整合转录组与代谢组分析揭示西伯利亚冰草UV-B辐射耐受性的基因型差异机制

《Plant Physiology and Biochemistry》:Integrated Transcriptomic and Metabolomic Profiling Reveals Genotypic Differences in UV-B Radiation Tolerance Mechanisms in Elymus sibiricus L.

【字体: 时间:2026年02月08日 来源:Plant Physiology and Biochemistry 5.7

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  本研究针对青藏高原强UV-B辐射影响植物分布与发育的关键问题,通过整合表型生理学、转录组学和代谢组学方法,系统解析了西伯利亚冰草(Elymus sibiricus L.)耐辐射基因型(SC)与敏感基因型(XJ)的差异调控网络。研究发现MYB、WRKY等转录因子通过苯丙烷代谢和UVR8信号传导介导UV-B响应,热休克蛋白HSP702/704作为新型抗性组分,协同30种代谢物激活抗坏血酸代谢及光合碳固定等8条关键通路。该研究为禾本科植物抗UV-B育种提供分子靶点与遗传资源,对高原生态修复具有重要意义。

青藏高原强烈的紫外线-B(UV-B)辐射是影响植物分布和发育的关键环境限制因子。西伯利亚冰草(Elymus sibiricus L.)作为该地区牧草地建设和生态修复的重要多年生草种,其应对UV-B胁迫的分子机制尚不明确。目前,高原特有草种在UV-B耐受性与敏感性基因型间的差异调控网络,以及长期与短期胁迫下的动态响应规律仍是研究空白。为此,研究团队在《Plant Physiology and Biochemistry》发表论文,通过多组学整合分析系统揭示了西伯利亚冰草UV-B耐受性的分子基础。
研究采用UV-B辐射耐受型(SC020 2-A1)和敏感型(XJ007 22-A5)基因型为材料,以288 kJ/m2的辐射强度模拟高原环境,分别于胁迫0、5、10、15、20天采集叶片样本。通过转录组测序(RNA-seq)和超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)技术,结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和转录-代谢物关联分析,解析基因表达与代谢物积累的协同调控网络。关键实验还包括qRT-PCR验证差异表达基因(DEGs),以及通过KEGG、GO富集分析筛选核心通路。

3.1 西伯利亚冰草在UV-B辐射下的表达谱综合分析

主成分分析(PCA)显示,两种基因型在UV-B胁迫下基因表达模式显著分离,敏感型XJ比耐受型SC激活更多差异表达基因(DEGs),且长期胁迫下DEGs数量显著增加。

3.2 UV-B辐射胁迫下的DEGs分析

共鉴定21,773个基因,SC和XJ基因型分别特有5,076和4,541个DEGs。短期胁迫下,SC基因型通过抗坏血酸代谢和植物激素信号通路快速响应;长期胁迫下,两者均增强光合碳固定途径。

3.3 XJ与SC的基因表达模式比较

WGCNA分析发现MEdarkturquoise模块与花青素、叶绿素含量正相关,MElightgreen模块则呈负相关。SC基因型在短期胁迫中优先上调NAC、C2H2等转录因子,而XJ基因型在长期胁迫中激活更多bHLH、MYB转录因子。

3.4 西伯利亚冰草对短期和长期UV-B辐射的响应

短期胁迫下,SC基因型显著富集于酪氨酸代谢、MAPK信号通路;XJ基因型则主要激活氨基酸合成与光合作用相关通路。长期胁迫下,两者均增强苯丙烷生物合成和碳固定途径。

3.5 转录因子与UV-B胁迫响应基因

热休克蛋白HSP702和HSP704被鉴定为新型UV-B抗性组分。共筛选出20个关键转录因子(如EsMYB、EsbHLH)与30个代谢物(如皮质酮)协同调控抗坏血酸代谢网络。

3.6 qRT-PCR验证

9个关键基因的表达趋势与转录组数据一致,证实SC基因型通过持续上调抗坏血酸代谢基因(EsC3H、EsbHLH)增强抗氧化能力,而XJ基因型则出现光合相关基因下调。

3.8 抗坏血酸代谢途径的基因调控与代谢网络

整合分析显示,抗坏血酸代谢途径是UV-B应激的核心响应通路。EsMYB、EsTCP等转录因子通过调控D-葡萄糖醛酸、松柏苷等代谢物,维持氧化还原稳态。
研究结论表明,西伯利亚冰草通过基因型特异的转录-代谢重编程应对UV-B胁迫:耐受型SC优先激活抗氧化与次生代谢通路,敏感型XJ则依赖激素信号转导但伴随能量代谢衰退。该研究首次揭示HSP702/704在禾本科植物UV-B抗性中的功能,为高原牧草育种和生态系统恢复提供理论依据与遗传资源。

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