TP53、KEAP1和STK11突变在局部晚期非小细胞肺癌(NSCLC)中的影响:一项欧洲胸科肿瘤学平台(European Thoracic Oncology Platform)的肺癌研究项目
《European Journal of Cancer》:Impact of
TP53, KEAP1 and
STK11 Mutations in Localized-Stage NSCLC: a European Thoracic Oncology Platform Lungscape Project
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TP53、STK11、KEAP1突变在局部晚期非小细胞肺癌(NSCLC)中与辅助化疗疗效及预后相关,分析显示TP53截断突变(d型)延长化疗后复发时间,STK11突变改善预后,KEAP1突变在化疗患者中预后更差。
Miguel A. Molina-Vila|Zoi Tsourti|Katerina Vervita|Jordi Bertran-Alamillo|Beatriz García-Peláez|Keith M. Kerr|Lukas Bubendorf|Line Bille Madsen|Wojciech Biernat|Albrecht Stenzinger|Martina Haberecker|Fiona Blackhall|Saraswati Pokharel|Núria Jordana-Ariza|Marta Vives-Usano|Patrick Vagenknecht|Urania Dafni|Roswitha Kammler|Stephen P. Finn|Solange Peters|Rafael Rosell
西班牙巴塞罗那Dexeus大学医院Pangaea Oncology肿瘤学实验室
摘要 背景 TP53 、STK11 和KEAP1 突变在局部晚期非小细胞肺癌(NSCLC)中较为常见。然而,它们的预后和预测作用尚未得到充分研究,尤其是在辅助治疗方面。
方法 使用下一代测序(NGS)技术对350名手术切除的ETOP Lungscape NSCLC患者的训练队列以及另外161名患者的验证队列的肿瘤样本进行了基因分型。TP53 突变根据其预期的影响被分为“破坏性”(d)或“非破坏性”(nd)类型。破坏性突变会导致p53蛋白的功能完全丧失。
结果 在训练队列的350名患者中,11%携带KEAP1 突变,14%携带STK11 突变。就TP53 状态而言,31%为野生型,35%携带TP53 -d突变,34%携带TP53 -nd突变。在接受辅助化疗的161名患者中,TP53 -d突变与更长的无复发生存时间(TTR)相关。而KEAP1 突变患者无复发生存时间和总生存期(OS)显著较短,STK11 突变则与更好的预后相关。在未接受化疗的186名患者中,KEAP1 突变患者的OS显著较差,而TP53 或STK11 状态对预后没有影响。在训练队列中选取的基线匹配子队列(n=206)中,TP53 突变与化疗之间的相互作用在所有终点上均具有统计学意义。针对KEAP1 的发现已在第二个包含161名患者的队列中得到验证。
结论 TP53 -d和STK11 突变可能在局部晚期NSCLC中具有预测作用,但需要进一步研究。KEAP1 突变与较差的预后相关,尤其是在接受辅助化疗的患者中。
部分内容摘录 引言 肿瘤蛋白TP53 、丝氨酸/苏氨酸激酶11(STK11 )和Kelch样ECH相关蛋白1(KEAP1 )基因的突变在非小细胞肺癌(NSCLC)中很常见,频率超过10%。此外,这三个基因在功能上相互关联。肿瘤抑制蛋白p53是调控细胞周期、凋亡和DNA修复相关基因网络的主要因子[1]。在NSCLC中,TP53 突变与吸烟和高突变负荷有关,并且在
研究设计 这是一项针对ETOP Lungscape队列中NSCLC病例子集的回顾性队列研究。ETOP Lungscape数据库(iBiobank,
https://etopdata.etop-eu.org )包含了2001年至2010年间收集的2700多名手术切除的I-III期NSCLC患者的样本,随访时间超过3年[17]。
主要分析基于350名Lungscape患者的训练队列(图1)。其中,50名患者的基因信息来自FoundationOne?CDx。
突变状态与临床病理特征的关系 我们研究的训练队列包括350名局部晚期、手术切除的NSCLC患者,中位随访时间为49.2个月。其中,161名(46%)患者接受了辅助化疗,186名(53%)未接受化疗(表1和S2 )。大多数患者为男性(59%)和当前或曾经的吸烟者(84%),中位年龄为65岁。大多数患者的分期为PS 0-1(66%),肿瘤类型为腺癌(62%)或鳞状细胞癌(32%),肿瘤大小≤4厘米(61%)。关于肿瘤分期,40%的患者为
讨论 在我们的研究中,我们使用NGS技术对350名和161名局部晚期NSCLC病例的队列进行了基因分型,包括接受或未接受辅助化疗的患者。然后我们分析了KEAP1 、STK11 和TP53 突变的作用,后者被分为两类功能类型。TP53 状态对晚期NSCLC的影响已在一般人群和分子亚组(如EGFR 突变[21]或ALK 易位患者[22])中得到广泛研究。相比之下,其他方面的研究较少
资助 该研究得到了Dr Rosell肿瘤学研究所基金会和ETOP IBCSG合作伙伴基金会的资助。
CRediT作者贡献声明 Patrick Vagenknecht: 撰写、审稿与编辑、数据管理。Núria Jordana-Ariza: 撰写、审稿与编辑、研究。Katerina Vervita: 撰写、审稿与编辑、初稿撰写、数据可视化、方法学设计、数据分析、概念构建。Marta Vives-Usano: 撰写、审稿与编辑、研究。Jordi Bertran-Alamillo: 撰写、审稿与编辑、研究、概念构建。Beatriz García-Peláez: 撰写、审稿与编辑、研究。Urania
利益冲突声明 作者声明以下可能被视为潜在利益冲突的财务利益/个人关系:利益冲突声明。MAMV 声明在过去三年中从Astra Zeneca和Merck Healthcare KGaA获得了与本研究无关的研究资助。MH 声明从Abbvie获得了与本手稿无关的研究资助。LB 声明从Roche、Novartis、Boehringer Ingelheim、Thermo Fisher、Systems Oncology获得了资助或合同。