同促进了风味物质和氨基酸的合成。相比之下，在低pH环境组中，多种与脂质相关的代谢物（如甘油磷酸）和脂肪合成基因（如fasn和acslBacilloplasma的丰度显著增加。Rhodobacteraceae家族中的一些未分类微生物群体也表现出富集现象。PICRUSt2功能预测显示，这些微生物类群在氨基酸代谢和其他与营养相关的途径中显著富集，它们的结构变化共同促进了宿主体内营养物质的积累。本研究从分子层面定量探讨了高pH环境可能通过哪些潜在调控途径改善小龙虾的风味和营养价值。

图形摘要

环境pH值是影响小龙虾营养价值的关键因素，但其背后的机制尚不清楚。本研究通过多组学分析初步揭示了pH值对小龙虾营养代谢影响的潜在调控途径。结果显示，在高pH环境下，小龙虾中的粗蛋白（18.03% vs 16.82%）、总氨基酸（TAA）（13.25% vs 12.67%）和多不饱和脂肪酸（PUFA）（55.38% vs 45.02%）含量显著高于低pH环境组。转录组分析发现了1622个差异表达基因，其中关键基因glna的表达显著上调。代谢组学进一步发现了181种差异代谢物，如2-磷酸-d-甘油酸和苏氨酸，这些代谢物显著富集，并共同促进了风味物质和氨基酸的合成。相比之下，在低pH环境组中，多种与脂质相关的代谢物（如甘油磷酸）和脂肪合成基因（如fasn和acslBacilloplasma的丰度显著增加。Rhodobacteraceae家族中的一些未分类微生物群体也表现出富集现象。PICRUSt2功能预测显示，这些微生物类群在氨基酸代谢和其他与营养相关的途径中显著富集，它们的结构变化共同促进了宿主体内营养物质的积累。本研究从分子层面定量探讨了高pH环境可能通过哪些潜在调控途径改善小龙虾的风味和营养价值。

图形摘要