《Rice》：Evaluating Blast Resistance of Huang-Huai Geng/Japonica Varieties Using Intragenic Markers
编辑推荐：
黄淮稻区粳稻/籼稻（GJ）品种 blast 抗性遗传改良研究，通过单倍型分析鉴定26个抗性基因座独特变异，建立24基因座内源标记（含35新开发标记），分析130个品种发现BRG8和PICI1基因型固定，Pi64等8基因未携带，Pi35等7基因少部分携带。评估96品种抗性，Shengdao 138表现突出，Pizt、Pid3、Pid2基因贡献部分抗性，成果为GJ品种遗传改良提供工具和资源。
摘要
黄淮稻区是中国第二大优质粳稻（GJ）生产区。通过抗性基因来提高水稻品种的抗稻瘟病能力是减少稻瘟病（由Magnaporthe oryzae引起）造成的损失最有效、最经济且最环保的方法。尽管已经克隆了许多抗性基因，但抗稻瘟病能力的提升进展缓慢。为了促进抗稻瘟病的遗传改良，我们利用40个具有高质量基因组序列的水稻样本对26个抗稻瘟病位点进行了单倍型分析，并确定了每个功能基因的独特变异。基于这些独特变异，我们为24个基因组位点提供了一组基因内标记，其中包括35个新开发的标记和7个先前研究中报道过的标记。随后，我们对黄淮地区批准的130个粳稻品种进行了抗性基因的基因分型，发现两个基因BRG8和PICI1的功能类型在所有粳稻品种中都是固定的，而另外八个基因Pi64、bsr-d1、Pi21、ROD1、Pi2、Pi9、Pi36和Pb2的功能类型则没有被任何粳稻品种携带。此外，七个基因Pi35、Pigm、Pid4、Pik、Pikm、Piks和Pijx的功能类型仅被少数品种或极少数品种携带。最后，我们评估了96个粳稻品种对六种代表性稻瘟病菌株混合菌系的穗部抗性，结果显示大多数品种具有较高的易感性，而‘Shengdao 138’品种表现出最高的抗性。对测试粳稻品种的抗性基因和穗部抗性分析表明，Pizt、Pid3和Pid2基因有助于部分抗性的形成。总体而言，本研究为24个抗稻瘟病位点提供了一组基因内标记，清晰地揭示了黄淮粳稻品种所携带的抗性基因，并确定了具有高穗部抗性的‘Shengdao 138’品种，这些成果对于黄淮稻区乃至全球其他稻区的粳稻品种遗传改良具有重要意义。
黄淮稻区是中国第二大优质粳稻（GJ）生产区。通过抗性基因来提高水稻品种的抗稻瘟病能力是减少稻瘟病（由Magnaporthe oryzae引起）造成的损失最有效、最经济且最环保的方法。尽管已经克隆了许多抗性基因，但抗稻瘟病能力的提升进展缓慢。为了促进抗稻瘟病的遗传改良，我们利用40个具有高质量基因组序列的水稻样本对26个抗稻瘟病位点进行了单倍型分析，并确定了每个功能基因的独特变异。基于这些独特变异，我们为24个基因组位点提供了一组基因内标记，其中包括35个新开发的标记和7个先前研究中报道过的标记。随后，我们对黄淮地区批准的130个粳稻品种进行了抗性基因的基因分型，发现两个基因BRG8和PICI1的功能类型在所有粳稻品种中都是固定的，而另外八个基因Pi64、bsr-d1、Pi21、ROD1、Pi2、Pi9、Pi36和Pb2的功能类型则没有被任何粳稻品种携带。此外，七个基因Pi35、Pigm、Pid4、Pik、Pikm、Piks和Pijx的功能类型仅被少数品种或极少数品种携带。最后，我们评估了96个粳稻品种对六种代表性稻瘟病菌株混合菌系的穗部抗性，结果显示大多数品种具有较高的易感性，而‘Shengdao 138’品种表现出最高的抗性。对测试粳稻品种的抗性基因和穗部抗性分析表明，Pizt、Pid3和Pid2基因有助于部分抗性的形成。总体而言，本研究为24个抗稻瘟病位点提供了一组基因内标记，清晰地揭示了黄淮粳稻品种所携带的抗性基因，并确定了具有高穗部抗性的‘Shengdao 138’品种，这些成果对于黄淮稻区乃至全球其他稻区的粳稻品种遗传改良具有重要意义。
