太行山地区南方红豆杉SSR遗传多样性分析

　　

摘要：

目的 红豆杉（Taxus spp.）为国家一级濒危保护植物，阐明太行山地区南方红豆杉种群遗传多样性和遗传变异，可为南方红豆杉遗传多样性保护及培育新品种提供指导。 方法 基于前期筛选出的8对稳定性和多态性良好的SSR引物，对太行山区的9个南方红豆杉种群以及3个来自浙江、湖南和福建3省的南方红豆杉种群（共106个体）的遗传多样性和遗传变异进行分析。 结果 12个南方红豆杉种群的平均观测等位基因数（Na）为2.781，平均有效等位基因数（Ne）为2.074，Shannon多样性指数（I）为0.679，平均观测杂合度Ho=0.390，平均期望杂合度He=0.381。通过对种群间遗传分化指数（Fst）和基因流强度（Nm）进行分析发现，太行山区南方红豆杉种群间大多为中低水平的遗传分化（Fst<0.15）且存在较为频繁的基因交流（Nm>>1），而太行山区的南方红豆杉种群与来自浙江、湖南和福建3省的南方红豆杉种群的分化程度较高（Fst>0.25），基因交流水平低（Nm<1）。此外，AMOVA分析显示，南方红豆杉的遗传变异主要发生在个体内，种群间和个体间的遗传变异占比较低。STRUCTURE分析和聚类分析表明，106份材料可以分成2大类，其中福建、湖南和浙江省份种源聚为一类，太行山地区的南方红豆杉聚为一类，且大多数样品间彼此相互混杂，具有较为丰富的遗传背景。 结论 南方红豆杉种群整体具有较丰富的遗传多样性，但太行山区种群的遗传多样性相对偏低。该区域内种群间呈现中低水平的遗传分化，基因交流程度较高；然而，太行山区种群与低纬度地区种群间则表现出较高的遗传分化。