河南省200份小麦品种苗期茎基腐病抗性鉴定与全基因组关联分析

　　

摘要： 小麦茎基腐病(Fusarium crown rot, FCR)是世界性小麦土传真菌性病害。近年来，该病害在我国长江中下游及黄淮麦区持续加重发生。然而，当前国内缺乏抗病性突出的小麦品种资源。因此，筛选抗病种质、挖掘抗病基因已成为小麦抗性育种的重要研究方向。为筛选FCR的优异抗源、挖掘抗病基因，本研究利用黄淮麦区优势病原菌假禾谷镰刀菌(F. pseudograminearum)菌株WZ-8A，对133份地方品种及67份现代品种进行苗期抗性鉴定，并利用获得的表型数据结合小麦660K基因型数据进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。结果表明，供试品种中仅秃头麦(杞县)、早洋麦、百泉41、开麦18、周麦24、04中36、豫麦35、中育3号8个品种表现中抗。GWAS分析共检测到30个与抗性显著相关的位点，其中2个位点(SNP AX-111055517和SNP AX-110584552)在多种模型及环境下稳定出现。进一步对这2个显著位点所在的基因组区域进行基因功能注释及表达模式分析，发现基因TraesCS4B02G048500可能为潜在抗病候选基因。本研究鉴定出8个苗期中抗种质材料，挖掘到的显著性位点和预测基因为后续抗病育种等工作提供了资源、思路和理论依据。