《New Phytologist》:Circular RNAVv-circCOR27 modulates thermotolerance through attenuating VvHSP90.2b-VvHsfA7a interaction in grapevine
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本综述系统解析了葡萄中环状RNA Vv-circCOR27在热胁迫应答中的新型调控机制。研究发现,Vv-circCOR27通过直接结合分子伴侣VvHSP90.2b,竞争性抑制其与热激转录因子VvHsfA7a的相互作用,从而负向调控下游小热激蛋白(sHSP)基因的表达,最终降低植物的耐热性。该工作首次揭示了植物circRNA通过“分子海绵”机制调控HSP90-Hsf信号通路,为理解非编码RNA在植物高温应答中的功能提供了新视角。
环状RNA Vv-circCOR27的鉴定与表达分析
研究团队在葡萄中鉴定出一个长度为502核苷酸的环状RNA分子,命名为Vv-circCOR27。该分子由VvCOR27基因的第二和第三外显子通过反向剪接形成,其环化连接点(AG/GA)经过全长克隆和Sanger测序验证。表达分析显示,Vv-circCOR27在热胁迫(45°C)下表达受到抑制,且在耐热性强的葡萄品种中表达水平显著低于热敏感品种。亚细胞定位实验表明该circRNA同时定位于细胞质和细胞核。
Vv-circCOR27过表达加剧热敏感性
为探究其功能,研究团队开发了“内含子保留”策略,通过在外显子中插入额外内含子,成功构建了以产生circRNA为主的过表达载体,有效降低了同源线性RNA的背景表达。在葡萄胚性愈伤组织和幼苗中的过表达实验表明,Vv-circCOR27的过量表达会显著加剧热胁迫导致的组织褐化损伤,表现为叶绿素荧光参数(Fv/Fm)下降以及丙二醛(MDA)和过氧化氢(H2O2)含量升高,证明其负向调控葡萄的耐热性。
Vv-circCOR27直接结合VvHSP90.2b并干扰其与VvHsfA7a的相互作用
通过体内交联circRNA pull-down结合质谱分析,发现Vv-circCOR27能与热休克蛋白90.2b(VvHSP90.2b)直接结合。进一步的RNA免疫共沉淀(RIP)和环状RNA三分子荧光互补(cTriFC)实验证实了二者在体内的直接互作。机制研究表明,VvHSP90.2b能与热激转录因子VvHsfA7a发生相互作用。而Vv-circCOR27的过表达会竞争性结合VvHSP90.2b,从而削弱VvHSP90.2b与VvHsfA7a的结合。
VvHsfA7a调控下游小热激蛋白基因的表达
DNA亲和纯化测序(DAP-seq)分析揭示了VvHsfA7a的结合基序(CNNGAANNTTC),并发现其可结合到多个小热激蛋白(sHSP)基因的启动子区。酵母单杂交(Y1H)实验验证了VvHsfA7a与sHSP基因启动子的特异性结合。在热胁迫下,VvHsfA7a表达被强烈诱导(上调300-400倍),并激活包括HSP15.7、HSP17.3、HSP18.2c等在内的9个sHSP基因的表达。在Vv-circCOR27过表达的愈伤组织中,这些sHSP基因的诱导表达水平显著低于野生型。
工作模型
本研究提出了一个Vv-circCOR27调控葡萄耐热性的工作模型:在正常条件下,Vv-circCOR27表达水平较高,它通过结合VvHSP90.2b,可能阻碍了VvHSP90.2b对VvHsfA7a的分子伴侣功能。在热胁迫下,Vv-circCOR27表达下调,解除了对VvHSP90.2b的抑制,使得VvHSP90.2b能够充分协助VvHsfA7a的转录激活功能,进而促进下游sHSP基因的表达,帮助细胞抵御热损伤。该研究阐明了circRNA作为一种新型调控因子,通过HSP90-HsfA7a-sHSP通路精细调控植物热胁迫应答的分子机制。