《Scientific Reports》：Detection of Wencheng shrew virus and cardiovirus from small mammals in Myanmar
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本研究旨在填补缅甸地区人兽共患病病毒监测的空白。研究团队在缅甸仰光地区和克伦邦的人-动物交界处，对老鼠（Rattus norvegicus, R. rattus）、小鼠（Mus sp.）及东南亚鼩鼱（Crocidura fuliginosa）开展采样，通过宏基因组新一代测序（mNGS）及系统发育分析，首次在缅甸、并在C. fuliginosa中检出了文昌鼩鼱病毒（WESV）；同时，在褐家鼠（R. norvegicus）中发现了一种与源自中国野鼠的Theiler心病毒（Cardiovirus theileri）聚类的新心病毒科成员。这为评估该地区因土地利用变化而可能增加的人畜共患病风险提供了关键数据。
在东南亚生物多样性热点地区缅甸，生活着众多与人类关系密切的小型哺乳动物，如家鼠和鼩鼱。它们穿梭于自然栖息地与人类聚落之间，是潜在人兽共患病病毒的“移动储存库”。然而，与丰富的物种多样性形成鲜明对比的是，关于缅甸境内这些伴人动物携带的病毒，科学界所知甚少，存在着显著的研究与监测空白。与此同时，持续的土地利用变化正在重塑当地的生态环境，可能加剧野生动物与人类的接触，从而潜在地提升了新发人畜共患病出现的风险。在这一背景下，一群研究者决定拿起科学的“探照灯”，深入这片未知领域，去搜寻那些隐匿在小型哺乳动物体内的病毒“居民”，以期绘制出该地区潜在的病毒威胁图谱，为公共卫生安全预警提供科学依据。
为解答上述问题，研究团队于2017年7月至2018年8月，在缅甸的仰光地区（Yangon Region）和克伦邦（Kayin State）选取了人-动物接触界面进行野生动物采样。他们收集了褐家鼠（Rattus norvegicus, N=80）、黑家鼠（Rattus rattus, N=6）、小鼠（Mus sp., N=3）以及东南亚鼩鼱（Crocidura fuliginosa, N=8）的直肠拭子。随后，研究人员从这些样本中提取核糖核酸（RNA），将其反转录为互补脱氧核糖核酸（cDNA），并进行了宏基因组新一代测序（Metagenomic Next-Generation Sequencing, mNGS）。通过对产生的海量序列数据进行生物信息学分析和系统发育（Phylogenetic Analysis）重建，他们得以鉴定病毒种类并确定其分类学地位。
研究结果
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病毒多样性探测：通过对97份小型哺乳动物直肠拭子样本进行mNGS，研究成功探测到了多种病毒的序列，重点关注了两种病毒的发现。
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文昌鼩鼱病毒（Wencheng shrew virus, WESV）的首次报告：研究在东南亚鼩鼱（Crocidura fuliginosa）个体中检测到了文昌鼩鼱病毒的序列。这是WESV在缅甸境内的首次发现，同时也是该病毒在C. fuliginosa这一宿主物种中的首次报道。系统发育分析显示，检测到的病毒序列与先前在中国发现的文昌鼩鼱病毒聚类。
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一种新型心病毒科（Cardiovirus）成员的鉴定：研究在褐家鼠（Rattus norvegicus）样本中发现了一种属于心病毒科（Cardiovirus）的新病毒序列。系统发育分析表明，该病毒与先前从中国野鼠中鉴定出的泰勒心病毒（Cardiovirus theileri）序列聚为一支，提示它可能是心病毒科的一个新成员，与已知的泰勒心病毒关系密切。
结论与讨论
本研究通过对缅甸小型哺乳动物的病毒组调查，取得了两项关键发现：首次在缅甸并在东南亚鼩鼱（Crocidura fuliginosa）中检出了文昌鼩鼱病毒（WESV）；同时在褐家鼠中发现了一种与泰勒心病毒（Cardiovirus theileri）相关的新型心病毒。这些发现直接填补了该地区特定人兽共患病病毒本底数据的空白。更重要的是，研究揭示了在缅甸这样一个生物多样性丰富、但病毒监测薄弱的地区，伴人鼠类和鼩鼱体内携带多样且可能跨境传播的病毒。这些病毒（如心病毒科某些成员已知可感染人类和动物）的生态分布与演化动态尚未明晰。因此，持续监测和研究小型哺乳动物中的病毒循环，对于评估因土地利用变化和人类活动扩张而可能升高的 zoonotic risk（人畜共患病风险）至关重要。本研究的成果为当地公共卫生部门提供了早期预警的科学依据，强调了在类似地区加强病毒监测、深化跨学科合作，以防范未来新发传染病的出现和传播。该论文发表于《Scientific Reports》期刊。
