《Transboundary and Emerging Diseases》：Detection of Multiple Microorganisms in Ruminant Ticks in Senegal Using High-Throughput Microfluidic Real-Time PCR
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本综述首次在塞内加尔应用高通量微流控实时PCR技术，系统调查了从牛、绵羊和山羊体表采集的蜱中携带的病原体与内共生体。研究揭示了蜱传病原体（TBPs）的多样性和高感染率（78.9%），并发现了包括Anaplasma ovis在内的多种具有兽医和/或人畜共患重要性的病原体。该研究强调了蜱内共感染（33.2%）的普遍性以及FLE等内共生体的广泛存在，为理解当地蜱传病（TBDs）流行病学及制定监测策略提供了关键分子依据。
研究背景与意义
蜱是多种医学和兽医学重要病原体的传播媒介，它们传播的蜱传病（TBDs）对全球公共卫生和动物健康构成重大负担。在塞内加尔等西非地区，由于诊断工具有限、数据缺乏，反刍动物相关蜱中蜱传病原体（TBPs）的多样性和流行情况仍知之甚少。传统的检测方法如显微镜检查和靶向PCR，其敏感性和通量有限，难以全面评估病原体谱系。本研究首次在塞内加尔应用高通量微流控实时PCR系统，对来自三个生态区的反刍动物蜱进行大规模筛查，旨在揭示TBPs的多样性、分布及其与生态、宿主因素的关系。
材料与方法
研究于2023年在塞内加尔的萨赫勒、苏丹-萨赫勒和苏丹三个生物气候区进行，从牛、绵羊和山羊体表手动采集了1703只蜱。通过形态学鉴定蜱种后，随机选取300只个体，使用高通量微流控实时PCR系统对36种微生物进行筛查。DNA提取后进行了预扩增以增强灵敏度，并在BioMark 48.48动态阵列芯片上进行检测。阳性结果通过标准/巢式PCR和测序进行确认。统计分析采用多变量逻辑回归等方法，以评估TBPs/内共生体存在与地理区域、宿主种类、蜱种及性别等因素的关联。
研究结果
蜱种多样性与分布
在筛查的300只蜱中，成功从289只中提取并扩增了DNA。优势蜱种包括 Rhipicephalus evertsi evertsi（32.3%）、 Hyalomma truncatum（19.6%）、 R. guilhoni（15.6%）、 H. rufipes（11.6%）和 Amblyomma variegatum（11.0%）。
病原体与内共生体检出概况
在289只蜱中，226只（78.9%）至少对一种微生物呈阳性。共检出9种微生物。具有兽医和/或人畜共患重要性的病原体包括：Anaplasma ovis（30.8%）、Coxiella spp.（23.9%）、Rickettsia aeschlimannii（13.1%）、Theileria spp.（11.1%）和 Ehrlichia canis（4.8%）。此外，非致病的弗朗西斯菌样内共生体（FLEs）在所有生态区均有高检出率（37.4%）。Anaplasma marginale、 A. bovis 和 Babesia spp. 的检出率均很低（各0.3%）。
感染影响因素分析
多变量逻辑回归模型显示，TBPs和/或内共生体的存在仅与蜱的宿主显著相关。与从牛（参考组）采集的蜱相比，从山羊（OR = 7.82）和绵羊（OR = 7.70）采集的蜱被感染的可能性显著更高。未发现检出的微生物种类与蜱性别有显著关联。
共感染情况
共记录了96例不同蜱种中的微生物共现情况。共感染在从苏丹-萨赫勒区采集的蜱（48.2%）和从绵羊采集的蜱（32.0%）中更为频繁。最常见的共感染组合是 R. aeschlimannii + FLE，占所有共感染病例的19.9%。Coxiella spp. 是最常参与共感染的微生物，出现在45.3%的共感染病例中。
讨论与结论
本研究代表了塞内加尔首次对反刍动物相关蜱中TBPs进行的大规模分子调查，揭示了病原体的高度多样性和蜱内共生体的广泛存在。研究发现宿主种类是影响蜱携带微生物的关键因素，小型反刍动物（山羊和绵羊）相关的蜱感染风险显著更高。内共生体（如FLEs）虽然已知无致病性，但其高丰度可能影响蜱的生理和媒介能力。人畜共患病原体（如 E. canis 和 R. aeschlimannii）的检出，凸显了加强蜱监测并研究其潜在公共卫生影响的必要性。33.2%的高共感染率表明蜱同时携带多种微生物的情况很普遍，这可能加剧疾病严重程度或导致非典型临床症状，从而使得诊断和治疗复杂化。本研究采用的高通量技术为资源有限地区开展综合性病原体监测提供了高效工具，其结果将有助于更好地理解塞内加尔乃至西非地区蜱传病的流行病学，为制定有效的防控策略提供科学依据。
