基于生物地球化学模型与机器学习算法的整合,量化气候和水稻物候变化对土壤有机碳(SOC)动态的贡献

《Computers and Electronics in Agriculture》:Quantifying contributions of climate and rice phenological changes to SOC dynamics based on the integration of biogeochemical model and machine learning algorithm

【字体: 时间:2026年02月22日 来源:Computers and Electronics in Agriculture 8.9

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  土壤有机碳(SOC)时空变化驱动机制研究。基于福建沿海多海拔水田数据,整合随机森林(RF)与DNDC模型,显著提升SOC预测精度(空间外推R2+17.97%,时间外推+50.00%)。量化分析表明:气候与物候协同作用主导SOC动态(贡献比>农业管理),其中物候影响更显著(贡献比64.2%),且存在海拔依赖性驱动差异(高海拔农业管理主导,中高海拔物候主导,低海拔气候主导)。研究成果为精准碳汇管理提供科学依据。

  
吴婷|李志强|钱秀丽|毕学才|陈静怡|王思睿|邢世和|张丽明
福建省土壤环境健康与调控重点实验室,福建农林大学资源与环境学院,中国福建省福州市350002

摘要

耕地中的土壤有机碳(SOC)动态受到气候和作物物候的影响,但对其贡献进行空间明确的量化在方法上一直具有挑战性。为了解决这一难题,我们的研究开发了一种新的集成框架,将随机森林(RF)算法与反硝化-分解(DNDC)模型相结合,以提高SOC动态预测的准确性。我们将这种方法应用于模拟中国福建省东南沿海稻田SOC的时空变化,并通过独立的空间和时间外推测试严格验证了结果。结果显示,集成RF-DNDC模型显著提高了SOC预测的准确性,在空间外推中R2提高了17.97%(95%置信区间:16.94–19.00%),在时间外推中提高了50.00%(95%置信区间:48.97–51.01%),这证明了其在基于情景的预测中的稳健性。2008年至2021年间,75.2%的稻田表现为碳汇,主要位于较高海拔地区,而24.8%的稻田表现为碳源,主要位于较低海拔地区。利用这些稳健的模拟结果,我们通过基于线性回归的因子分析量化了气候和作物物候因素对SOC动态的相对贡献。研究结果表明:(1)气候和物候变化的影响大于农业管理;(2)物候变化的影响大于气候变化;(3)前期气候因素的影响通常大于中期气候因素。一个关键的新发现是海拔依赖性的驱动因素:在最高海拔地区,农业管理的影响最大;在中等至高海拔地区,作物物候的影响最大;在较低海拔地区,气候变化的影响最大。本研究提供了一种可转移的方法论,用于区分复杂的SOC驱动因素,并提供了一个基于科学的、空间适应性强的框架,以针对碳管理实践,使研究人员和土地管理者能够根据当地海拔和主要驱动因素优先考虑干预措施,从而在持续的全球变暖背景下最大化碳封存。

引言

土壤有机碳(SOC)与土壤渗透性、团聚体稳定性、侵蚀性以及水分和养分保持能力密切相关。增加SOC含量可以提高耕地质量和作物产量(Lal, 2004)。特别是稻田,具有显著的碳封存潜力,有助于缓解气候变化(Clark et al., 2020)。分析稻田SOC动态的空间分布和驱动因素为改善土壤施肥和作物生产力提供了基础,同时也支持了农田碳封存策略的发展。
气候是农田中SOC最重要的自然驱动因素。它在调节植物生长(决定土壤碳输入)和微生物活动(驱动土壤碳分解)方面起着至关重要的作用(Shen et al., 2023)。许多研究报道,在气候变化背景下SOC发生了显著变化(Garcia-Franco et al., 2024, Wang et al., 2022, Yang et al., 2023)。Giannitsopoulos等人(2025)预测,在RCP4.5和RCP8.5情景下,2020年至2100年间碳损失为1.02–1.18吨碳/公顷/年。Paramesha等人(2025)发现,气候变化减少了菠萝单作中的SOC,但增加了椰子-菠萝间作中的SOC。然而,这些研究仅记录了气候变化下多种因素共同作用下的SOC变化,而没有明确量化气候变化相对于其他因素的贡献。此外,温度和降水的季节性变化导致土壤呼吸速率及其温度敏感性呈现季节性模式(Schnecker et al., 2023)。这些季节性动态也反映在SOC上,研究表明夏季(或生长季节)的SOC含量高于冬季(或非生长季节)(Chen et al., 2023, Wang et al., 2022)。鉴于这些观察到的模式,可以合理预期气候变化对SOC的影响也会随季节变化。尽管已经认识到季节性气候对SOC的影响(Hoffmann et al., 2018),但在当前研究中这些影响仍然缺乏足够的量化和理解。
植被生长通过向表层土壤(通过落叶)和地下土壤(通过根系生长、更新和分泌物)输送碳来促进SOC的封存。作为植被生长状态的关键指标,物候学捕捉了关键生长阶段的时间和持续时间,从而影响光合作用的持续时间和强度,进而影响碳交换(Cicuéndez et al., 2020)。鉴于这种关系,数字土壤制图研究人员越来越多地结合物候参数以提高SOC预测的准确性。例如,Yang等人(2024年)、He等人(2021年)和Yang等人(2021年)分别报告R2提高了36%、171%和31.29%,证实了物候学在捕捉SOC空间变异性方面的价值。由于SOC空间模式的驱动因素也影响其时间动态(Minasny et al., 2013),作物物候也可能有助于描述SOC随时间的变化(Tao et al., 2020, Venter et al., 2021)。然而,很少有研究在区域尺度上定量评估作物物候对SOC时间模式的影响。物候学调节作物对气候的响应,并影响碳循环(Paramesha et al., 2025)。生长季节开始时间和长度的变化可以通过改变地上和地下生物量生产来减轻或放大气候变化对SOC的不利影响(Zepp et al., 2023)。在某些情况下,气候变化的间接效应(通过物候学)可能超过直接效应(Tao et al., 2020)。以往的研究(Attia et al., 2021, Debnath et al., 2020, Guo et al., 2021, Jiang et al., 2022)主要关注作物物候对气候变化的响应如何影响植物碳储量(如产量和初级生产力),而忽略了它们对土壤碳库的直接影响。解决这一差距对于推进全球气候变化情景下的SOC动态研究至关重要。
数字土壤制图已成为分析景观尺度SOC动态的强大工具。由于各种机器学习算法能够模拟SOC与其影响因素之间的复杂非线性关系,因此在该领域被广泛使用(Adeniyi et al., 2024, Ugbaje et al., 2024, Yang et al., 2024)(先前研究的总结见补充表S1)。这些方法大致分为深度学习方法和集成方法。深度学习模型,包括卷积神经网络(CNN)(Mishra et al., 2025)和长短期记忆(LSTM)网络(Eid et al., 2022, He et al., 2024),在从原始数据中自动学习层次化空间和时间特征方面表现出色。然而,它们的优势被高计算需求、大量数据要求和有限的可解释性所抵消,往往使它们成为“黑箱”。相比之下,集成方法如随机森林(RF)(Ho et al., 2025)和极端梯度提升(XGBoost)(Li et al., 2025b)提供了稳健的替代方案。RF因其对抗过拟合的稳健性和提供变量重要性度量而受到重视,从而增强了模型的可解释性。XGBoost在实现顶级预测准确性和计算效率的同时,需要更细致的超参数调整来优化性能并减轻过拟合。传统的土壤制图方法通过空间外推这些关系来预测SOC,将输出限制在离散观测时间点的空间分布上。相比之下,时空数字土壤制图通过结合动态变量(如气候、土地利用和植被生长)来扩展这一框架,从而实现时间外推(Minasny et al., 2013)。这一进展使得即使在缺乏直接观测的时期也能分析长期SOC变化驱动因素(Heuvelink et al., 2021, Li et al., 2022c, Szatmári et al., 2024, Ugbaje et al., 2024)。然而,作为一种纯粹的数据驱动方法,时空数字土壤制图往往未能结合土壤学知识,导致SOC时间序列具有过大的年际波动(Zhang et al., 2023)和时间不确定性(Heuvelink et al., 2021)。整合像反硝化-分解(DNDC)这样的过程模型,可以模拟生物地球化学过程(Hendriks et al., 2020),在提高时间准确性方面显示出潜力(Xie et al., 2022, Zhang et al., 2024, Zhang et al., 2023),尽管仍需进一步验证这种混合方法。
本研究通过开发一种新的集成RF-DNDC框架,改进了现有的SOC建模工作,解决了现有研究中的关键限制。在这一方法论基础上,我们的方法引入了两个主要的科学创新:首先,它建立了一种稳健的方法来分离和量化气候变化和作物物候对SOC动态的影响;其次,它能够明确量化气候对SOC影响的季节性差异。选择中国福建省东南沿海地区作为研究区域,是因为该地区具有显著的地形异质性,为研究海拔依赖性的SOC动态提供了理想的试验场。本研究有三个主要目标:(1)通过模型集成提高SOC时空变化预测的准确性,与单独模型相比,目标是将R2的可测量增加;(2)分别量化气候变化和水稻物候响应对SOC动态的影响;(3)比较前期与中期气候因素的相对贡献,从而明确揭示气候影响的季节性差异。结果将增强对气候变化对SOC动态影响的理解,并为应对气候变暖的稻田土壤质量管理提供决策支持。

研究区域

研究区域

研究区域位于中国福建省东南沿海地区(23°36′–25°50′N, 116°56′–119°47′E)(图1a)。本研究关注的是2008年至2021年间未发生变化的稻田,总面积约为1800平方公里。地形包括山区(>500米,22.81%)、丘陵(200–300米,19.81%)和平原(<200米,57.38%)。该地区的气候属于南亚热带季风类型,年平均温度约为20.0℃

不同样本集中稻田SOC的描述性统计

训练集和测试集之间的SOC统计分布存在显著差异(表2)。训练集的变异性较大,范围从0.25到6.89公斤/平方米,平均值为3.36公斤/平方米。相比之下,测试集的范围较窄,为1.62–5.45公斤/平方米,平均值略高,为3.73公斤/平方米。变异系数(CV)分析显示了不同的分散模式,训练集显示出中等

RF-DNDC集成模型的性能

在评估的三种机器学习模型(RF、XGBoost、ANN)中,RF模型实现了最高的SOC预测准确性。这一结果与我们在福建农田上的早期研究(Wu et al., 2023)以及更广泛的文献一致,这些文献报告RF在各种生态系统中的强大表现(Kumar et al., 2023, Rado?aj et al., 2024)。RF的优势在于其集成设计,它利用自助聚合和随机特征选择有效减轻了过拟合

意义和局限性

应承认由于数据获取限制而产生的不可避免的不确定性。一个主要的不确定性来源是使用了250米的MODIS EVI图像,这可能会由于混合像素效应而掩盖稻田的细尺度异质性。在我们的研究区域,特别是在关键水稻生长阶段持续云层覆盖的情况下,这个问题尤为明显。这些限制降低了水稻物候参数提取的准确性,从而降低了

结论

本研究开发了一个集成的RF-DNDC建模框架,用于量化气候和水稻物候对稻田SOC动态的贡献。主要发现如下:(1)与单独的RF模型相比,集成RF-DNDC模型显著提高了SOC预测的准确性,在空间外推中R2提高了17.97%,在时间外推中提高了50.00%;(2)定量因子分析显示,水稻物候变化,包括水稻

作者贡献

吴婷设计了研究,分析了数据并撰写了手稿。李志强进行了实验并撰写了方法论部分。钱秀丽收集和整理了数据。毕学才和陈静怡收集了数据。王思睿审阅和编辑了手稿。邢世和提供了数据并提供了财务支持。张丽明审阅和编辑了手稿。

资助

本研究得到了中国福建省自然科学基金(编号2025J01581, 2024J01412)和福建农林大学科技创新基金项目(编号KFb22074XA, KFb23195A, KFb24117A)的支持。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的竞争性财务利益或个人关系,这些关系可能会影响本文报告的工作。

致谢

本研究得到了中国福建省自然科学基金(编号2025J01581, 2024J01412)和福建农林大学科技创新基金项目(编号KFb22074XA, KFb23195A, KFb24117A)的财务支持。
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