《Scientific Reports》:RNA sequencing reveals differential expression of circular RNAs in human small cell lung cancer
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本研究通过RNA测序技术揭示小细胞肺癌(SCLC)中23个差异表达环状RNA(DECs)的调控网络,发现circLIFR和circCAMSAP1通过吸附miR-1234-3p/miR-375-3p等分子形成竞争性内源RNA(ceRNA)轴,其表达水平与治疗反应相关且具备显著诊断价值(AUC分别达0.9177/0.764),为SCLC分子分型提供新靶点。
小细胞肺癌(SCLC)作为肺癌中侵袭性最强的亚型,因其高转移率和快速耐药性导致患者五年生存率不足7%。尽管近年来基于分子分型的靶向治疗取得进展,但环状RNA(circRNA)在这一“癌王”中的表达图谱和功能机制仍是空白。这类具有共价闭合环状结构的非编码RNA,因其稳定性高和组织特异性强,已成为肿瘤研究的新焦点。
技术方法概要
研究团队通过RNA测序(RNA-seq)对比SCLC组织与正常肺组织的circRNA表达,利用CircInteractome和miRTarBase数据库预测miRNA-mRNA相互作用,采用qRT-PCR(定量实时聚合酶链反应)验证关键分子表达,并通过受试者工作特征曲线(ROC)评估诊断效能。
差异表达环状RNA的筛选与验证
RNA-seq鉴定出23个DECs,其中10个下调、13个上调。qRT-PCR证实circLIFR在SCLC中显著低表达,而circCAMSAP1明显高表达。
ceRNA调控网络构建
23个DECs可结合241种miRNA,调控7804个下游mRNA。circLIFR相关网络包含26个miRNA(如miR-1234-3p和miR-375-3p)及2447个mRNA靶点;circCAMSAP1网络涉及14个miRNA(如miR-145-5p)和553个mRNA。
临床相关性分析
circCAMSAP1表达与治疗反应显著相关,circLIFR和circCAMSAP1的诊断AUC(曲线下面积)分别为0.9177和0.764,提示二者可作为潜在生物标志物。
结论与展望
本研究首次绘制SCLC的circRNA-miRNA-mRNA调控图谱,揭示circLIFR/circCAMSAP1通过“分子海绵”作用影响肿瘤恶性表型。结果发表于《Scientific Reports》,为SCLC的早期诊断和靶向治疗提供新思路,但后续需功能实验验证机制。