《PhytoKeys》：Revision of
Amana yunjuensis (Liliaceae) based on morphological and molecular evidence: synonym of
Amana anhuiensis
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本研究针对2024年新发表的Amana yunjuensis物种有效性提出质疑，通过整合形态学比较、系统发育基因组学与群体遗传结构分析，证实其与A. anhuiensis无显著分化。结果表明二者在形态特征、核基因系统发育关系和祖先成分上高度一致，支持将A. yunjuensis归并为A. anhuiensis的异名，为Amana属的物种界定提供了多证据整合的分类学范式。
在植物分类学领域，物种的准确界定是研究生物多样性和进化关系的基础。然而，对于形态特征相对简单的类群，仅依靠传统形态学特征往往难以可靠划分物种界限。百合科（Liliaceae）Amana属便是这样一个典型例子——该属植物主要分布于东亚地区，近年来新物种发表频繁，但其种间差异多集中于鳞茎毛被密度、叶片形态等细微性状，且野外常出现过渡类型个体，给物种鉴定带来挑战。2024年，一篇研究报道了来自江西云居山的新种Amana yunjuensis，但这一分类处理很快受到学界质疑。
为厘清A. yunjuensis的分类地位，浙江树人大学的研究团队开展了多证据整合的分类学修订研究。通过系统的野外采样、形态性状量化比较、核基因系统发育重建以及群体基因组结构分析，研究人员发现：A. yunjuensis与A. anhuiensis在15个关键形态性状上完全重叠，鳞茎直径（p=0.222）、高度（p=0.791）等原认为的鉴别特征无统计学差异；系统发育树显示A. yunjuensis个体完全嵌套于A. anhuiensis支系内部（支持率100%）；ADMIXTURE分析进一步表明二者拥有相同的祖先成分，未检测到独有遗传组分。这些证据一致支持A. yunjuensis应作为A. anhuiensis的异名处理。该研究发表于国际植物分类学期刊《PhytoKeys》，为Amana属的物种划分提供了分子与形态证据相结合的范例。
关键技术方法包括：从安徽天柱山、江西云居山和庐山、湖北团风县等地采集的6个居群21份样本进行转录组测序（Illumina NovaSeq 6000平台）；利用OrthoFinder进行直系同源基因筛选，基于1,652个单系基因树构建最大似然系统发育树；采用主坐标分析（PCoA）比较15项形态性状，并通过ADMIXTURE软件（K=2~6）解析466万多个SNP的群体遗传结构。
形态学比较
对鳞茎、苞片、叶片等15个性状的主坐标分析表明，A. yunjuensis与A. anhuiensis的形态分布区域高度重叠（PCoA1+PCoA2累计解释78.7%变异），Wilcoxon检验显示二者鳞茎直径、高度及体积指数均无显著差异，证明原发表时依据的形态鉴别特征实为种内变异。
系统发育分析
基于核基因的系统发育树将A. yunjuensis个体（LJK63、WMZ1499）完全嵌套于A. anhuiensis支系内，并与江西庐山居群（WMZ1755）形成最近姐妹关系，支持率100%，表明二者未形成独立进化谱系。
混合分析
ADMIXTURE分析在所有K值（2~6）下均显示A. yunjuensis与A. anhuiensis居群具有完全一致的祖先成分，未出现私有遗传组分，进一步佐证其遗传一致性。
研究结论强调，形态无鉴别性、系统发育嵌套关系及遗传成分的同一性共同证实A. yunjuensis不构成独立物种，应作为A. anhuiensis的异名。这一修订不仅澄清了Amana属的分类混乱，更凸显了整合基因组学与形态学证据在近缘种界定中的必要性，尤其适用于存在频繁杂交渐渗的植物类群。论文还更新了A. anhuiensis的地理分布范围（新增江西云居山、庐山和湖北团风县居群），并依据IUCN标准建议将其评估为易危（VU）等级，为后续保护生物学研究奠定基础。
