M6A-G4共定位的全面分析及其在马立克氏病病毒感染中的调控作用验证

《BMC Veterinary Research》：Comprehensive analysis and validation of m6A-G4 colocalization and its regulatory role in Marek’s disease virus infection

m6A修饰与G-四联体共定位调控MDV感染中病毒复制及免疫应答/肿瘤发生相关基因表达，为抗病毒和抗癌治疗提供新靶点。

　　

摘要

背景

N6-甲基腺苷是真核生物中最常见的转录后修饰类型，在调控基因表达和疾病发病机制中起着关键作用。同时，G-四链结构也参与了许多重要的生物过程，包括转录和转录后事件的调节。新兴证据表明，m⁶A修饰和G4结构在病毒基因组及人类前体mRNA中存在共定位现象；然而，它们之间的功能相互作用仍不明确。

结果

利用马立克病病毒（MDV）感染样本的现有MeRIP-seq数据，我们研究了这种共定位模式及其在病毒感染中的潜在作用。生物信息学分析显示，预测的G4结构主要为双G-四联体（G-tetrad）形式的G-四链结构。与m⁶A共定位的基因在与免疫反应和肿瘤发生相关的通路中显著富集。随后我们验证了这种共定位现象在CCL4基因上的存在，并发现这种共定位会抑制CCL4的表达。此外，这种共定位还影响病毒复制并调节ICP4的表达。

结论

我们系统地研究了MDV感染期间与m⁶A修饰共定位的G4结构的特征，探讨了其在病毒复制和基因调控中的作用，并提供了m⁶A-G4共定位的实验证据。这些发现为了解这种致癌病毒所采用的表观转录组调控机制提供了新的见解，可能有助于开发新型抗病毒和抗肿瘤治疗策略。