《Scientifica》:Phytochemical Profiling and Computational Docking Studies Revealing the Potential Anticancer and Antioxidant Properties of Heliotropium indicum L.
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本研究通过植物化学分析、体内抗肿瘤实验及计算模拟,系统揭示天芥菜(Heliotropium indicum L.)的药用潜力。其氯仿组分(CHF)在Ehrlich腹水癌(EAC)模型中抑制肿瘤生长达76.39%,并通过分子对接与分子动力学(MD)模拟证实关键成分(如酚类衍生物)可稳定结合拓扑异构酶II(Topoisomerase II),且具备抗氧化(如清除AAPH诱导的DNA损伤)及调控凋亡通路(如TP53增强)的多重作用机制,为天然抗肿瘤药物开发提供新视角。
摘要
本研究采用植物化学分析、生物学实验与计算模拟相结合的策略,探究天芥菜(Heliotropium indicum L.)的抗癌与抗氧化潜力。气相色谱-质谱(GC–MS)分析鉴定出酚类化合物3,5-双(1,1-二甲基乙基)酚为主要成分。氯仿组分(CHF)在Ehrlich腹水癌(EAC)模型中表现出显著的体内抗肿瘤活性,肿瘤生长抑制率达76.39%,与博来霉素(80.36%)效果相当。CHF在卤虫致死实验中亦显示强细胞毒性(LC50?=?28.96?μg/mL),并能保护DNA免受AAPH诱导的氧化损伤。分子对接揭示关键成分与拓扑异构酶II结合稳定,分子动力学(MD)模拟与MM–PBSA结合能计算进一步支持这一结果。
1. 引言
癌症仍是全球健康的主要挑战之一,亟需更安全有效的治疗策略。Ehrlich腹水癌(EAC)模型因易移植和快速增殖特性,被广泛用于评估抗肿瘤及氧化应激反应。天然产物因其能够抑制肿瘤生长并保护正常细胞免受氧化DNA损伤而备受关注。氧化应激通过活性氧(ROS)诱导碱基修饰、DNA链断裂及突变(如8-氧鸟嘌呤),是致癌的重要机制。植物源性抗氧化剂(如酚类、黄酮类)在中和ROS及调节炎症、细胞周期和凋亡通路中发挥关键作用。天芥菜(Heliotropium indicum)作为传统药用植物,已知含黄酮、酚酸、萜类及吡咯里西啶生物碱(PAs),但其抗癌潜力尤其是结合实验与计算方法的系统研究仍较缺乏。本研究通过体内EAC模型、GC–MS分析、分子对接、MD模拟及MM–PBSA结合能计算,综合评估天芥菜的生物活性。
2. 材料与方法
植物样本采集自孟加拉国Rajshahi地区,经鉴定后制备甲醇粗提物(CME)及其极性分段(正己烷NHF、氯仿CHF、乙酸乙酯EAF)。通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)分析官能团,GC–MS鉴定化学成分。采用卤虫致死实验评估细胞毒性,EAC模型测试体内抗肿瘤活性,并通过DNA损伤保护实验(AAPH诱导)评估抗氧化能力。计算分析包括PASS活性预测、分子对接(AutoDock Vina)、分子动力学(MD)模拟(GROMACS)及MM–PBSA结合自由能计算。
3. 结果
3.1. FTIR分析官能团
FTIR显示天芥菜甲醇提取物在3351.02 cm?1处有强羟基吸收峰,2924.66 cm?1和2854.21 cm?1为烷基伸缩振动,1731.51 cm?1处为羰基峰,1633.58 cm?1提示芳香环或C=C键,表明含酚类、黄酮及多糖等成分。
3.2. GC–MS分析
GC–MS鉴定出14种主要成分,其中3,5-双(1,1-二甲基乙基)酚占比最高(69.23%),其余包括苯甲醚、长链烯烃及酯类化合物。
3.3. DNA氧化损伤保护
CHF、EAF及CME均能显著减轻AAPH引起的DNA断裂,其中EAF保护效果最佳,与抗坏血酸相当。
3.4. 卤虫细胞毒性
所有提取物均呈现剂量依赖性毒性,CHF的LC50为28.96 μg/mL,接近阳性对照长春新碱(16.60 μg/mL)。
3.5. 体内抗肿瘤活性
CHF(200 mg/kg)抑制EAC肿瘤细胞增长76.39%,并改善EAC模型小鼠的血清总蛋白、白蛋白及转氨酶(SGOT/SGPT)水平。细胞形态学显示CHF处理组肿瘤细胞出现凋亡特征。
3.6. 计算分析
3.6.1. PASS预测
3,5-双(1,1-二甲基乙基)酚被预测具有TNF表达抑制(Pa?=?0.659)、TP53增强(Pa?=?0.581)及自由基清除活性,与实验结论相符。
3.6.2. 分子对接
该酚类化合物与拓扑异构酶II活性位点(Asp1004、Trp840等)形成氢键及疏水作用,结合能为?6.6 kcal/mol。
3.6.3. MD模拟
100 ns模拟显示蛋白-配体复合物RMSD稳定在2.5 ?以内,关键残基波动低于2.0 ?,结合自由能达?45.3 kcal/mol,表明结合稳定。
3.6.4. 配体效率(LE)与抑制常数(Ki)
酚类成分的LE为0.35 kcal/mol/重原子,Ki约14.2 μM,提示其具良好成药潜力。
4. 讨论
天芥菜活性成分(尤其是CHF中的酚类物质)通过抗氧化、拓扑异构酶II抑制及凋亡通路调控发挥抗肿瘤作用。FTIR与GC–MS结果相互印证,PASS预测与分子对接揭示了其多靶点作用机制。然而,本研究未针对吡咯里西啶生物碱(PAs)进行毒理筛查,且MD模拟时长有限,需进一步通过延长模拟、PA特异性检测及组织病理学验证以完善结论。
5. 局限性与展望
未来需开展300 ns以上MD模拟、静电势(ESP)映射、PA专项分析及ADME/Tox评估,以明确其安全性及机制细节。
6. 结论
天芥菜提取物尤其富含3,5-双(1,1-二甲基乙基)酚的CHF组分,通过抗氧化、DNA保护及拓扑异构酶II抑制展现抗肿瘤潜力。计算模拟为关键成分的作用机制提供理论支持,但需进一步实验验证其成药性与安全性。