《Journal of Plant Pathology》：First report of barley yellow dwarf virus-PAS in Phragmites australis (common reed) in Türkiye
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本研究针对芦苇（Phragmites australis）作为病毒储存库的潜在风险展开调查。研究人员在土耳其泰基尔达省采集了42份表现出黄化花叶和褪绿症状的芦苇叶片样本，通过RT-PCR和基因测序技术，首次在全球范围内在芦苇中鉴定出大麦黄矮病毒PAS（BYDV PAS）。该发现对理解谷物病毒（如BYDV）的流行病学具有重要意义，提示芦苇可能成为病毒传播的潜在“桥梁”。
在水草丰茂的湿地，遍布全球的芦苇（Phragmites australis）不仅是生态系统的组成部分，也被人类用作建筑材料、净水工具，甚至制作乐器。然而，这种生命力旺盛的植物也可能隐藏着不为人知的威胁。对于农学家和植物病理学家而言，芦苇因其入侵性和快速扩张的特性，被怀疑可能是田间重要作物病毒的天然“避难所”和“中转站”。先前的研究已证实，芦苇是多种谷物病毒的自然宿主，例如玉米矮花叶病毒（MDMV）和甘蔗花叶病毒（SCMV），而在土耳其，大麦黄矮病毒PAV（BYDV PAV）也早已在芦苇中被发现。那么，另一种重要的病毒——大麦黄矮病毒PAS（BYDV PAS），是否也已悄然潜入芦苇丛中？这个问题悬而未决，因为尽管BYDV PAS已在土耳其的玉米上被报告，但在芦苇乃至全球的其它水生禾本科植物中，此前从未有其踪迹的报告。解答这个问题，对于评估病毒向重要粮食作物传播的风险、完善病毒流行病学认知至关重要。为此，研究人员在土耳其的泰基尔达省（Trakya地区）展开了一项调查，并将成果发表于《Journal of Plant Pathology》。
为验证芦苇中是否存在BYDV PAS，研究人员运用了逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）和基因测序技术。他们从该地区采集了42份表现出黄化花叶和褪绿症状的芦苇叶片样本，使用商业试剂盒提取总核糖核酸（RNA）。
研究结果
BYDV PAS的检测与鉴定
研究人员使用针对病毒外壳蛋白（Coat Protein, CP）基因的特异性引物对全部42份样品进行RT-PCR检测。结果显示，其中5份芦苇样本呈阳性，表明存在BYDV PAS。为确证此发现，他们又设计了针对病毒依赖RNA的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, RdRp）基因的引物进行二次扩增。
基因序列分析与同源性比较
研究人员对一个CP基因扩增片段（来自TR-12分离物）和三个RdRp基因扩增片段（分别来自TR-14, TR-15, TR-16分离物）进行了测序，并将部分序列提交至GenBank数据库。序列比对分析显示，TR-12分离物的CP基因序列与来自美国、爱沙尼亚和土耳其的已知BYDV PAS分离物具有97.01%至100%的核苷酸序列同源性。而TR-14, TR-15, TR-16三个分离物的RdRp基因序列，则分别与澳大利亚、爱沙尼亚和土耳其的分离物享有88.39%， 91.47% 和 99.63%的核苷酸序列同源性。这些数据为病毒的身份提供了分子层面的确凿证据。
结论与意义
本项研究首次在全球范围内报告了芦苇作为大麦黄矮病毒PAS（BYDV PAS）的自然宿主。这一发现具有重要的科学意义和实际价值。它证实了芦苇这种广泛分布且具有入侵性的水生禾本科植物，可以携带对谷物生产构成严重威胁的BYDV PAS病毒。这意味着，在自然生态系统中，芦苇可能作为该病毒的储存库或“桥梁宿主”，在病毒流行病学中扮演关键角色。当地或周边区域种植的玉米、大麦等禾谷类作物，可能因此面临更高的病毒暴露和感染风险。该研究拓宽了我们对BYDV PAS宿主范围的认识，强调了在病毒监测和病害防控策略中，必须将野生水生禾本科植物纳入考量。未来需要进一步研究BYDV PAS在芦苇与栽培作物之间的传播动力学、介体（如蚜虫）的传毒效率，以及该病毒在不同宿主中的致病性，以更全面地评估其潜在的农业威胁并制定有效的管理措施。
