《United European Gastroenterology Journal》:Paired Duodenal and Salivary Microbiome Analysis in Pancreatic Cancer Without Duct Obstruction
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本研究首次前瞻性地配对分析了无胰胆管梗阻的胰腺导管腺癌(PDAC)患者与健康对照(HC)的唾液及十二指肠刷检样本微生物组。核心发现表明,PDAC与十二指肠系统发育多样性(Faith's PD)的降低以及独特的菌群特征相关,这些改变独立于主要混杂因素。此外,较高的唾液α-多样性(Faith's PD, observed ASVs)与更好的总生存期(OS)相关,提示口腔及十二指肠特定菌属(如 Streptococcus, Actinobacillus, Fusobacterium, Tannerella, Catonella)可能作为PDAC的潜在预后生物标志物,为基于微生物组的干预策略提供了新方向。
引言
胰腺导管腺癌(PDAC)的发病率和死亡率持续上升,尤其是年轻人群。其诊断晚、疗效有限,因此理解肿瘤发生因素并寻找可靠的诊断或预后标志物至关重要。微生物组与PDAC发生发展的关联已被广泛研究,尤其是粪便和口腔微生物组。有假说认为,口腔细菌可能通过主要十二指肠乳头迁移至十二指肠和胰腺,从而促进肿瘤发生。然而,先前大多数关于十二指肠微生物组的研究主要纳入了胰头病变患者,这些患者常伴有胰胆管梗阻或置入支架,其微生物组的改变可能继发于梗阻本身,而非疾病。本研究的主要目的是比较无胰胆管梗阻的PDAC患者与匹配的健康对照之间,配对的口腔(唾液)和十二指肠(刷检)微生物组的差异。次要目的是探索口腔和十二指肠微生物组与患者总生存期(OS)的可能关联。
材料与方法
本研究为一项前瞻性观察性研究,经伦理委员会批准。患者组为初诊、未经任何治疗、临床影像学怀疑为PDAC并行首次诊断性超声内镜(EUS)检查的患者。排除标准包括已置入胆道或胰腺支架、EUS评估存在胰胆管梗阻、或最终细胞学报告为非PDAC肿瘤的患者。健康对照组(HC)为因任何原因接受胃镜检查的患者,排除有食管或胃切除史、已知胰腺疾病、萎缩性胃炎、乳糜泻或肿瘤性疾病的个体。所有参与者在内镜检查前采集血液样本,并排除肝功能异常者以避免混杂。HC按性别和年龄(±2岁)以1:1的比例与PDAC病例匹配。
在镇静和内镜检查前,收集参与者未刺激的唾液样本(4 mL)。十二指肠刷检样本在EUS或胃镜检查过程中,使用胃肠道细胞学刷在距主要乳头3 cm范围内的十二指肠壁进行刷取。所有样本均保存在稳定液中,并由同一实验室进行16S rRNA基因测序分析。微生物组成通过16S rRNA基因测序评估。α-多样性使用Faith‘s系统发育多样性(PD)、观察到的ASV数和Pielou‘s均匀度进行评估;β-多样性使用UniFrac、Bray–Curtis和基于距离的冗余分析(db-RDA)进行评估。使用Cox模型和ROC衍生截断值检验与总生存期的关联,并通过留一法交叉验证评估稳健性。研究进行了样本量计算,确保达到90%的统计效力。
结果
3.1 人口统计学和临床特征
最终分析人群包括24例无导管梗阻的PDAC患者和24例性别年龄匹配的HC,共计96份样本。如表1所示,与HC相比,PDAC组糖尿病患者和牙周炎患者的比例显著更高。其他可能影响微生物组成的因素,如吸烟、质子泵抑制剂(PPI)使用、抗生素、益生菌和漱口水使用,在两组间无显著差异。PDAC患者中,根据NCCN分期,2例(8%)可切除,4例(17%)临界可切除,12例(50%)局部晚期,6例(25%)诊断时已转移。
3.2 微生物组测序数据
对96份样本进行测序,平均每样本获得62,991条高质量序列,共组装出3868个ASV。稀疏曲线显示测序深度足以捕获潜在的微生物多样性。
3.3 十二指肠和唾液微生物组的α-多样性
与HC相比,PDAC患者十二指肠刷检样本的Faith‘s PD显著降低(q = 0.034),表明系统发育广度变窄。然而,丰富度(ASV数)和均匀度无显著差异。在唾液样本中,PDAC与HC之间的任何α-多样性指标均未显示显著差异。在PDAC样本内部,十二指肠刷检的α-多样性(Faith‘s PD和ASV数)显著低于配对的唾液样本。而在HC中,十二指肠与唾液样本的α-多样性无显著差异。Wilcoxon秩和检验的配对比较显示,无论在PDAC还是HC中,唾液的ASV丰富度均高于配对的十二指肠刷检样本,且PDAC组差异更大。
为探究已知影响微生物组的因素是否可解释上述差异,评估了吸烟、糖尿病和PPI使用的影响。在调整了糖尿病和牙周炎的多变量模型中,PDAC患者十二指肠样本较低的Faith‘s PD(q = 0.048)和ASV丰富度(q = 0.029)仍然显著。这表明观察到的PDAC患者十二指肠α-多样性降低并非由这些合并症解释。
3.4 PDAC与对照组唾液和十二指肠刷检样本的β-多样性差异
未加权UniFrac分析显示,在PDAC患者和HC中,十二指肠刷检与唾液样本之间存在显著差异。在同一采样部位(唾液或十二指肠)内部,PDAC与HC之间未观察到显著差异。加权UniFrac和Bray–Curtis相异度也显示了类似结果,即样本部位是β-多样性差异的主要驱动因素。在包含糖尿病、牙周炎和身体部位(唾液或十二指肠)作为协变量的db-RDA多变量模型中,PDAC状态与β-多样性显示出微小但统计学显著的关联(pseudo-F = 2.16, p = 0.002)。身体部位仍然是变异的主要来源。
3.5 区分PDAC患者与HC的微生物类群
差异丰度分析识别出区分组别的特定菌属。Proteobacteria门的 Aggregatibacter在HC的唾液和十二指肠刷检样本中更为丰富。相反,Bacillota门的 Solobacterium和 Stomatobaculum,以及Firmicutes门的 Selenomonas在PDAC患者的十二指肠刷检中比HC更丰富。Firmicutes门的 Megasphaera在PDAC患者的唾液和刷检样本中均更丰富。
3.6 α-多样性和属水平特征与PDAC生存期相关
在PDAC患者中,研究了微生物组特征与总生存期(OS)的关联。ROC分析显示,十二指肠样本的α-多样性预测能力有限。然而,当根据唾液α-多样性对患者进行分层时,较高的多样性在多变量分析(校正年龄和疾病分期后)中与更长的OS相关:Faith‘s PD(aHR = 0.18, p = 0.02)和ASV数(aHR = 0.17, p = 0.03)。留一法交叉验证(LOOCV)显示模型系数稳定,支持了该生存关联的稳健性。
此外,几个菌属在调整年龄和疾病分期后,仍与OS独立相关。在唾液中,较高丰度的 Fusobacterium和 Tannerella与更好的预后相关,而 Streptococcus和 Actinobacillus与更差的生存期相关。在十二指肠刷检中, Catonella在多变量模型中仍与改善的生存期显著相关。
讨论
据我们所知,本研究首次评估了无胰胆管梗阻PDAC患者与匹配对照的配对口腔和十二指肠微生物群。研究发现PDAC与十二指肠系统发育多样性降低相关,表明生态位变窄,且独立于胆汁或胰液流动。这种多样性降低在调整糖尿病和牙周炎后仍然存在。β-多样性主要由样本部位驱动,但多变量分析显示疾病状态对β-多样性有独立影响。研究识别出区分PDAC与HC的特定菌属,其变化模式与潜在的口腔-十二指肠微生物迁移途径相符。
有趣的是,微生物组特征也与PDAC患者的OS相关。唾液(而非十二指肠)较高的α-多样性与更长的OS相关。在属水平,一小部分类群与OS相关,提示特定菌属可能具有预后意义。例如,唾液 Streptococcus和 Actinobacillus丰度较高与死亡风险增加相关,而 Fusobacterium和 Tannerella则与更好结局相关。十二指肠中的 Catonella与改善的生存期相关。
本研究的优势包括允许个体内比较的配对分析、全面的多样性指标评估以及对潜在混杂因素的考量。局限性包括样本量较小、横断面设计以及16S测序在物种分辨率和功能洞察上的限制。十二指肠刷检采样可能存在污染,且缺乏阴性对照。
总之,本研究数据强调了在无导管梗阻的PDAC患者中存在变窄的十二指肠系统发育景观。虽然未显示出强烈的诊断作用,但探索性发现提示口腔微生物组可能的预后关联,并与口腔-十二指肠微生物途径的假说相符。需要更大规模、纵向和多组学研究来验证这些关联,并探索其机制和治疗意义。