整合基因组数据和暴露组数据可以识别出可能与慢性阻塞性肺疾病（COPD）相关的内分泌干扰物

《Human Genomics》：Integrating genomic and exposomic data identifies endocrine disruptors potentially associated with chronic obstructive pulmonary disease

COPD的分子机制研究整合表观基因组学与遗传学数据，通过Mendelian随机化等分析发现EDCs如双酚A与免疫相关基因TCF19、MAP1LC3B等互作，揭示免疫调控、自噬及表观遗传通路在COPD发病中的潜在作用。

　　

摘要

背景

慢性阻塞性肺疾病（COPD）是一种复杂的疾病，其发病既受遗传易感性的影响，也受环境因素的驱动。内分泌干扰化学物质（EDCs）是广泛存在于环境中的污染物，它们会干扰激素和免疫途径，但它们与COPD之间的分子机制尚未得到充分研究。

方法

我们整合了暴露组学和基因组学数据，系统地评估了EDCs在COPD中的相关分子机制。从TEDX和CTD数据库中整理出了化学物质与基因之间的相互作用，以识别与EDCs相关的基因。通过双样本孟德尔随机化（MR）方法评估了基因表达与COPD风险之间的遗传关联。采用贝叶斯共定位分析来确定是否存在共同的遗传变异同时影响基因表达和COPD易感性。此外，还进行了网络分析，以绘制EDCs与基因之间的相互作用以及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的图谱。

结果

在4207个具有可检测顺式eQTLs的EDCs相关基因中，经过FDR校正后，MR方法识别出30个与COPD显著相关的基因。共定位分析确定了18个具有强烈或中等程度共同遗传信号证据的基因，包括TCF19、MAP1LC3B和IRF1。网络分析显示这些基因与多种EDCs（如双酚A、三氯生和甲醛）之间存在广泛的相互作用。功能分析揭示了与免疫调节、自噬和表观遗传控制相关的通路。

结论

这一综合性的转化暴露组学框架揭示了EDCs相关基因与COPD风险之间的遗传关联。这些发现为理解环境内分泌干扰物如何参与COPD的发病机制提供了机制上的见解，并为未来的实验验证和环境健康干预措施提供了优先考虑的分子靶点。