《Journal of Hepatocellular Carcinoma》：Comprehensive Evaluation and Validation Reveal Mitochondrial Solute Carrier SLC25A3 as a Novel Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Hepatocellular Carcinoma
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本研究通过生物信息学分析与实验验证，系统揭示线粒体磷酸转运蛋白SLC25A3在肝细胞癌（HCC）中显著高表达且启动子呈现低甲基化状态。SLC25A3表达水平与T分期、组织学分级、AFP水平、血管侵犯等临床病理特征正相关，是独立预后因素。功能实验证实沉默SLC25A3可抑制HCC细胞增殖、迁移、侵袭并促进凋亡。研究进一步构建基于SLC25A3共表达枢纽基因（SNRPB/EFTUD2/SF3A3/SNRPA1）的预后模型，并揭示其通过调控RNA剪接、细胞周期等通路驱动HCC进展，为HCC诊疗提供新靶点。
Abstract
研究首次通过整合TCGA数据库与GEO数据集（GSE39791等6个队列），发现SLC25A3在HCC组织中显著上调（P< 0.001），且其启动子区域呈现低甲基化状态。Pan-cancer分析显示SLC25A3在17种癌症中异常高表达，提示其广谱致癌潜力。
Introduction
肝细胞癌（HCC）作为原发性肝癌主要亚型，全球发病率第六、死亡率第三，其发生与HBV/HCV感染、代谢性疾病等因素密切相关。尽管手术及免疫治疗取得进展，晚期HCC预后仍差，亟需新型生物标志物。线粒体溶质载体家族（SLC25）调控代谢物转运，多项成员被报道参与HCC进展，但SLC25A3（磷酸/铜转运蛋白）在HCC中的作用尚未明确。
Material and Methods
研究结合TCGA多组学数据与体外实验（qRT-PCR、CCK-8、Transwell等），系统分析SLC25A3表达、遗传变异、临床关联性及免疫浸润特征。通过PPI网络筛选共表达枢纽基因，并利用LASSO回归构建预后模型。功能实验采用siRNA沉默SLC25A3，验证其对HCC细胞表型的影响。
Results
SLC25A3在HCC中上调
TCGA数据显示SLC25A3在肿瘤组织中表达显著高于正常组织（配对样本***P< 0.001），六项GEO数据集一致性验证此趋势。遗传变异分析显示SLC25A3突变频率仅0.3%，但其启动子甲基化水平显著降低，cg16871561等7个位点甲基化与表达负相关。
临床关联性与预后价值
SLC25A3高表达与晚期T分期、高组织学分级、AFP升高、血管侵犯及残留肿瘤显著相关（均P< 0.05）。生存分析表明高表达组OS与DSS更差（P< 0.05），多因素Cox回归确认其为独立预后因素（HR = 1.834, P= 0.008）。ROC曲线显示SLC25A3对HCC诊断AUC达0.925。
免疫细胞浸润特征
SLC25A3表达与Th17、CD8+T细胞等6类免疫细胞浸润负相关，而与Th2、TFH细胞及巨噬细胞正相关，提示其可能塑造免疫抑制微环境。
共表达网络与预后模型
筛选出1044个SLC25A3共表达基因（|Spearman’s r| > 0.4），PPI网络识别TOP10枢纽基因（如SNRPF、SNRPB等）。基于LASSO回归构建四基因（SNRPB/EFTUD2/SF3A3/SNRPA1）预后模型，风险评分可独立预测OS（HR = 1.648, P= 0.005）。富集分析显示共表达基因主要富集于RNA剪接、核糖体生物合成及细胞周期通路。
实验验证
qRT-PCR证实SLC25A3在5种HCC细胞系（如HepG2、MHCC97L）中均高表达。沉默SLC25A3后，CCK-8及克隆形成实验显示细胞增殖能力下降，流式细胞术检测凋亡率上升，Transwell实验表明迁移侵袭能力受抑。BSP验证HCC细胞中SLC25A3启动子CpG岛低甲基化状态。
Discussion
本研究首次系统阐明SLC25A3通过表观遗传调控在HCC中异常高表达，其表达水平与临床恶性特征及免疫微环境重塑相关。功能实验证实SLC25A3促进HCC恶性表型，其共表达网络提示其可能通过调控RNA加工与细胞周期驱动肿瘤进展。局限性在于缺乏体内实验验证及前瞻性临床队列。
Conclusion
SLC25A3作为HCC新型预后生物标志物与治疗靶点，为HCC的分子分型与靶向治疗提供理论依据。
