《Results in Chemistry》:Astaxanthin–Zn2+ complexes and glycated human serum albumin: A molecular mechanism study for protein integrity in diabetes mellitus
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本研究针对糖尿病等慢性代谢疾病中糖化人血清白蛋白(gHSA)结构破坏和功能丧失的问题,通过计算生物学方法系统探讨了虾青素-Zn2+复合物的分子稳定作用。研究发现3:1 M比例的ASX-Zn2+复合物能显著提升gHSA结构稳定性,改善能量景观和残基相互作用网络,为开发抗糖化治疗新策略提供了重要理论依据。
在糖尿病等慢性代谢疾病的发展过程中,蛋白质糖化是一个不可忽视的分子水平病变。人血清白蛋白(Human Serum Albumin,HSA)作为血液中含量最丰富的载体蛋白,负责运输脂肪酸、激素和药物等多种物质。然而,在高血糖环境下,HSA会与葡萄糖发生非酶促反应,形成糖化终末产物(Advanced Glycation End-products,AGEs),导致蛋白质结构破坏和功能丧失。这种糖化形式的人血清白蛋白(glycated Human Serum Albumin,gHSA)表现出更高的柔韧性和更低的稳定性,成为糖尿病并发症发生发展的重要推手。
面对这一挑战,印度尼西亚茂物农业大学的研究团队将目光投向了自然界中的强效抗氧化剂——虾青素(Astaxanthin,ASX)。这种属于类胡萝卜素家族的化合物不仅具有出色的自由基清除能力,其独特的分子结构还允许它螯合过渡金属离子如Zn2+。先前的研究已经提示,虾青素与锌离子的复合物可能增强其生物活性,但这类复合物如何影响糖化蛋白质的结构稳定性,特别是其分子水平的作用机制,尚不清楚。
为了回答这一科学问题,研究人员在《Results in Chemistry》上发表了他们的最新研究成果。他们采用多层次的计算生物学方法,包括分子对接、粗粒度分子动力学模拟、自由能景观分析和残基相互作用网络分析,系统探讨了不同化学计量比的虾青素-Zn2+复合物与gHSA的相互作用。
研究团队主要运用了分子对接技术确定复合物与蛋白质的结合特性,通过分子动力学模拟评估蛋白质-配体复合物的构象稳定性,采用HullRad分析测定蛋白质的结构参数(如回转半径),利用自由能景观分析表征蛋白质的构象能量状态,并运用残基相互作用网络分析映射蛋白质内部的非共价相互作用网络。
3.1. 分子对接
分子对接结果显示,虾青素-Zn2+复合物比单独的虾青素对HSA和gHSA都具有更高的结合亲和力。特别是1:2比例的ASX-Zn2+复合物与天然HSA的结合能最低(-10.8 kcal/mol),而3:1比例的复合物在gHSA中表现出优异的结合特性。对接分析还揭示了关键的分子相互作用,包括与HIS146残基的金属-受体相互作用,这一残基已知负责协调Zn2+等二价金属离子。
3.2. 分子动力学
分子动力学模拟显示,ASX-Zn2+复合物对HSA和gHSA结构都有稳定作用。虽然1:2比例的复合物在视觉上保持最稳定的结构,但RMSF(均方根波动)数据表明3:1比例的复合物能更显著降低残基波动,特别是在糖化蛋白质中,表明其对构象稳定性的增强效果更佳。
3.3. 回转半径分析
HullRad分析表明,糖化导致HSA的结构参数发生轻微变化,如回转半径增加和水合值升高,提示结构扩张和表面暴露增加。而ASX-Zn2+复合物,特别是3:1比例,能逆转这些变化,使蛋白质更加紧凑,减少溶剂可及表面积,改善蛋白质的流体动力学特性。
3.4. 自由能景观
自由能景观分析显示,天然HSA具有单一的稳定能量盆地,而gHSA则呈现多个能量盆地,反映其构象不稳定性。加入ASX-Zn2+复合物后,特别是3:1比例,gHSA的自由能景观变得更加集中,表明复合物能限制糖化引起的过度构象波动。香农熵分析进一步证实,gHSA与ASX-Zn2+(3:1)复合物的熵值显著降低(2.0745),表明结构波动减少。
3.5. 残基相互作用网络分析
残基相互作用网络分析显示,糖化改变了HSA的残基连接性,而ASX-Zn2+复合物能增强或恢复相互作用网络。特别是1:2比例的复合物产生最密集和互连的网络,而3:1比例在gHSA中保持或增加网络复杂性。相互作用类型分析表明,范德华相互作用在所有条件下都占主导地位,而ASX-Zn2+复合物增加了氢键、离子和π-π堆积相互作用,增强了复合物的热力学和动力学稳定性。
本研究通过综合计算分析表明,虾青素-Zn2+复合物,特别是3:1 M比例,能有效稳定糖化人血清白蛋白的结构。这种稳定作用通过多种分子机制实现:增强结合亲和力、减少构象波动、降低结构熵值、恢复内部残基相互作用网络。复合物中的Zn2+通过与HIS146等关键残基的协调作用,以及增强的π-阳离子和疏水相互作用,共同促进了蛋白质结构的紧凑性和稳定性。
这一发现对理解金属-抗氧化剂复合物在调控蛋白质稳定性方面的作用提供了分子水平的见解,为开发针对糖尿病蛋白质糖化并发症的新型治疗策略奠定了理论基础。虾青素-Zn2+复合物展现出的多重稳定效应,使其成为未来抗糖化治疗或功能营养干预的潜在候选物,有望为改善糖尿病患者的蛋白质稳态提供新思路。