在乳腺癌细胞中，鉴定出一种由LncRNAs构成的染色质相关基因调控复合体，该复合体包含ERα、DOT1L和menin蛋白

《Cell Communication and Signaling》：Identification of LncRNAs scaffolding a chromatin-associated gene regulatory complex in breast cancer cells comprising ERα, DOT1L and menin

ERα阳性乳腺癌中PVT1通过招募DOT1L和menin形成致癌复合体，其高表达与患者生存率下降相关。通过RIP-Seq和转录组学分析发现PVT1介导ERα、DOT1L和menin的相互作用，调控乳腺癌关键通路，为靶向治疗提供新思路。

　　

摘要

在雌激素受体（ER）阳性的乳腺癌（BC）中，对内分泌疗法产生耐药性仍然是一个重要的临床挑战，这通常与转录和表观遗传学的失调有关。这种肿瘤的主要特征是核受体ERα，它通过招募多种共调节因子（包括组蛋白甲基转移酶DOT1L和支架蛋白menin）来驱动肿瘤发生，从而形成促进肿瘤形成的机制。然而，这一复杂结构的确切机制尚未完全明了。我们的研究探讨了ERα-DOT1L-menin功能关联的分子基础，重点关注长链非编码RNA（lncRNAs）的潜在支架作用。

为了识别具体参与这一网络的lncRNAs，我们对MCF-7乳腺癌细胞中的DOT1L和menin进行了原核免疫沉淀结合RNA测序（RIP-Seq）分析。将这些数据集与现有的ERα相互作用RNA数据进行交叉比对后，发现了六种共同的分子。其中，我们重点关注了PVT1，这是一种已知的致癌RNA，此前我们的团队曾对其进行了研究，发现它可以协同将ERα和PRC2复合物招募到特定的染色质位点上。PVT1的高表达与ERα、DOT1L和menin的高表达相关，且与患者的不良预后相关。功能实验证实，敲低PVT1可以减少ERα、menin和DOT1L之间的关联，从而支持其在这一复合体中作为分子支架的作用。通过对ERα、DOT1L、menin或PVT1进行转录组分析，发现了一组共同存在的基因特征，这些基因与乳腺癌的主要特征相关。许多失调基因同时被这三种蛋白质直接结合，表明存在协调的转录调控机制，揭示了涉及ERα、DOT1L、menin和PVT1的关键轴。针对这种依赖RNA的染色质相关调控复合体可能为乳腺癌的治疗提供新的策略。