找错对象了：关于光叶柏树树皮微生物组的生态学见解

《Environmental Microbiome》：Barking up the right tree: ecological insights into the microbiome of bald cypress tree bark

本研究分析了密西西比河下游湿地落羽杉树皮微生物群，发现核心菌群占95%以上，水文条件（浸水、近水、干燥）显著影响微生物组成，湿润树皮多样性更高，与水质相关，涉及脱氮、甲烷氧化等生态功能。

　　

摘要

背景

树木及其相关的微生物提供了许多生态系统服务，包括碳封存、养分循环和植物修复。树皮为微生物群落提供了广阔且季节性稳定的栖息地。然而，树皮微生物组的研究仍然非常有限，尤其是对于湿地树种而言。在密西西比河下游流域，光叶柏（Taxodium distichum）是许多湿地中的主要树种，这些湿地包括与以种植行作物为主的农业生态系统相连的湖泊和溪流。这些水体通常用于灌溉和排水需求，并会受到相邻农田中农业化学品径流的影响。因此，我们试图了解水文条件如何影响光叶柏的树皮微生物组。

结果

我们在六个月内从三个不同湖泊中的18棵树上收集了278个树皮样本。通过16S rRNA基因测序，我们发现同一湖泊内不同树木的树皮微生物组以及不同湖泊之间的树皮微生物组具有高度一致性，其中包含的细菌类群在超过95%的样本中都存在。水文条件对微生物组结构有显著影响：树皮的不同部位根据其是否浸没在水中、处于水面之上或处于干燥状态而拥有不同的细菌群落。水质与湿润树皮的α多样性显著相关，湿润树皮的多样性高于干燥树皮，并且其中含有更多可能提供重要生态系统服务（如反硝化、甲烷氧化和污染物降解）的细菌。

结论

湿地对养分循环和水质调节具有重要意义。我们的研究揭示了这些生态系统中的微生物动态以及水文条件如何影响其中的微生物群落，进而可能影响水质。这项工作首次描述了湿地树种的树皮微生物组，为未来研究微生物组在湿地生态系统服务中的功能作用奠定了基础。