通过整合nrDNA、质体基因组和形态学证据，重新审视Conioselinum（伞形科）的系统发育关系

Conioselinum属分类难题通过整合nrDNA分子数据和形态特征解决，确立单系群地位及三个亚类群，验证果皮维管束末端着生等稳定诊断特征，揭示晚新生代至冰期快速辐射与青藏高原抬升关联，六基因（ycf1、matK等）正/松弛选择暗示高海拔适应，核质冲突提示复杂进化史。

　　

摘要

背景

Conioselinum Fisch. ex Hoffm.（伞形科）属长期以来在分类学上存在挑战，主要是因为其属内关系尚未得到明确界定，且与Ligusticum等相关属在形态上存在显著相似性。尽管整合质体和nrDNA数据在解析复杂系统发育关系方面取得了成效，但仍然缺乏一个全面的系统发育框架以及对Conioselinum关键鉴别特征的重新评估。

结果

我们的nrDNA系统发育分析建立了一个可靠的框架，支持Conioselinum的单系性，该属嵌套在Hymenidium分支中，并划分为三个不同的亚支（A、B和C）。这一系统发育框架得到了相应形态特征的进一步验证。我们再次确认，果实棱中的维管束位于末端是一种稳定的共有衍征；结合一系列其他鉴别特征（如落叶性基生叶、线形小苞片以及不存在或退化的萼齿），这一特征能够有效区分Conioselinum与其亲缘属。分歧时间估计显示，该属从晚中新世开始经历了快速辐射演化，这一过程与青藏高原的抬升相吻合。此外，选择性压力分析表明，在六个基因（ycf1、matK、rpoA、ycf2、rps7和ccsA）中存在正向或放松的选择压力，这表明这些基因在帮助该属适应高海拔环境压力方面发挥了作用。某些分类单元中明显的细胞核-细胞质冲突表明其演化历史可能较为复杂，可能涉及网状进化。

结论

本研究强调了将系统基因组学与形态学结合用于解决复杂分类问题的有效性。基于这两种来源的一致证据，我们提出了对Conioselinum属范围的修订建议。这些分子和形态学见解为未来的分类修订奠定了坚实基础，并加深了我们对伞形科适应性多样化的理解。