《Systems Microbiology and Biomanufacturing》:L-Asparaginase bioprospection from Bacillus species
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本文综述了 L-天冬酰胺酶(L-ASNase)在急性淋巴细胞白血病(ALL)等癌症治疗和食品工业(丙烯酰胺减排)中的重要作用,重点探讨了从 Bacillus属细菌中发现新型 L-ASNase 的最新进展。文章系统总结了从各种环境(如土壤、海洋、盐湖)中分离出的 Bacillus菌株(如 B. halotolerans、B. subtilis、B. altitudinis等)所产 L-ASNase 的酶学特性,强调其相比当前临床使用的 E. coli和 Erwinia chrysanthemi来源酶,具有无谷氨酰胺酶活性、免疫原性低、易于纯化(多为胞外酶)以及热稳定性和 pH 耐受性好等优势,是克服现有疗法不良反应和局限性、开发更安全有效药物的理想候选者。
L-天冬酰胺酶:从 Bacillus中发现下一代抗癌与食品工业用酶
引言
L-天冬酰胺酶(L-ASNase)是一种广泛应用于急性淋巴细胞白血病(ALL)和一些实体瘤治疗方案的关键酶。其作用机制在于消耗天冬酰胺,这是一种肿瘤细胞生长所必需、而正常细胞可自行合成的氨基酸。目前,临床上仅批准使用来自大肠杆菌(Escherichia coli)和菊欧文氏菌(Erwinia chrysanthemi)的 L-ASNase。然而,其应用常因副作用和耐药性的产生而受限。为应对这些挑战,研究者们正积极探索 L-ASNase 的新来源,特别是细菌来源,以期获得稳定性更高、免疫原性更低、药代动力学性质更优的酶。近期研究在 Bacillus属中发现了有前景的 L-ASNase 候选者,本文将综述从 Bacillus物种中分离新型 L-ASNase 的最新进展,强调生物勘探对于改进肿瘤疗法的重要性。
L-天冬酰胺酶概述
L-天冬酰胺酶属于酰胺水解酶类(EC 3.5.1.1),负责水解 L-天冬酰胺,释放 L-天冬氨酸和氨3). Extracellular depletion of L-asparagine inhibits protein synthesis in leukemic cells (which often lack sufficient asparagine synthetase), causing cell-cycle arrest and apoptosis">。除了在肿瘤治疗中的核心作用,L-ASNase 也被用于食品工业,以减少高温加工食品(如油炸和烘焙产品)中致癌物丙烯酰胺的含量。鉴于其治疗和工业价值,寻找具有更高效率、更低成本和更少不良反应的替代性微生物来源 L-ASNase 成为研究热点。
L-ASNase 在癌症治疗中的局限与挑战
尽管 L-ASNase 在治疗中效果显著,但其临床应用仍面临一系列挑战。主要问题包括:由伴随的谷氨酰胺酶和脲酶活性引发的毒性(如过敏反应、肝功能障碍、胰腺炎);细菌蛋白固有的免疫原性,可能导致中和抗体产生,影响疗效;以及肿瘤细胞通过上调天冬酰胺合成酶(ASNS)或代谢重编程产生的耐药性。目前,通过化学修饰(如 PEG-天冬酰胺酶)或开发新来源酶来克服这些限制是主要研究方向。
探寻新的 L-ASNase 微生物来源
多种生物能产生 L-ASNase,但细菌来源因其抗肿瘤特性、生态友好性和生产经济性而备受关注。其中,能够分泌胞外酶的菌株更具优势,可简化纯化流程。研究者们已从土壤、海洋生态系统、极端环境等多种生境中筛选出多种产酶细菌,包括 Escherichia coli、Pseudomonas aeruginosa、Bacillus subtilis等。值得注意的是,Bacillus属细菌因其广泛分布、抗逆性强、常被公认为安全(GRAS)或非致病性、易于基因操作,且通常为胞外产酶,已成为极具潜力的 L-ASNase 生产菌株。
Bacillus物种来源的 L-ASNase
一系列研究报道了从不同环境中分离到的 Bacillus菌株可高效生产 L-ASNase。例如,从伊朗东阿塞拜疆省土壤分离的 B. subtilis在优化条件下酶活可达 7.8 U/mL;从秘鲁 Maras 盐田分离的耐盐菌株 B. subtilisCH11 产酶比活高达 234.38 U/mg;从沙特红海分离的 B. licheniformis产酶无谷氨酰胺酶活性,比活为 36.08 U/mg。土壤因其丰富的微生物多样性,是发现产酶菌株的重要宝库,如 B. subtilisNo. 28 的酶活可达 272.5 IU/mL,B. paramycoidesMRS4 达 118 IU/mL。B. megateriumH-1 产的酶应用于炸薯条可减少 92% 的丙烯酰胺生成。
分子生物学技术也被用于发掘和改良 Bacillus来源的 L-ASNase。例如,对分离自伊朗盐湖的 Bacillussp. SL-1 的 ansA1基因进行克隆表达,所得酶具有高热稳定性和宽 pH 耐受性(4.5–10)。
海洋来源的 Bacillus也展现出巨大潜力。分离自巴基斯坦的 B. halotoleransASN9 产的酶比活高达 3,083 U/mg,且无谷氨酰胺酶活性,对白血病细胞具有细胞毒性。分离自印度海洋沉积物的 B. niacini、B. altitudinisKB1 和 CMFRI/Bal-2,以及来自红海的 B. velezensis均能产生活性良好的 L-ASNase,并显示出抗癌潜力。这些海洋酶通常具有适应特殊环境的稳定性。来自土耳其鸡内脏的 B. atrophaeus产的酶能减少炸薯条中 80% 的丙烯酰胺。
这些研究表明,Bacillus属的遗传和生态多样性导致其 L-ASNase 产量和特性存在显著差异,突显了持续勘探和表征这些菌株的重要性。
对比分析与优势候选株
综合分析发现,Bacillus来源 L-ASNase 的研究主要围绕生物过程潜力和生化特性优化两个方向。多数研究关注高产菌株的发现和发酵优化,如 B. subtilisNo. 28 和 B. paramycoidesMRS4 的报道。胞外分泌特性是其一大优势,可显著简化下游纯化。另一部分研究则深入表征了纯化后的酶学性质,涌现出多个明星候选:B. halotoleransASN9(比活 3083 U/mg,无谷氨酰胺酶活性)、B. altitudinisCMFRI/Bal-2(比活 149.6 U/mg,高底物亲和力,Km = 14.75 μmol/L,生理条件下稳定)、B. subtilisCH11(比活 234.38 U/mg)和 B. velezensis(比活 31.77 U/mg,对癌细胞具细胞毒性)。然而,不同研究间实验方法的异质性使得直接横向比较存在困难,亟需标准化的表征方案。
在更广阔微生物版图中的定位
与当前主流临床来源(E. coli和 Erwinia chrysanthemi)相比,Bacillus来源的 L-ASNase 展现出综合性优势。它兼具 GRAS 或非致病性、常为胞外分泌(简化生产)、常无谷氨酰胺酶活性(降低毒性)、具有优良的耐热耐 pH 性(工业应用潜力),以及易于基因工程改造等特点。这些特性使其不仅能作为现有临床酶的替代品,更有可能成为具有更好耐受性和更易生产的“下一代”酶。同时,其在食品工业(如减少丙烯酰胺)中的应用也展现出巨大前景。
未来展望
未来研究应聚焦于:1. 对最有潜力的候选酶进行标准化的生化与动力学比较分析;2. 利用理性蛋白质工程进一步优化酶的特性,如提高热稳定性、底物特异性,以及通过表位屏蔽设计降低免疫原性;3. 探索超越 PEG 化的新型药物递送系统;4. 在相关白血病和实体瘤动物模型中开展严谨的临床前研究;5. 利用 GRAS 宿主或食品级 Bacillus菌株优化可持续、可扩展的生物生产工艺;6. 探索与天冬酰胺合成酶(ASNS)抑制剂等药物的联合疗法,以应对耐药性。
结论
本综述汇集了有力证据,表明 Bacillus物种是极具前景的 L-ASNase 来源。从不同生境中发现的 Bacillus菌株能生产出具有高比活性、常无谷氨酰胺酶活性、易于纯化(胞外酶)且稳定性好的 L-ASNase。这些特性直接针对了现有疗法的核心缺陷,为开发更安全、更有效的抗癌药物和食品工业用酶奠定了坚实基础。未来需要结合多学科手段,推动这些有潜力的生物催化剂从实验室走向临床和工业应用。