《Scientific Reports》：SCARF1 deficiency exacerbates gut inflammation and autoimmune pathology
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本研究针对系统性红斑狼疮（SLE）发病机制中肠道微环境的作用，通过Scarf1?/?狼疮易感小鼠模型，结合宏基因组学分析，发现SCARF1缺失导致肠道菌群失调（如阿克曼菌缺失、厚壁菌/拟杆菌比率升高）、肠道免疫细胞浸润增加，并明确Alistipes等菌属与疾病严重度正相关，为SLE的微生物靶向治疗提供新视角。
在自身免疫疾病研究领域，系统性红斑狼疮（Systemic Lupus Erythematosus, SLE）一直因临床表现异质性强、发病机制复杂而困扰着医学界。近年来，科学家们逐渐将目光投向人体"第二基因组"——肠道微生物群，发现其在免疫调节中扮演着关键角色。但肠道微环境如何参与SLE的发生发展？其背后的分子机制仍是未解之谜。
值得注意的是，机体每天会产生大量凋亡细胞，及时清除这些"细胞尸体"的巨噬细胞清道夫功能（专业术语称为efferocytosis）若出现障碍，凋亡碎片会触发自身免疫反应。本研究聚焦的清道夫受体SCARF1（Scavenger Receptor Class F Member 1）正是介导这一过程的关键蛋白。此前研究发现，SCARF1缺陷会引发狼疮样疾病，但该受体是否通过调控肠道微环境影响SLE进展，尚待揭示。
为解开这一谜题，研究团队在《Scientific Reports》发表的研究中，构建了Scarf1?/?狼疮易感小鼠模型，采用全基因组鸟枪法测序（whole genome shotgun sequencing）进行宏基因组学分析，通过与健康小鼠对比，系统解析了SCARF1缺陷对肠道结构与微生物群落的影响。
主要技术方法
研究使用Scarf1基因敲除（Scarf1?/?）的狼疮易感小鼠模型，采集肠道组织与粪便样本，通过全基因组鸟枪测序技术生成宏基因组数据集，结合肠道组织病理学分析（包括肠道长度测量、免疫细胞浸润评估）和微生物群落多样性计算（α多样性、Firmicutes/Bacteroidetes比率），采用线性回归分析微生物丰度与疾病严重度的关联，并进行功能通路富集分析。
研究结果
肠道病理改变
Scarf1?/?小鼠表现出显著的肠道结构异常：肠道长度明显增加，结肠组织出现免疫细胞浸润增多等炎症特征，提示SCARF1缺失导致肠道屏障功能受损。
微生物群落失衡
宏基因组分析显示，基因缺陷小鼠肠道菌群α多样性下降，厚壁菌门/拟杆菌门（Firmicutes/Bacteroidetes）比率升高，且有益菌阿克曼菌（Akkermansia muciniphila）完全缺失。线性回归分析进一步发现，Alistipes、毛螺菌科（Lachnospiraceae）和梭菌属（Clostridium）的丰度与狼疮疾病严重程度呈正相关。
功能通路抑制
对Scarf1?/?小鼠菌群功能分析表明，与细胞增殖相关的多条生物通路被下调，这可能是肠道修复能力减弱的重要原因。
结论与展望
本研究首次阐明SCARF1通过调控肠道菌群稳态参与SLE发病的新机制：SCARF1缺陷导致efferocytosis功能障碍，引发肠道菌群失调（dysbiosis），特定致病菌增殖促进肠道炎症，进而加剧全身自身免疫反应。该发现不仅将清道夫受体功能与肠道微生态联系起来，更为SLE提供了潜在的微生物标志物（如阿克曼菌缺失）和治疗靶点。未来针对SCARF1-菌群轴的干预策略，或为自身免疫疾病防治开辟新途径。
