《Limnology》：Mapping scientific production in the Tocantins–Araguaia Basin in Brazil Central: application of automated content analysis in freshwater studies
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为系统评估托坎廷斯-阿拉瓜亚流域的科学研究现状并识别知识空白，研究者采用自动化内容分析（ACA）和结构化主题模型（STM），对比了巴西主要流域的发表趋势与研究主题。研究发现该流域科学产出稳步增长，识别出“鱼类形态学”、“水生群落”等十大核心主题，并揭示了向土地利用、农业等应用性主题的转变趋势，为区域水资源保护提供了研究议程框架，其分析方法也为其他研究不足地区提供了可复制的路径。
在广袤的南美洲大陆深处，流淌着巴西的“水动脉”——托坎廷斯-阿拉瓜亚流域。这片面积约96.7万平方公里的土地不仅是地球上生物多样性最丰富的热点区域之一，滋养着无数独特的水生与陆地生物，更是巴西农业与能源生产的命脉所在。然而，在繁荣景象之下暗流涌动，大规模的水电开发、迅猛的农业扩张、持续的毁林活动以及重金属与农药污染，正如同多把悬在头顶的利剑，威胁着这片水域的健康与其中生命的未来。更令人担忧的是，与声名显赫的亚马逊河等“明星”流域相比，科学界对托坎廷斯-阿拉瓜亚流域的关注与研究投入相对不足，这导致我们对它的生物家底、生态过程以及人类活动影响的理解存在显著的“知识赤字”。面对日益加剧的环境压力与保护需求，一个根本性问题亟待回答：迄今为止，科学界究竟围绕这个流域研究了些什么？研究的重点是什么？又有哪些关键领域被忽视了？
为了解答这些问题，并勾勒出该流域科学研究的知识版图，一个研究团队开展了一项开创性的文献“测绘”工作。他们不再依赖传统、费时费力的人工文献综述，而是转向了大数据时代的利器——自动化内容分析（Automated Content Analysis, ACA）。这项研究如同一位高效的“科学侦探”，系统地检索、梳理并深入分析了数十年来关于托坎廷斯-阿拉瓜亚流域的数千篇科学文献，旨在揭示隐藏在海量文本背后的研究主题、趋势与空白。这项研究最终发表在期刊《Limnology》上，题为“Mapping scientific production in the Tocantins–Araguaia Basin in Brazil Central: application of automated content analysis in freshwater studies”。
研究者们运用了几个关键的技术方法来达成目标。首先，他们从Web of Science和Scopus两大核心数据库中系统检索了截至2024年关于托坎廷斯-阿拉瓜亚流域及相关淡水环境的学术论文，经过去重和筛选，最终构建了包含1522篇有效文献的语料库。核心分析采用了结构化主题模型（Structural Topic Modeling, STM），这是一种先进的文本挖掘技术，能够从大量文献摘要中自动识别出潜在的研究主题，并分析主题之间的关系及时空变化趋势。此外，研究还运用了词频分析、对应分析（Correspondence Analysis, CA）来对比托坎廷斯-阿拉瓜亚流域与巴西其他主要流域（如亚马逊、巴拉那、圣弗朗西斯科、巴拉圭）的研究主题差异，并通过构建主题相关网络和线性回归分析，探究了不同主题之间的关联强度及其随时间演变的规律。
研究结果揭示了以下几个关键发现：
巴西主要流域的发表趋势与主题特征：分析显示，所有主要巴西流域的科学论文产出均呈稳定增长趋势，其中亚马逊和巴拉那流域的论文数量最多。通过对应分析发现，托坎廷斯-阿拉瓜亚流域的研究主题与圣弗朗西斯科流域最为相似，两者均强调水生生物多样性、水电和土地利用变化等主题。相比之下，亚马逊流域的研究更关注森林生态与气候变化影响，而巴拉那流域则与古生物、地质学研究联系更紧密。
托坎廷斯-阿拉瓜亚流域的核心研究主题：通过STM分析，研究者从文献中识别出十个主要研究主题。其中，“鱼类形态学”是出现频率最高的主题，占比17%，侧重于鱼类的分类学和形态描述。其次是“水生群落”，占比14.2%，关注鱼类和浮游生物等群落在时空梯度下的结构与组成。其他重要主题包括“分子遗传学”、“水文与气候”、“农业实践”、“土地利用与塞拉多”、“生物多样性与化石”、“水坝与渔业”、“构造与地质”以及“土壤与污染”。词云分析进一步确认了“物种”、“河流”、“盆地”、“托坎廷斯”、“水”、“鱼”等是该流域文献中最核心的词汇。
主题间的相互关系：主题网络分析表明，大多数主题之间的词汇重叠度较低，相关性较弱，说明该流域的研究线条相对独立，跨主题整合不足。不过，“生物多样性与化石”和“农业实践”两个主题显示出较高的紧密中心性，意味着它们使用的词汇（如“物种”、“托坎廷斯”）也广泛出现在其他主题中，具有一定的桥梁作用。
研究主题的时空演化：时间趋势分析揭示了研究重心的转移。传统的“鱼类形态学”主题比例随时间呈现显著下降趋势。与此同时，一些应用性和跨学科的主题重要性日益凸显，包括“水生群落”、“农业实践”和“土地利用与塞拉多”，这些主题的比例随出版年份显著上升。这表明该流域的研究正从经典分类生态学，逐步转向更关注环境压力、资源管理和全球变化背景下的生态响应。
研究的结论与重要意义：
本项研究通过对托坎廷斯-阿拉瓜亚流域科学文献的全面测绘，得出了若干清晰且具有指导意义的结论。首先，尽管该流域的科学产出在增长，但其总体研究体量仍远小于亚马逊等流域，且存在显著的知识空白，例如入侵物种、环境DNA等全球前沿议题在此地的研究仍不足。其次，研究主题呈现出从传统形态分类学向应用生态学、土地利用管理和跨学科问题转变的明确趋势，这呼应了该区域正面临的农业扩张、水电开发和气候变化等多重压力。再者，流域内部（托坎廷斯河与阿拉瓜亚河）的研究焦点存在差异，提示未来的科学评估与保护政策需考虑这种空间异质性。最后，也是最重要的一点，当前各研究主题之间关联较弱，显示知识体系尚处于“碎片化”状态。
这项研究的意义深远。在实践层面，它首次为托坎廷斯-阿拉瓜亚流域绘制了一份详实的“科学研究地形图”，明确指出了当前的研究热点、演进轨迹以及亟待填补的空白，为科研资助机构、决策者以及当地科学家设定优先研究议程、合理配置资源提供了坚实的证据基础。在方法论层面，研究成功示范了如何将自动化内容分析、结构化主题模型等计算文本分析技术，创新性地应用于区域环境科学研究的综述与展望中，提供了一套高效、可复制的分析框架。这套框架能够快速处理海量文献，动态追踪科学前沿的演变，不仅适用于巴西的其他流域，也可推广至全球其他研究不足的生态系统，为全球生物多样性保护和可持续发展目标的实现，贡献了新颖有力的分析工具与知识梳理范式。
