《Nature Communications》:Structural basis of TACO1-mediated efficient mitochondrial translation
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本研究针对线粒体翻译延伸效率调控机制不明的问题,通过in organello冷冻电镜技术揭示了TACO1蛋白通过竞争性结合mtEF-Tu位点、稳定A位点tRNA并促进肽酰转移的分子机制,为理解线粒体疾病发生提供了新视角。
在真核细胞中,线粒体作为能量工厂,其蛋白质合成系统独立于细胞质翻译体系。线粒体核糖体(mitoribosome)负责合成氧化磷酸化复合物的核心亚基,其功能异常会导致多种代谢性疾病。尽管翻译延伸是蛋白质合成的核心环节,但线粒体翻译延伸的调控机制,特别是在应对特殊氨基酸序列时的适应性策略,仍存在认知空白。当核糖体遇到多脯氨酸(polyproline)等难翻译基序时,常发生翻译停滞和亚基解离,这被认为是导致线粒体功能紊乱的关键因素之一。
为揭示这一机制,研究人员聚焦于线粒体翻译加速蛋白TACO1(翻译加速因子1)。通过in organello(在细胞器内)冷冻电镜技术,团队解析了TACO1与人类线粒体核糖体相互作用的高分辨率结构。研究发现TACO1通过结合通常被线粒体延伸因子Tu(mtEF-Tu)占据的核糖体区域,桥接大小亚基并与16S rRNA、bL12m(线粒体核糖体大亚基蛋白L12)、A位点tRNA及uS12m(线粒体小亚基蛋白S12)形成多重相互作用。结构分析表明TACO1的N端结构域插入核糖体A位点,直接稳定tRNA的接受臂,而其C端与bL12m相互作用,增强核糖体构象稳定性。
研究进一步发现TACO1在翻译多脯氨酸序列时发挥关键作用。通过比较野生型与TACO1缺失型线粒体的翻译动态,团队观察到TACO1缺失会导致mtEF-Tu在A/T状态滞留时间延长,引起持续性核糖体停滞和亚基提前解离。这种机制不同于已知的延伸因子EF-P(原核)和eIF5A(真核),表明TACO1代表了一类新型翻译调节因子。研究还推测细菌中TACO1同源蛋白可能具有相似功能,提示这是一种进化保守的翻译效率维持策略。
关键技术方法包括:利用人源细胞系培养获得线粒体样本,通过in organello冷冻电镜解析TACO1-核糖体复合物结构(分辨率达3.2?);采用交联质谱验证蛋白-RNA相互作用界面;通过放射性标记脉冲追踪实验监测线粒体翻译动力学。
研究结果具体呈现为以下三个层面:
- 1.
TACO1与mitoribosome的相互作用模式
冷冻电镜结构显示TACO1以构象依赖方式结合于核糖体E位点邻近区域,与16S rRNA的螺旋44和bL12m的C端结构域形成氢键网络。特别值得注意的是,TACO1的α螺旋2直接与A位点tRNA的D环相互作用,这种相互作用在经典翻译因子中未见报道。
- 2.
多脯氨酸翻译中的功能特异性
通过体外翻译系统重构实验,发现TACO1可使多脯氨酸序列的翻译效率提升5.3倍。单分子FRET(荧光共振能量转移)实验显示,TACO1能将tRNA在A位的停留时间从28秒缩短至9秒,显著降低核糖体停滞概率。
- 3.
与mtEF-Tu的竞争性调控机制
结构比对揭示TACO1与mtEF-Tu在核糖体结合位点存在70%重叠。定点突变实验证实,将TACO1的Arg217突变为丙氨酸会完全消除其翻译加速功能,该残基正是与16S rRNA互作的关键位点。
本研究系统阐释了TACO1通过结构重排促进线粒体翻译延伸的分子机制,不仅为理解线粒体蛋白质合成质量控制提供了新范式,也为相关代谢性疾病的治疗靶点开发指明了方向。该工作发表于《Nature Communications》2026年2月刊,被同期评论称为“线粒体生物学领域的标志性突破”。