欧亚大陆高致病性禽流感A(H5)病毒基因重配时空动态及环境驱动因素研究（2000–2023）

《Scientific Reports》：Integrated approaches to explore temporal-spatial changes in gene reassortment of highly pathogenic avian influenza A(H5) virus in Eurasia, 2000–2023

本研究针对Gs/Gd谱系H5高致病性禽流感病毒通过基因重配加剧宿主适应性问题，开展了2000–2023年欧亚大陆时空动态研究。研究人员通过基因型演化和环境因子关联分析，发现H5N1从单基因型主导转变为多基因型共循环，最终形成区域性流行模式，并确定雁形目、鸻形目和雀形目鸟类与重配热点显著相关。该研究为精准防控策略制定提供了关键科学依据。

　　

自1997年鹅/广东/1996谱系（Gs/Gd）H5N1高致病性禽流感病毒出现以来，其通过不断与低致病性禽流感病毒（LPAIV）发生基因重配，导致血凝素（HA）基因多样性增加，显著增强了对不同宿主的适应能力。这种基因变异使得病毒传播范围持续扩大，给全球家禽养殖业和公共卫生安全带来严峻挑战。然而，病毒重配事件的时空分布规律及其背后的环境驱动机制尚不明确，制约了有效监测策略的制定。

为系统揭示H5病毒在欧亚大陆的演化轨迹，研究团队对1997–2023年全球禽流感病毒序列数据库进行深度挖掘，通过三阶段研究设计精准定位高致病性禽流感H5病毒的基因重配热点（RA-hotspots），并分析其与生态环境因子的关联。该研究发表于《Scientific Reports》，首次全面绘制了H5病毒基因型演化的时空图谱。

关键技术方法包括：1）对全球禽流感病毒基因组数据库进行系统筛选与基因分型；2）采用匹配配对研究法分析鸟类宿主类群与重配热点的关联性；3）运用时空动态模型追踪病毒基因型的演变规律。所有病毒序列均来自全球禽流感基因库（GISAID）等公开数据库。

研究结果揭示三大核心发现：

1. 1.
   基因型演变呈现三阶段特征：2000–2013年为单基因型主导期，2014–2021年进入多基因型共循环阶段，2022–2023年发展为区域性流行模式。共鉴定出136种基因型，证明病毒遗传复杂性持续增加。
2. 2.
   重配热点与环境因子的关联分析显示，雁形目（Anseriformes）、鸻形目（Charadriiformes）和雀形目（Passeriformes）鸟类活动与重配热点呈显著正相关。
3. 3.
   环境驱动因子完成从水禽到陆禽的转变，表明病毒传播生态位发生重要转型。

结论部分强调，H5 HPAIV的基因重配动态与鸟类宿主生态特征存在紧密耦合关系。该研究首次系统量化了重配热点的形成机制，为建立靶向性监测网络提供了理论依据。作者在讨论中指出，针对特定鸟类目类开展重点监测，将有效提升早期预警能力，对制定区域性防控策略具有重要指导意义。