西伯利亚西南部与人类共同生活的鸟类中的病毒多样性

《Archives of Virology》：Viral diversity in synanthropic birds of Southwestern Siberia

禽类感染性疾病对畜牧业、野生动物多样性和公共卫生构成威胁，需通过One Health框架加强监测。西伯利亚南部杂食鸟类中检测到冠状病毒（Deltacoronavirus属）和astro病毒，但未发现流感病毒或副粘病毒。系统发育分析显示冠状病毒与北西伯利亚毒株形成独立谱系，astro病毒则与哈萨克斯坦和中国毒株存在亲缘关系，表明该区域作为候鸟迁徙中转站具有病毒多样性特征。监测中需重视此类鸟类作为病毒宿主的桥梁作用。

　　

摘要

鸟类的传染病对家禽经济、野生鸟类生物多样性和公共卫生构成了重大威胁，这凸显了在“同一健康”框架下开展监测工作的重要性。与人类和家养动物密切接触的共生鸟类可能成为病毒在野生种群和家养种群之间传播的关键媒介。本研究旨在评估西西伯利亚南部共生鸟类中四种主要病毒科（正粘病毒科、副粘病毒科、冠状病毒科和星状病毒科）的流行率和多样性。通过分子检测方法，我们发现了禽冠状病毒（ACoV）和禽星状病毒（AAstV），但未检测到禽流感病毒（AIV）或禽副粘病毒（APMV）。总体而言，3.8%的鸟类样本至少对其中一种病毒呈阳性反应，其中1.4%的样本检测出ACoV，2.4%的样本检测出AAstV。系统发育分析表明，所检测到的冠状病毒属于德尔塔冠状病毒属（Deltacoronavirus），并与之前在西伯利亚北部发现的一种病毒形成了一个独特的进化支，表明该地区存在一个稳定的、与鸦科鸟类相关的病毒谱系。所检测到的星状病毒具有高度多样性，属于一个未分类的雀形目相关星状病毒群体，其基因谱系与哈萨克斯坦和中国的病毒存在关联，这反映了该地区作为鸟类迁徙枢纽的地位。AIV和APMV的缺失可能反映了采样时的低流行率，或者是由宿主特异性因素（如低易感性或免疫能力不足）导致的病毒复制受到抑制。这些发现表明，这一关键生态区域的共生鸟类携带了新型且多样的病毒，它们是扩展我们对病毒多样性认识的重要研究对象，尽管常常被忽视。