阐明乙酰三丁基柠檬酸影响骨折愈合的机制：一项全面的网络毒理学研究

《BMC Pharmacology and Toxicology》：Elucidating the mechanisms by which acetyl tributyl citrate affects fracture healing: a comprehensive network toxicology study

基于网络毒理学和分子动力学模拟，本研究系统分析了ATBC对骨折愈合的潜在机制。通过整合ChEMBL、GeneCards等数据库靶点，构建蛋白互作网络，筛选出HDAC2、HDAC3等5个核心靶点，发现ATBC通过甲状腺激素、Notch信号通路及细胞周期干扰骨修复。分子模拟验证了ATBC与核心靶点的结合特性，为临床干预提供了新思路。

　　

摘要

背景

在这项研究中，我们通过网络毒理学的方法探讨了乙酰三丁基柠檬酸（ATBC）对骨折愈合的潜在风险影响。

方法

从ChEMBL、Swiss Target Prediction和STITCH数据库中检索了与ATBC相关的靶点，而从GeneCards、OMIM和GEO数据库中获取了与骨折愈合相关的靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，并使用Cytoscape软件进行可视化分析，随后进行了GO和KEGG富集分析。此外，还进行了深入分析，包括免疫浸润谱分析、基因集富集分析和ceRNA调控网络构建。最后，通过分子对接和动力学模拟来确定ATBC与其核心靶点之间的结合效率和稳定性。

结果

共识别出50个重叠靶点，从中选出了6个核心靶点。通过差异表达分析，进一步明确了5个核心靶点（HDAC2、HDAC3、KAT2B、SMARCA4和TP53）。富集分析表明这些靶点可能与甲状腺激素信号通路、Notch信号通路和细胞周期相关。分子对接和动力学模拟证实了ATBC与这些核心靶点之间存在特定的结合相互作用。

结论

我们提供了一个综合的网络毒理学分析框架，并结合分子动力学评估框架，以阐明ATBC干扰骨折愈合的潜在分子机制，从而为临床干预提供新的治疗策略。然而，这些发现需要进一步的实验验证和临床确认，以确立其转化应用的价值。

试验注册

不适用。