《Frontiers in Immunology》:M2 macrophage infiltration drives tumor progression and identifies a multigene prognostic signature in esophageal cancer
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本研究通过整合食管癌(EC)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,揭示M2型肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)驱动肿瘤进展的关键作用,并构建包含SPINK5、A2ML1、IL1RN和IL36G的四基因预后模型。实验验证表明,沉默IL1RN和IL36G可抑制M2极化,进而减弱食管癌细胞的增殖、迁移、侵袭及上皮-间质转化(EMT)。该研究为食管癌的免疫微环境调控提供了新靶点,且基因标签具有独立预后预测价值。
研究背景与目的
食管癌(EC)作为高死亡率消化道肿瘤,其肿瘤微环境(TME)中免疫细胞异质性显著影响预后。本研究旨在阐明M2型肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在EC进展中的机制,并构建M2巨噬细胞相关基因标签用于预后预测。
方法学创新
联合分析GEO与TCGA数据库中的scRNA-seq和bulk RNA-seq数据,通过Seurat和SingleR进行细胞注释,利用CIBERSORT和ssGSEA量化免疫浸润。采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选M2巨噬细胞相关模块基因,并与差异表达基因(DEGs)取交集,最终通过多变量Cox回归建立四基因(SPINK5、A2ML1、IL1RN、IL36G)预后模型。功能实验通过体外共培养体系和裸鼠移植瘤模型验证基因功能。
核心发现
- 1.
细胞异质性图谱:scRNA-seq鉴定出12种细胞类型,巨噬细胞为最主要免疫群体,M2亚型占主导且与患者生存负相关。
- 2.
预后模型构建:风险评分公式为:风险评分=0.67×SPINK5表达量+(-0.54)×A2ML1表达量+0.41×IL36G表达量+(-0.84)×IL1RN表达量。模型将患者分为高风险组和低风险组,低风险组总生存期显著延长(风险比HR=2.01, P<0.01),受试者工作特征曲线(ROC)曲线下面积(AUC)达0.677。
- 3.
基因功能验证:
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临床样本免疫荧光显示IL1RN和IL36G与M2标志物CD163共定位,且在肿瘤组织中高表达。
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体外实验中,沉默巨噬细胞的IL1RN或IL36G后,共培养的EC109和TE-1细胞增殖(CCK-8法)、迁移(划痕实验)及侵袭(Transwell实验)能力均下降,且上皮标志物E-钙黏蛋白(E-cadherin)上调,间质标志物N-钙黏蛋白(N-cadherin)和波形蛋白(Vimentin)下调。
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动物实验中,沉默IL1RN或IL36G可抑制移植瘤生长(肿瘤体积和重量减少)及肺转移(活体成像信号减弱),并降低Ki-67阳性率和EMT相关蛋白表达。
机制与意义
IL1RN(编码IL-1受体拮抗剂)和IL36G(白细胞介素36γ)通过调控巨噬细胞M2极化影响EC恶性表型。四基因标签不仅为EC预后分层提供工具,更提示靶向M2巨噬细胞相关通路(如IL-1信号通路)的治疗潜力。研究局限性包括模型预测精度需多中心数据验证,及体内实验未实现巨噬细胞特异性基因敲除。
结论
M2巨噬细胞相关基因标签(SPINK5/A2ML1/IL1RN/IL36G)是EC可靠的预后指标,其中IL1RN和IL36G作为关键调控因子,其沉默可抑制M2极化及肿瘤进展,为EC免疫治疗提供新方向。