《Computational Biology and Chemistry》:Fractional-order modelling of cancer cell population dynamics affected by radiation
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本文提出了一种基于Caputo分数阶导数的细胞周期模型,用于刻画辐射影响下的癌细胞群体动力学。研究通过贝叶斯框架下的马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)采样,量化了乳腺癌(MCF-7)与肺癌(A549)细胞在G1/S/G2M期相变的异质性(如G2M→G1速率分别为0.2 h?0.9和0.189 h?0.9),为放疗敏感性差异提供了数理依据。
章节精选
预备知识
定义2.1(Garrappa, 2018)
设函数f(t) ∈ L1([t?, T]),其Riemann-Liouville分数阶积分算子定义为:
Jt?θf(t) ? [1/Γ(θ)] ∫t?t(t-τ)θ?1f(τ) dτ (θ > 0)
定义2.2(Garrappa, 2018)
Caputo导数定义为:
Dt?θ? Jt?m?θDmf(t) = [1/Γ(m?θ)] ∫t?t(t-τ)m?θ?1f(m)(τ) dτ
其中m = ?θ?,Dmf(t)为函数f的m阶导数。
定义2.3(Diethelm, 2010)
双参数Mittag-Leffler函数定义为:
En?,n?(z) ? Σj=0∞[zj/ Γ(j n? + n?)] (n?, n? > 0)
模型构建
基于Simms等人提出的细胞周期ODE模型,本研究将G1期细分为Ga、Gb、Gc三个亚相(其中Ga为存储相),并引入分数阶导数以捕捉细胞相变的历史依赖性(即"记忆效应")。
解的性质分析
本研究证明:从非负初始条件出发,模型解在G1/S/G2M期的细胞比例始终保持非负性与有界性,且存在唯一解位于生物合理区间内。
方法与结果
通过流式细胞术检测辐照后细胞DNA含量,量化各时期细胞比例。结合贝叶斯反演方法(参见Fan等人研究),利用MCMC采样估计模型参数,并通过迹线图评估参数收敛性。
贝叶斯参数估计
基于贝叶斯定理:后验概率 ∝ 似然函数 × 先验概率,采用PyMultinest工具实现参数估计,解决了分数阶模型中的反问题挑战。
示例分析
以MCF-7和A549细胞系为例,基于照射后0/6/24小时的细胞周期比例数据,发现:
- •
G2M→G1相变速率高度相似(0.2 h?0.9vs. 0.189 h?0.9);
- •
MCF-7细胞的G1→S相变速率显著快于A549(0.159 h?0.9vs. 0.095 h?0.9),提示乳腺癌细胞具有更强的周期推进能力。
结论
分数阶模型通过引入记忆效应,更精准地描述了辐射诱导的细胞周期重分布,为优化放疗策略提供了动态量化工具。