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MMP1 是一种有前景的胰腺癌预后、治疗和免疫生物学标志物:来自生物信息学分析和生物学实验的证据
《BMC Cancer》:MMP1 is a promising prognostic, therapeutic and immunological biomarker for pancreatic cancer: evidence from bioinformatics analysis and biological experiments
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年02月20日 来源:BMC Cancer 3.4
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胰腺癌预后标志物MMP1的致癌机制及免疫微环境调控研究,通过GEO数据库筛选差异表达基因,结合DAVID、STRING等分析鉴定MMP1为关键基因。实验证实MMP1高表达与肿瘤侵袭性、免疫细胞浸润(M1巨噬细胞、中性粒细胞等)及免疫检查点基因(VTCN1、TGFBR1等)相关,其敲低抑制细胞增殖并促进凋亡。MMP1通过直接致癌和调控肿瘤免疫微环境驱动进展,成为潜在治疗靶点。
胰腺癌仍然是全球最具致命性的恶性肿瘤之一,这凸显了迫切需要可靠的生物标志物来预测预后和指导治疗。本研究旨在通过整合生物信息学和实验方法来识别和表征这些生物标志物。
使用GEO数据库筛选在胰腺癌中差异表达的基因。接下来,利用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路分析。通过STRING数据库和Cytoscape软件生成蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并识别关键基因。然后使用GEPIA数据库和Cox回归分析评估这些基因的预后价值。利用UALCAN数据库分析关键基因与临床病理参数之间的关系。TISCH2、TIMER和TISDB数据库用于免疫浸润分析。最终通过体外实验确认了关键基因的功能作用。
经过多轮严格筛选,获得了10个关键基因。进一步验证后发现,MMP1在胰腺癌组织中显著上调,并与患者的不良预后相关。免疫学分析显示MMP1表达与特定免疫细胞(B细胞、M1巨噬细胞、中性粒细胞和单核细胞)的浸润以及免疫检查点基因(VTCN1、LGALS9、TGFBR1和IL10RB)的表达之间存在相关性。体外功能实验证实,下调胰腺癌细胞中的MMP1可抑制其增殖、迁移和侵袭行为,同时促进细胞凋亡。此外,共培养模型表明MMP1能够促进M1极化巨噬细胞的募集。
MMP1是一个独立的预后生物标志物,它通过直接的致癌作用和调节肿瘤免疫微环境来推动胰腺癌的进展。因此,它成为一个有吸引力的多功能治疗靶点,需要未来的研究来证实其转化潜力并阐明其背后的分子机制。
胰腺癌仍然是全球最具致命性的恶性肿瘤之一,这凸显了迫切需要可靠的生物标志物来预测预后和指导治疗。本研究旨在通过整合生物信息学和实验方法来识别和表征这些生物标志物。
使用GEO数据库筛选在胰腺癌中差异表达的基因。接下来,利用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路分析。通过STRING数据库和Cytoscape软件生成蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并识别关键基因。然后使用GEPIA数据库和Cox回归分析评估这些基因的预后价值。利用UALCAN数据库分析关键基因与临床病理参数之间的关系。TISCH2、TIMER和TISDB数据库用于免疫浸润分析。最终通过体外实验确认了关键基因的功能作用。
经过多轮严格筛选,获得了10个关键基因。进一步验证后发现,MMP1在胰腺癌组织中显著上调,并与患者的不良预后相关。免疫学分析显示MMP1表达与特定免疫细胞(B细胞、M1巨噬细胞、中性粒细胞和单核细胞)的浸润以及免疫检查点基因(VTCN1、LGALS9、TGFBR1和IL10RB)的表达之间存在相关性。体外功能实验证实,下调胰腺癌细胞中的MMP1可抑制其增殖、迁移和侵袭行为,同时促进细胞凋亡。此外,共培养模型表明MMP1能够促进M1极化巨噬细胞的募集。
MMP1是一个独立的预后生物标志物,它通过直接的致癌作用和调节肿瘤免疫微环境来推动胰腺癌的进展。因此,它成为一个有吸引力的多功能治疗靶点,需要未来的研究来证实其转化潜力并阐明其背后的分子机制。