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这篇综述挑战了“线粒体前导序列(MTS)仅为靶向标签”的传统观点,系统论述了前导序列在调控前体蛋白折叠、招募伴侣蛋白、介导未导入前体蛋白降解及参与应激反应等多维功能,揭示了其在蛋白稳态和细胞适应中的核心作用。
1 细胞内蛋白分选与靶向序列的概念
真核细胞是区室化的。由于所有蛋白质(除了一些细胞器内的翻译产物)均在细胞质中合成,许多新合成的蛋白质必须被分选到其特定的亚细胞定位。靶向信号如同地址标签,被其目标区室表面的受体所识别。线粒体靶向信号(MTS)就是其中一类重要的信号。
2 线粒体前导序列的结构特性
大多数线粒体蛋白在合成时带有一个N端前导序列(presequence)。前导序列的长度通常在10至70个氨基酸残基之间,具有两亲性(一端疏水,一端带正电荷),富含丝氨酸和苏氨酸,缺乏带负电的残基。这些共同特性使得通过TargetP、MitoFates等平台可以可靠地预测蛋白质的线粒体靶向特性。
在大多数情况下,前导序列在进入线粒体基质后会被线粒体加工肽酶(MPP)切除。术语“前导序列”和“MTS”常被混用,但严格来说,前导序列是那些被MPP切除的N端区域,其中通常包含了线粒体蛋白的靶向信息,即MTS。
3 线粒体前导序列的功能
MTSs对于线粒体靶向既是必要的也是充分的。然而,靶向效率差异很大:一些前导序列需要高能线粒体,而另一些则不那么挑剔。显然,前导序列不仅在长度上差异很大,在“强度”上也是如此,更长的前导序列通常被发现效率更高。
4 前导序列作为地址标签并结合前导序列受体
前导序列将蛋白质从细胞质引导至线粒体基质。它们在整个导入途径中与一系列线粒体结合位点顺序相互作用:首先与细胞质因子结合以维持导入能力;然后被线粒体表面受体(如Tom20, Tom22, Tom70)识别;接着被传递给Tom40的蛋白传导通道;再从TOM孔穿出后,与TIM23复合物相互作用;最终,在伸入基质后,被线粒体Hsp70分子捕获,驱动蛋白质易位,最后被MPP识别并切割。
前导序列在这些不同结合反应中的效率可能存在差异,可能是为了微调其各自前体蛋白的生物合成。例如,一些基质蛋白采用“弱”前导序列,使用两步导入途径(MitoTraP),在最终穿过内膜之前暂时释放到膜间隙中。
5 前导序列影响蛋白质(未)折叠并招募伴侣蛋白
有假说认为前导序列会阻碍前体蛋白的折叠,但实验证据并不完全支持。在体内,前导序列通过与细胞质伴侣蛋白(如NAC、Hsp70家族成员)结合,显著影响蛋白质在细胞质中的(未)折叠状态。
更长的前导序列可能因其存在Hsp90系统特定组件的结合位点而具有更高的导入效率。TOMM34(或称Tom34)是动物细胞中Hsp90的胞质辅助伴侣,可支持线粒体蛋白导入。Hsp90(在TOMM34/Cns1的协助下)可能将前体导向线粒体表面的Tom70,以促进其解折叠和高效易位进入线粒体。
6 前导序列可诱导蛋白进入MitoStores
未能导入的线粒体前体蛋白可以被隔离到称为MitoStores(或称Q bodies、cytoQs)的细胞质聚集体中。在酵母细胞中,小的热休克蛋白(特别是Hsp42)是MitoStore形成所必需的成核因子。解聚酶Hsp104能够从MitoStores中释放前体蛋白以促进其导入。只有一部分新合成的线粒体蛋白会进入MitoStores,而前导序列的存在对其聚集至关重要。
在人类细胞中也观察到含有线粒体前体蛋白的MitoStores样聚集体形成,这些结构被称为p62小体。
7 前导序列可作为降解决定子(Degron)控制蛋白质稳定性
如果导入失败,大多数未导入的线粒体前体蛋白会被蛋白酶体迅速降解。前导序列或成熟区内的片段可能作为降解决定子(degron),促进这些E3蛋白对前体进行泛素化。
在人类细胞中,未导入前体蛋白的前导序列被一个称为SIFI的大型复合物识别。该复合物含有泛素连接酶亚基UBR4,可泛素化其底物并促进其后续的蛋白水解降解。SIFI复合物在细胞对线粒体导入缺陷引发的应激反应中扮演核心角色:当导入出现问题时,DELE1和HRI的降解被竞争性抑制,从而激活整合应激反应(ISR)。
不仅前导序列,前体蛋白成熟区内的片段也决定了其蛋白水解稳定性。例如,未导入前体蛋白中的疏水跨膜结构域被ubiquilin结合,后者招募泛素连接酶RNF126以促进泛素化。
对于某些双重定位的蛋白(如柠檬酸合酶Cit1),其导入失败会导致有功能的折叠蛋白出现在细胞质中,这可能因代谢毒性而产生危害。泛素连接酶复合物Skp1-Cdc53-Ucc1能识别细胞质中折叠的Cit1并促进其降解。
8 结束语
近期研究表明,线粒体前导序列不仅仅是引导蛋白质进入线粒体的“入场券”。它们与多种因子相互作用,调控新合成蛋白的靶向、(未)折叠和蛋白水解稳定性。此外,前导序列还可能决定蛋白质是共翻译还是后翻译导入。由于前导序列存在时间短暂(合成后很快被MPP切除),这阻碍了对其结合伴侣和特殊模体的鉴定。新方法(如邻近标记、位点特异性交联等)的应用将有助于揭示前导序列复杂的生理功能。