RNA-seq分析：暴露于炎症刺激下的马肺泡巨噬细胞和单核细胞衍生的巨噬细胞（简报）

《BMC Veterinary Research》：RNA-seq evaluation of equine alveolar macrophages and monocyte-derived macrophages exposed to an inflammatory stimulus (short communication)

本研究通过RNA测序，探究健康马匹的AMs和MDMs对谷仓尘主要成分（真菌孢子、脂多糖和硅微球）的早期炎症反应贡献，发现两者在细胞因子信号通路上存在显著重叠，但MDMs在JAK-STAT/IL-15、NOD样受体及感染/C型凝集素受体通路中富集度更高，为后续研究马哮喘中AMs和MDMs功能差异奠定基础。

　　

摘要

背景

肺中的巨噬细胞群体，包括驻留的肺泡巨噬细胞（AMs）和募集的单核细胞衍生的巨噬细胞（MDMs），能够识别谷仓灰尘中的吸入颗粒物，这些颗粒物会导致严重的马哮喘，并通过它们产生的细胞因子来协调免疫反应。尽管这些巨噬细胞亚群非常重要，但它们对下呼吸道炎症的具体贡献仍知之甚少。这项探索性的体外研究使用RNA-seq技术，调查了健康马匹中的AMs和MDMs对早期炎症反应的可能贡献。如果发现了生物学上重要的差异，未来可以进一步研究以阐明严重哮喘马匹中AMs和MDMs功能的差异。来自六匹健康雌性标准品种马匹的AMs和MDMs被暴露于含有真菌孢子、脂多糖和硅微球（FLS）的混合物中6小时，其中FLS是谷仓灰尘的主要成分，而血清-free细胞培养基作为对照组。

结果

暴露于FLS的马AMs和MDMs表现出大致相似的转录反应，细胞因子信号传导是这两种细胞类型中的主要生物学特征。在0.25的探索性FDR（假发现率）阈值下，基因集富集分析表明，“JAK-STAT/IL-15信号通路”、“NOD样受体信号通路”和“感染/C型凝集素受体”在FLS暴露的MDMs中比在AMs中更为富集。

结论

这些探索性数据表明，马AMs和MDMs对导致严重马哮喘加重的因素产生了高度重叠的细胞因子反应，但也表现出细胞类型特异性的信号通路差异。这项工作为未来的研究奠定了基础，以验证这样一个假设：在患有严重马哮喘的马匹中，AMs和MDMs的功能发生了改变，各自以独特的方式参与了疾病的发生过程。

背景

肺中的巨噬细胞群体，包括驻留的肺泡巨噬细胞（AMs）和募集的单核细胞衍生的巨噬细胞（MDMs），能够识别谷仓灰尘中的吸入颗粒物，这些颗粒物会导致严重的马哮喘，并通过它们产生的细胞因子来协调免疫反应。尽管这些巨噬细胞亚群非常重要，但它们对下呼吸道炎症的具体贡献仍知之甚少。这项探索性的体外研究使用RNA-seq技术，调查了健康马匹中的AMs和MDMs对早期炎症反应的可能贡献。如果发现了生物学上重要的差异，未来可以进一步研究以阐明严重哮喘马匹中AMs和MDMs功能的差异。来自六匹健康雌性标准品种马匹的AMs和MDMs被暴露于含有真菌孢子、脂多糖和硅微球（FLS）的混合物中6小时，其中FLS是谷仓灰尘的主要成分，而血清-free细胞培养基作为对照组。

结果

暴露于FLS的马AMs和MDMs表现出大致相似的转录反应，细胞因子信号传导是这两种细胞类型中的主要生物学特征。在0.25的探索性FDR阈值下，基因集富集分析表明，“JAK-STAT/IL-15信号通路”、“NOD样受体信号通路”和“感染/C型凝集素受体”在FLS暴露的MDMs中比在AMs中更为富集。

结论

这些探索性数据表明，马AMs和MDMs对导致严重马哮喘加重的因素产生了高度重叠的细胞因子反应，但也表现出细胞类型特异性的信号通路差异。这项工作为未来的研究奠定了基础，以验证这样一个假设：在患有严重马哮喘的马匹中，AMs和MDMs的功能发生了改变，各自以独特的方式参与了疾病的发生过程。