短鲭鱼（Rastrelliger brachysoma，Bleeker, 1851）属于鲭科（Scombridae），自然栖息于印度-太平洋中西部地区的浅水区，分布范围从安达曼海延伸至大洋洲。这是一种小型热带、上层水域及近岸区域的洄游性海洋鱼类，通过在不同产卵地和觅食地之间迁移完成生命周期。根据生长参数分析（Fishbase, 2025），其世代时间约为1年（0.8–1.1年）。它们主要以小型浮游动物为食，并形成按体型分组的鱼群。通常生活在水温20至30°C、盐度较低的水域（Collette et al., 2011, Collette and Nauen, 1983）。
该物种在泰国湾（GoT）数量丰富，是最重要的渔业资源之一。其觅食地遍布泰国湾的内部、上部及下部区域，它们在沿海水域积极觅食。已在泰国湾识别出五个主要产卵地：Mu Ko Chang国家公园附近（Khrueniam and Chareonsombat, 2012, Khrueniam et al., 2013, Songkaew et al., 2015）；Mae Klong河口（Mailai-Iad et al., 2006）；Prachuap Khiri Khan的Hua Hin；Surat Thani的Mu Ko Ang Thong国家公园；以及Pattani沿海（Chalee et al., 2007, Khongchai et al., 2006, Songkaew et al., 2014, Songkaew et al., 2015）。
泰国渔业部门自1979年起记录了短鲭鱼的年捕捞量，数据显示捕捞量波动较大（Department of Fisheries, 1979–2019）。尽管由于市场需求高涨，捕捞量一度增加到13.08万吨（Department of Fisheries, 2014），但随后急剧下降（Department of Fisheries, 2015–2018），2018年降至1.77万吨（Department of Fisheries, 2018）。最近的渔业统计数据显示捕捞量有所恢复（Department of Fisheries, 2019–2024），2024年捕捞量为5.72万吨（Department of Fisheries, 2024）。然而，目前的捕捞量和经济价值仍远低于下降前的水平（Department of Fisheries, 2024）。过度捕捞是主要原因，包括过度捕捞努力、使用高效渔具、扩大捕捞范围以及延长捕捞时间，这些因素对泰国湾短鲭鱼种群的可持续性构成严重威胁。此外，气候变化和人类活动造成的污染也对海洋生态系统产生日益严重的影响（Halpern et al., 2008, P?rtner et al., 2019, Rashid et al., 2015）。泰国湾的海表温度上升（Koad et al., 2012），东海岸还存在重金属污染（Thongra-Ar et al., 2006）。由于短鲭鱼偏好盐度较低的近岸和河口栖息地（Collette and Nauen, 1983），它们极易受到这些环境压力的影响。
为应对过度捕捞问题，泰国渔业部门自1953年起在泰国湾和安达曼海实施了年度禁渔区，以保护产卵地并提高幼鱼存活率。泰国湾的禁渔区每年2月15日至9月30日实施，覆盖Prachuap Khiri Khan、Chumphon、Surat Thani及泰国湾内部区域（Wipatayotin, 2024）。安达曼海的禁渔区每年4月1日至6月30日实施，涵盖Phuket、Phang Nga、Krabi和Trang周边海域（Bangkokpost, 2021）。然而，这些措施的有效性取决于关于种群结构和连通性的准确信息，而这些信息会因捕捞压力和环境变化而发生变化。了解过度捕捞和环境压力的影响需要种群层面的数据，特别是遗传信息和长期监测，这对有效的渔业管理至关重要（Cochrane and Garcia, 2009, Frankham et al., 2010, Jakobsdóttir et al., 2011）。
在泰国，超过75%的短鲭鱼捕捞量来自泰国湾，因此该地区成为主要研究重点。遗传标记已被广泛用于研究泰国湾和安达曼海的短鲭鱼种群。自2016年以来，已在泰国湾的主要种群（包括Trat、Samut Songkhram、Prachuap Khiri Khan和Surat Thani）应用了十一个微卫星位点（Kongseng, 2016, Kongseng et al., 2016）。这些研究显示总体遗传多样性较高，其中Samut Songkhram种群对泰国湾内部捕捞量的贡献最大，不同种群间的遗传分化程度为中等到高。这些宝贵信息直接为年度禁渔区政策提供了依据。不过，这些研究主要基于2014年采集的样本，即短鲭鱼资源大幅下降之前的数据。后来对Pattani种群的研究（Kongseng et al., 2017）显示其遗传多样性与Trat、Samut Songkhram和Surat Thani种群相当，但Prachuap Khiri Khan种群的多样性最低。五个种群间的遗传分化程度适中，且具有高度统计学显著性。进一步的研究评估了渔业捕捞中短鲭鱼个体的来源（个体分配；IA）以及每个种群对捕捞量的贡献（混合种群分析；MSA）（Kongseng et al., 2020）。考虑到泰国湾涉及柬埔寨、越南和泰国的水域，还探讨了这些邻国对捕捞量的区域贡献（Kongseng, 2021, Kongseng et al., 2021, Seafdec, 2019）。
尽管有这些宝贵的见解，大多数关于泰国湾的遗传学研究及当前管理所使用的数据已过时，主要依赖于2014年采集的样本（当时年捕捞量减少了50%）。Chantavanich等人（2022）的最新微卫星研究扩大了研究范围，首次对安达曼海的三个种群（Ranong、Phang Nga-Phuket和Satun-Trang）进行了遗传评估，并重新评估了最大的泰国湾种群Surat Thani。结果显示安达曼海种群遗传多样性适中，而Surat Thani种群遗传多样性持续较高。然而，其他主要泰国湾种群已超过十年未进行全面更新。此外，目前仍基于2014年的遗传数据制定禁渔区政策。过去十年的环境变化可能进一步影响了种群动态，因此需要持续进行遗传监测以确保有效的适应性禁渔措施。本研究旨在通过1）获取泰国湾短鲭鱼种群的当前遗传信息；2）评估其遗传多样性的时间变化，来填补这一关键知识空白。研究结果将有助于完善禁渔区政策，支持泰国湾短鲭鱼资源的可持续管理和恢复。
