TRADD、BIRC2、FLVCR1-AS1和MAGI2-AS3在非小细胞肺癌和小细胞肺癌中的表达及相关性分析:揭示亚型特异性长链非编码RNA(lncRNA)调控机制的见解

《Gene Reports》:Expression and correlation analysis of TRADD, BIRC2, FLVCR1-AS1, and MAGI2-AS3 in non-small cell and small cell lung cancer: Insights into subtype-specific lncRNA regulation

【字体: 时间:2026年02月21日 来源:Gene Reports 0.9

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  肺癌中TRADD、BIRC2、FLVCR1-AS1和MAGI2-AS3表达谱分析显示SCLC样本普遍下调,NSCLC表达水平低于SCLC但差异不显著,提示转录网络失调可能影响肺癌发生发展。

  
作者:Setareh Nasaji、Bashdar Mahmud Hussen、Naghme Nazer、Abolfazl Movafagh、Arezou Sayad、Arda Kiani
伊朗德黑兰沙希德·贝赫什提医科大学医学院医学遗传学系

摘要

背景

长链非编码RNA(lncRNAs)在肿瘤发生中起着关键作用,影响基因调控、细胞凋亡和免疫信号传导。肺癌包括非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC),具有广泛的转录异质性。然而,特定基因(如TRADDBIRC2FLVCR1-AS1MAGI2-AS3)在不同组织类型中的表达动态仍不明确。

方法

通过定量实时PCR技术测量了NSCLC、SCLC及相应非肿瘤肺组织中这四个基因的表达水平。使用ΔΔCt方法和Mann-Whitney U检验评估差异表达。构建相关矩阵以分析肿瘤样本和对照样本内的共表达模式。

结果

比较SCLC与非肿瘤肺组织时,所有分析的转录本均表现出表达下降的趋势。FLVCR1-AS1的下降最为显著(中位表达比=0.09,p=0.24),BIRC2也表现出下调趋势,且接近统计学显著性(比值=0.27,p=0.06)。TRADDMAGI2-AS3的变化较为温和,未达到统计学显著性。相关性分析显示,肿瘤组织和对照组织中的这些转录本之间存在正相关,但相关性强弱和一致性存在差异。

结论

与非肿瘤肺组织相比,TRADDBIRC2FLVCR1-AS1MAGI2-AS3在SCLC中通常下调,但NSCLC样本中的表达水平往往低于SCLC。尽管这些表达变化未达到统计学显著性,但持续的趋势和变化的共表达模式可能表明肺癌中转录网络的失调。为了全面理解这些发现的生物化学和临床意义,需要更大样本量的进一步研究。

引言

肺癌是全球癌症死亡的主要原因之一,其组织类型分为非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC),两者在生物学特性、治疗反应和预后方面存在显著差异(1)。尽管靶向治疗和免疫疗法有所进展,但由于诊断延迟、转移和治疗耐药性,总体5年生存率仍然较低(Li等人,2023年)。与蛋白质编码基因突变并行的是,非编码RNA(ncRNAs)的失调已成为肺癌发生中的关键分子改变(Ghafouri-Fard等人,2020b年)。
长链非编码RNA(lncRNAs)通常定义为长度超过200个核苷酸的转录本,它们缺乏或仅有微弱的蛋白质编码潜力。它们通过表观遗传重塑、染色质复合体构建、RNA-RNA或RNA-蛋白质相互作用以及竞争性内源性RNA(ceRNA)网络来调节基因表达(Ghafouri-Fard等人,2020b年;Hussen等人,2022年;Ghafouri-Fard等人,2021年)。在肺癌中,许多lncRNAs表现出高度的组织或肿瘤特异性表达模式,使其成为有潜力的诊断、预后或治疗生物标志物(Ghafouri-Fard等人,2020b年)。例如,lncRNA MALAT1是最早在肺癌中被发现的基因之一,它影响与转移相关的基因表达(Ghafouri-Fard等人,2020a年)。在这一领域,某些lncRNAs已被功能研究,如MALAT1是一种已明确功能的肿瘤抑制性lncRNA:其在NSCLC中经常下调,并通过miRNA海绵作用(例如miR-629-5p / TXNIP轴)和增强化疗敏感性(如顺铂)来调节肿瘤行为(Fan等人,2024年;Taheri等人,2023年);还有研究表明MAGI2-AS3通过靶向miR-629-5p/TXNIP轴抑制NSCLC进展(Gong等人,2021年)。其他研究显示,在肺癌模型中MAGI2-AS3的过表达通过miR-23a-3p/PTEN轴抑制增殖和侵袭(Xue等人,2021年)。在NSCLC患者样本中,MAGI2-AS3相对于邻近非肿瘤肺组织显著下调(Sui等人,2020年)。
FLVCR1-AS1由FLVCR1染色体位点转录,在肺癌研究中的关注度较低。研究表明FLVCR1-AS1通过海绵作用miR-573并上调E2F3来促进NSCLC的增殖和侵袭(Gao等人,2018年)。尽管存在局限性,这表明FLVCR1区域的转录本可能在肺癌生物学中具有功能作用,值得进一步研究FLVCR1-AS1的表达和调控机制。
细胞死亡和生存信号通路的关键调节因子由蛋白质编码基因BIRC2(含有杆状病毒IAP重复序列的2)和TRADD(肿瘤坏死因子受体1相关死亡结构域)编码。TRADD是一种适配蛋白,参与细胞凋亡和NF-κB通路的激活,介导TNF-R1等死亡受体的下游信号传导,并调节与癌症生物学相关的细胞命运决策。作为凋亡抑制蛋白(IAP)家族的成员,BIRC2(也称为细胞凋亡抑制蛋白1或cIAP1)抑制caspase激活,促进细胞存活,并调节NF-κB信号传导——这些过程与肿瘤发展和进展有关。这两个基因及其编码蛋白都与肺癌中的凋亡和促生存信号传导失调有关,IAP家族成员(包括BIRC2)的表达或功能改变已在非小细胞肺癌中观察到,这可能对预后和治疗具有重要意义(Liu等人,2021年)。
在本研究中,我们将量化并比较NSCLC和SCLC亚型中匹配的肿瘤组织和邻近非肿瘤组织中TRADDBIRC2FLVCR1-AS1MAGI2-AS3的表达水平。我们的目标是:(1)确定NSCLC、SCLC和非肿瘤肺组织之间不同的lncRNA表达特征;(2)评估这些转录本是否可作为亚型特异性生物标志物;(3)提出关于它们在肺癌发生中作用的机制假设。通过将这一研究置于“肺癌中的非编码RNA谱”框架内,我们希望为肺癌生物学中的lncRNAs提供描述性和功能性见解。

材料与方法

本研究共纳入48名肺癌患者,包括14例SCLC样本和34例NSCLC样本(14例腺癌,14例鳞状细胞癌,6例组织类型未知)。并非所有组织标本都有完整的病理报告;然而,记录了每位患者的基本临床和人口统计数据。尽管所有样本在采集时均被病理学确认为NSCLC、SCLC或非肿瘤肺组织,但

一般信息

表2显示了纳入病例的一般特征。

NSCLC样本与相应对照组的比较

本研究评估了NSCLC及其相应对照组样本中四个基因(TRADDBIRC2FLVCR1-AS1MAGI2-AS3)的表达水平,并按性别(男性和女性亚组)进行了进一步分层(图1)。所检测的基因在NSCLC与其相应对照组样本之间均未显示出统计学上的显著差异。
箱线图展示了四个基因(TRADDBIRC2等)的表达谱

讨论

在本研究中,我们评估了肺癌肿瘤组织和非肿瘤组织中TRADDBIRC2FLVCR1-AS1MAGI2-AS3的表达模式。尽管在不同比较中存在表达差异,但由于样本量小和效应量较小,大多数差异未达到统计学显著性。所有四个转录本在NSCLC中的中位表达水平均低于SCLC,但这些差异未得到统计学支持。
所有检测的转录本

结论

总之,我们对NSCLC、SCLC和非肿瘤肺组织中TRADDBIRC2FLVCR1-AS1MAGI2-AS3的表达进行了比较,发现表达存在轻微变化,但共表达模式的变化缺乏足够的统计学支持。与正常组织相比,所有分析的转录本在SCLC中均趋于下调,而NSCLC样本中的表达水平通常低于SCLC。肺癌发生过程中协调调控网络的破坏表明

作者贡献声明

Setareh Nasaji: 方法学、研究。Bashdar Mahmud Hussen: 方法学、研究。Naghme Nazer: 形式分析。Abolfazl Movafagh: 方法学、研究。Arezou Sayad: 编写——审稿与编辑、初稿撰写、验证、监督。Arda Kiani: 监督、方法学、研究。

出版同意

不适用。

伦理批准

所有方法均符合国家研究委员会的伦理指南以及1964年赫尔辛基宣言及其后续修订版。所有参与者均签署了知情同意书。研究方案已获得沙希德·贝赫什提医科大学伦理委员会的批准。

资金支持

无。

未引用参考文献

Lancet, 2025

利益冲突声明

作者声明没有利益冲突。

致谢

本研究得到了沙希德·贝赫什提医科大学的财政支持。
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