《Chinese Medical Journal》:Protective role of PCED1B-expressing naive CD4+ T cells in sepsis
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基于单细胞与批量转录组学,结合孟德尔随机化(MR)分析,本研究发现初始CD4+T细胞比例降低是脓毒症发生与28天死亡风险增加的重要因素。其中,PC-酯酶域包含蛋白1B(PCED1B)是关键中介基因,其表达上调与降低脓毒症死亡风险存在强因果关联(OR=0.64, P<0.001)。实验验证表明,PCED1B+初始CD4+T细胞可通过MIF-(CD74+CD44/CXCR4)轴与免疫细胞互作,并调节脓毒症中的多种代谢途径,为开发新的免疫治疗策略提供了潜在靶点。
背景
脓毒症是由感染引发的、危及生命的器官功能障碍,是全球健康面临的重大挑战,发病率和死亡率居高不下。由于其病理生理机制复杂,早期诊断和治疗面临困难。免疫失调在脓毒症发展中扮演着关键角色,而T细胞,特别是初始CD4+T细胞的耗竭与脓毒症的免疫抑制状态密切相关。然而,其中具体的分子机制和因果关联尚不完全明确。本研究旨在通过整合多组学数据和多方法学分析,鉴定可用于脓毒症诊疗的有效生物标志物和治疗靶点。
方法
本研究采用了一种综合性的研究策略。首先,利用公开的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序数据,分析了健康对照与脓毒症患者外周血中的免疫细胞图谱,特别关注了初始CD4+T细胞的比例变化,并鉴定了与之相关的枢纽基因。随后,应用孟德尔随机化(MR)分析及MR-贝叶斯模型平均(MR-BMA)算法,探究了这些枢纽基因与脓毒症发生及预后的因果关系。为了验证和深入探索潜在靶点的作用机制,研究还进行了单细胞类型表达分析、细胞间通讯检测、代谢组学评估,并收集临床样本,结合体内(小鼠盲肠结扎穿孔[CLP]模型)和体外实验进行研究。
结果
单细胞转录组分析揭示,与健康对照相比,脓毒症患者外周血中初始CD4+T细胞显著减少。通过整合分析,研究从初始CD4+T细胞中鉴定出33个关键基因。MR分析证实,初始CD4+T细胞在总CD4+T细胞中的比例升高,与脓毒症发生风险(OR=0.90)及脓毒症相关28天死亡风险(OR=0.75)的降低存在因果关联。在这33个基因中,PC-酯酶域包含蛋白1B(PCED1B)基因的表达与脓毒症28天死亡率存在极强的负向因果关联(OR=0.64, P<0.001)。批量RNA测序数据进一步验证了PCED1B在脓毒症患者中的表达下调,且高表达PCED1B的患者生存期更长。中介分析表明,PCED1B介导了初始CD4+T细胞比例对脓毒症死亡风险的保护作用。
临床样本和动物实验验证了PCED1B在脓毒症患者和小鼠的初始CD4+T细胞中表达上调。机制研究显示,表达PCED1B的初始CD4+T细胞(PCED1B+CD4+T细胞)与不表达的细胞(PCED1B-CD4+T细胞)在功能和互作上存在显著差异。PCED1B+细胞主要通过巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)信号通路与单核/树突状细胞(通过MIF–[CD74+CD44]轴)以及B细胞/浆母细胞(通过MIF–[CD74+CXCR4]轴)发生强相互作用。代谢分析发现,PCED1B+细胞显著富集于嘌呤代谢、丙酸代谢、N-聚糖生物合成、甘油磷脂代谢及谷胱甘肽代谢等通路。体外实验发现,过表达PCED1B会改变炎症因子白细胞介素-6(IL-6)和白细胞介素-10(IL-10)的表达模式。
讨论
本研究通过多组学整合分析,首次系统揭示了初始CD4+T细胞在脓毒症中的保护作用,并鉴定出PCED1B是关键的功能介质。PCED1B+初始CD4+T细胞通过MIF通路与固有免疫和适应性免疫细胞进行广泛通讯,并影响脓毒症中的多个关键代谢过程,这可能是其发挥保护作用的潜在机制。PCED1B作为一种新的、与脓毒症预后强相关的生物标志物,为未来开发基于T细胞的免疫疗法或靶向PCED1B的治疗策略提供了新的思路和潜在靶点。
结论
本研究阐明了PCED1B与初始CD4+T细胞在脓毒症中的相互作用网络,证实了PCED1B在脓毒症中的保护性角色及其作为预后生物标志物的潜力。这些发现为深入理解脓毒症的免疫病理机制,以及开发针对性的免疫治疗新策略奠定了重要的理论基础。